MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 2

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017921	ACCGGC	2	12	8621	8632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017921	CGCGAT	2	12	21799	21810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017921	CATCGC	2	12	37896	37907	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017921	GTCGCG	2	12	53630	53641	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017921	CGACCA	2	12	54006	54017	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017921	AGCGGC	2	12	60888	60899	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017921	GCGGTG	2	12	66306	66317	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017921	TAGGCA	2	12	68033	68044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017921	GCTTCG	2	12	145108	145119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017921	CCCGCG	2	12	146761	146772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017921	CAGAGC	2	12	157434	157445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017921	CCATCC	2	12	157494	157505	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017921	GCGGCC	2	12	164262	164273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017921	GCCGAT	2	12	165299	165310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017921	CGCGCA	2	12	186274	186285	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017921	GCGATC	2	12	186335	186346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017921	GCTCGA	2	12	186465	186476	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017921	CGCGAT	2	12	186619	186630	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017921	ACCTCG	2	12	193088	193099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017921	TGCCGC	2	12	203692	203703	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017921	GCCGCG	2	12	214834	214845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017921	ACCGGC	2	12	219540	219551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017921	CAAAAA	2	12	224455	224466	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017921	GACGCC	2	12	248842	248853	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017921	GCGCAA	2	12	284119	284130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017921	CTTCCC	2	12	286763	286774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017921	GCCGCG	2	12	295608	295619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017921	ATGCAC	2	12	333569	333580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017921	AACGGC	2	12	371117	371128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017921	CGACGC	2	12	371184	371195	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017921	TGCCCG	2	12	381298	381309	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017921	TGCCGA	3	18	385535	385552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017921	CCGGCC	2	12	454643	454654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017921	ACCGGC	2	12	460649	460660	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017921	GCGTTG	5	30	474489	474518	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017921	CGCGCA	2	12	476040	476051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017921	GAACAC	2	12	488940	488951	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017921	CAAGCA	2	12	498505	498516	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017921	TCGAGG	2	12	499098	499109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017921	AGCCAA	2	12	500288	500299	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017921	CATCCC	2	12	503526	503537	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017921	TTTTTC	2	12	513018	513029	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017921	GAGGCA	2	12	563363	563374	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017921	ATATTT	2	12	574948	574959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017921	CGCATG	2	12	596699	596710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017921	GCGCTC	2	12	597086	597097	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017921	GGCGAT	2	12	604244	604255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017921	GAGATG	2	12	606949	606960	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017921	ACCGCC	2	12	607626	607637	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017921	CACCGC	3	18	607644	607661	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017921	CCGCGG	2	12	626730	626741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017921	CCGCTG	2	12	636925	636936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017921	CCGCTA	2	12	636937	636948	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017921	CGCCTC	6	36	636950	636985	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017921	CGCGTG	2	12	670387	670398	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017921	GGCGTT	2	12	690876	690887	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017921	GCACCA	2	12	690907	690918	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017921	GCGGAG	2	12	700781	700792	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017921	GTTCAA	2	12	722219	722230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017921	GTGCGG	2	12	725531	725542	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017921	TTCGGC	2	12	726835	726846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017921	GTTGGC	2	12	743904	743915	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017921	TTATCG	2	12	752718	752729	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017921	ATGCGC	2	12	774772	774783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017921	TTCGCC	2	12	789460	789471	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017921	CAGCAC	2	12	813828	813839	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017921	GACGGC	2	12	814259	814270	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017921	CGGCGA	2	12	826297	826308	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017921	GCTTCG	2	12	876056	876067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017921	CGTCGC	2	12	876069	876080	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017921	GCACCG	2	12	876790	876801	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017921	CCCGCA	2	12	876826	876837	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017921	GCGCCC	2	12	876859	876870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017921	CGATAT	2	12	885800	885811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017921	CGCCTG	2	12	914411	914422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017921	CGAAGT	2	12	972771	972782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017921	GGGGTG	2	12	975546	975557	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017921	AACGGG	2	12	995248	995259	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017921	GGCTGC	3	18	998068	998085	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017921	CGATAC	2	12	1000307	1000318	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017921	TATGCA	2	12	1008765	1008776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017921	GCGCGA	2	12	1017191	1017202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017921	ACGAGT	2	12	1017868	1017879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017921	GCGTGC	2	12	1026195	1026206	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017921	GTGTGG	2	12	1046155	1046166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017921	ATATGT	2	12	1060347	1060358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017921	GATGCG	2	12	1102091	1102102	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017921	CGTAAT	2	12	1103625	1103636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017921	AGGGGG	2	12	1112773	1112784	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017921	CCCCCT	2	12	1113220	1113231	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
