MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 3

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017922	GGGCGC	2	12	1910	1921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017922	GGCGCT	2	12	4114	4125	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017922	CGCGGT	2	12	12007	12018	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017922	CATCGC	2	12	15540	15551	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017922	GATTCG	2	12	18895	18906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017922	ACCACG	2	12	21882	21893	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017922	CCATAT	2	12	23433	23444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017922	CAGGGG	2	12	25564	25575	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017922	GGGGCG	2	12	31439	31450	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017922	ACAGCG	2	12	32052	32063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017922	CGCGAC	2	12	49089	49100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017922	CCCGGC	2	12	56579	56590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017922	CGGGAT	2	12	68694	68705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017922	TGCGGA	2	12	68757	68768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017922	GACGTT	2	12	94197	94208	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017922	CGGCCG	2	12	94307	94318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017922	AGTCGA	2	12	145400	145411	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017922	GCGCTC	2	12	160927	160938	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017922	TCACGG	2	12	163863	163874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017922	CGATGC	2	12	177468	177479	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017922	GCGTCA	2	12	179402	179413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017922	TGGCCG	2	12	181757	181768	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017922	GCGGCA	3	18	211546	211563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017922	CCGCAA	2	12	271148	271159	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017922	GCCCGC	2	12	272541	272552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017922	ACACGC	2	12	276388	276399	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017922	CCGAAG	4	24	335739	335762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017922	CCGATG	2	12	335763	335774	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017922	CCGAAG	3	18	335775	335792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017922	GCCGAT	4	24	335816	335839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017922	GCCGAA	7	42	335840	335881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017922	GATGCC	5	30	335885	335914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017922	CCGACA	10	60	335919	335978	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017922	GGGCCG	2	12	349154	349165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017922	AGGCGC	2	12	386794	386805	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017922	GGACGA	2	12	388829	388840	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017922	GCTCCG	2	12	481639	481650	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017922	CGACAG	2	12	492913	492924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017922	CGAGCG	2	12	498588	498599	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017922	AGCATC	2	12	517734	517745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017922	CGCGCT	2	12	526127	526138	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017922	GAACGA	2	12	530268	530279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017922	ATGCTC	2	12	544071	544082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017922	GCCGAT	2	12	628805	628816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017922	CCTGCG	2	12	672008	672019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017922	CCAGCA	2	12	672260	672271	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017922	CGTCGC	2	12	673348	673359	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017922	CGCTCG	2	12	696548	696559	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017922	CGATGC	2	12	707525	707536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017922	CACCGC	2	12	737346	737357	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017922	GCGGGA	2	12	760425	760436	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017922	GGTGGG	2	12	770229	770240	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017922	GCATGC	2	12	839117	839128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017922	GCCCGT	2	12	839152	839163	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017922	AGCGCC	2	12	839306	839317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017922	TCGACA	2	12	844800	844811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017922	TCGCGC	2	12	863996	864007	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017922	CGCCCG	2	12	886025	886036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017922	CGCGCC	2	12	892461	892472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017922	CGTTTT	2	12	904278	904289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017922	TGCCGA	2	12	922292	922303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017922	ACGCTG	2	12	924256	924267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017922	GCGTCG	2	12	933241	933252	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017922	CGGCGA	2	12	942510	942521	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017922	ACGATG	2	12	973283	973294	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017922	CGCTGA	2	12	983223	983234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017922	ATGCGA	2	12	992919	992930	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017922	CGGCCG	2	12	993062	993073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017922	TCGGCG	2	12	997109	997120	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017922	TCGCCC	2	12	997337	997348	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017922	GGCCGG	2	12	999029	999040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017922	CACTCG	2	12	1000204	1000215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017922	CGAAGC	2	12	1015315	1015326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017922	CGACGC	2	12	1046666	1046677	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017922	CGAGCG	2	12	1049034	1049045	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017922	GCCACC	2	12	1049057	1049068	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017922	GCCGCG	2	12	1056112	1056123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017922	GATCAG	2	12	1056156	1056167	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017922	GTCGGT	2	12	1056618	1056629	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017922	GAAACG	2	12	1059464	1059475	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017922	GCCGGT	2	12	1066216	1066227	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017922	ACGCGC	2	12	1076344	1076355	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.