91	NC_017921	GCGCCG	2	12	1166702	1166713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017921	GCGCGT	2	12	1192934	1192945	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017921	GCAACG	2	12	1192961	1192972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017921	CCGTCA	2	12	1230985	1230996	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017921	GGTCGT	2	12	1231011	1231022	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017921	ATCAAA	2	12	1239951	1239962	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017921	CATTTT	2	12	1240576	1240587	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017921	TTCCGA	2	12	1257208	1257219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017921	GGCGGG	2	12	1263457	1263468	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017921	CGTCGG	2	12	1270655	1270666	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017921	CGTCGG	2	12	1287618	1287629	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017921	GGTTTT	2	12	1295614	1295625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017921	TGCGGG	2	12	1320167	1320178	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017921	ACGACA	2	12	1325757	1325768	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017921	CGGGCG	2	12	1334798	1334809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017921	GCGGCA	2	12	1345311	1345322	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017921	GCCCGC	2	12	1348755	1348766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017921	GGCCCG	2	12	1376659	1376670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017921	ATGGCT	2	12	1386113	1386124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017921	GATGCA	2	12	1425053	1425064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017921	ACGCGC	2	12	1427569	1427580	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017921	GGAAAC	2	12	1447446	1447457	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017921	AATCGG	2	12	1464510	1464521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017921	ACCGCC	2	12	1524445	1524456	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017921	TCCGCC	2	12	1532176	1532187	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017921	TGCACG	2	12	1548619	1548630	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017921	GCGTGC	2	12	1548879	1548890	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017921	TCGCGA	2	12	1558358	1558369	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017921	GTTCGA	2	12	1566170	1566181	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017921	GATCGC	2	12	1566886	1566897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017921	CGCCCC	2	12	1571630	1571641	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
122	NC_017921	CTCGCC	2	12	1581420	1581431	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017921	GCCGGC	2	12	1584327	1584338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017921	ACCGGA	2	12	1599965	1599976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017921	AGCCCG	2	12	1606422	1606433	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017921	ACGTCG	2	12	1606656	1606667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017921	CGACAG	2	12	1606802	1606813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017921	CGGCGC	2	12	1624368	1624379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017921	GCAGGT	2	12	1676594	1676605	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017921	CTCACG	2	12	1677741	1677752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017921	GCTTCA	2	12	1678117	1678128	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017921	TCTTCG	2	12	1678674	1678685	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017921	GCGCCG	2	12	1679326	1679337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017921	ACGCGA	2	12	1683594	1683605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017921	AGCCGC	2	12	1691898	1691909	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017921	GAGTTG	2	12	1715881	1715892	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017921	GCGGTC	2	12	1716095	1716106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017921	GTTTCG	2	12	1724418	1724429	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017921	TGCCGC	2	12	1733648	1733659	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017921	GGCGCC	2	12	1826359	1826370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017921	CAGCGC	2	12	1834576	1834587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017921	CATGCG	2	12	1848545	1848556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017921	TGCGCC	2	12	1854528	1854539	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017921	ATCGGC	2	12	1855480	1855491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017921	TCGATT	2	12	1920731	1920742	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_017921	GCGCGT	2	12	1923943	1923954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017921	GCGCGG	2	12	1937520	1937531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017921	CGAGTT	2	12	1948825	1948836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_017921	CCAGGT	2	12	1949755	1949766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017921	GAACGA	2	12	1959888	1959899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_017921	AGATGA	2	12	1963198	1963209	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017921	ACGTAT	2	12	2000300	2000311	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_017921	TCATAT	2	12	2022256	2022267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_017921	CGATGC	2	12	2053183	2053194	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017921	GCCGGC	2	12	2058903	2058914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_017921	GGCATC	2	12	2066147	2066158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017921	CGCGTG	2	12	2098958	2098969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017921	GGCGCA	2	12	2140627	2140638	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017921	CTCGCC	2	12	2170683	2170694	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_017921	CGTCGG	3	18	2176993	2177010	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017921	GCCGAA	2	12	2183867	2183878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_017921	TCGCTG	2	12	2187118	2187129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017921	CGAAGC	3	18	2187155	2187172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_017921	TCGCAA	2	12	2187237	2187248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017921	TCACGG	2	12	2187249	2187260	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_017921	TATGCA	2	12	2193133	2193144	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
167	NC_017921	CGGCCG	2	12	2195065	2195076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_017921	ACTGTC	2	12	2245607	2245618	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_017921	CCGCGC	2	12	2246473	2246484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_017921	ATCCGC	2	12	2264739	2264750	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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174	NC_017921	TTACCA	2	12	2338220	2338231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_017921	GGCCGG	2	12	2342268	2342279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.