MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 15000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017912	GA	3	6	175647	175652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017912	CGG	2	6	175805	175810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017912	GA	3	6	175903	175908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017912	TAGG	2	8	176021	176028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017912	TAC	2	6	176075	176080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017912	CGC	2	6	176105	176110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_017912	CGGG	2	8	176117	176124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_017912	CCT	2	6	176163	176168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_017912	GGT	2	6	176299	176304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017912	CGT	2	6	176494	176499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017912	GAG	2	6	176543	176548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017912	GTT	2	6	176597	176602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017912	C	6	6	176670	176675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1014	NC_017912	GAT	2	6	176721	176726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017912	ATCG	2	8	176782	176789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_017912	GA	3	6	176834	176839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017912	TGG	2	6	176855	176860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017912	CGC	2	6	176958	176963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_017912	ATG	2	6	176985	176990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017912	T	6	6	176998	177003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017912	AT	3	6	177022	177027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017912	T	6	6	177056	177061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017912	ATA	2	6	178299	178304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017912	TC	3	6	178307	178312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_017912	ATG	2	6	178326	178331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017912	A	6	6	178339	178344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017912	TTTTC	2	10	181769	181778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_017912	TTAT	2	8	181779	181786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017912	TTCCT	2	10	181837	181846	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1030	NC_017912	GCCT	2	8	181889	181896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_017912	AT	3	6	183427	183432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017912	T	7	7	183439	183445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017912	AATG	2	8	183475	183482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017912	TA	3	6	183497	183502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017912	ATG	2	6	183515	183520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017912	AGG	2	6	185173	185178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017912	TCC	2	6	188239	188244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_017912	TAT	2	6	188260	188265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017912	GAAT	2	8	188282	188289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017912	ACC	2	6	189920	189925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_017912	CATT	2	8	189936	189943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_017912	AAAT	2	8	189976	189983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017912	TCC	2	6	191303	191308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_017912	CCT	2	6	193234	193239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_017912	TCCC	2	8	194563	194570	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1046	NC_017912	TCC	2	6	195947	195952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_017912	ATT	2	6	196048	196053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017912	CCA	2	6	196055	196060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_017912	GATGA	2	10	197074	197083	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017912	TCA	2	6	198078	198083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017912	AG	3	6	198095	198100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017912	A	6	6	198121	198126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017912	A	6	6	198132	198137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017912	A	7	7	198148	198154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017912	TA	3	6	198188	198193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017912	CGG	2	6	198262	198267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017912	GGA	2	6	198300	198305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017912	CGG	2	6	198347	198352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017912	TCC	2	6	198366	198371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_017912	A	7	7	198463	198469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017912	CGG	2	6	198498	198503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017912	C	6	6	198545	198550	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1063	NC_017912	CCA	2	6	198552	198557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_017912	T	7	7	198662	198668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017912	TCA	2	6	198698	198703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017912	GCT	2	6	198720	198725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017912	CCTG	2	8	198761	198768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_017912	TAA	2	6	198788	198793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017912	A	7	7	198792	198798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017912	TGA	2	6	199433	199438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017912	T	6	6	200087	200092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017912	CGC	2	6	200099	200104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_017912	ATG	2	6	200156	200161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017912	GCA	2	6	200176	200181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017912	GGA	2	6	200218	200223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017912	AG	3	6	203863	203868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017912	AACAA	2	10	203871	203880	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_017912	ATG	2	6	203909	203914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017912	A	6	6	203925	203930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017912	A	7	7	204193	204199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017912	TTC	2	6	204242	204247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017912	AGG	2	6	204266	204271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017912	ATAA	2	8	206085	206092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017912	ATA	2	6	206116	206121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017912	GTT	2	6	206124	206129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017912	TAT	2	6	206244	206249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017912	TA	4	8	206262	206269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017912	TAA	2	6	206292	206297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017912	TAA	2	6	206306	206311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017912	AGTAC	2	10	206358	206367	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_017912	CTA	2	6	206386	206391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017912	GCTT	2	8	206471	206478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_017912	GAAAG	2	10	206793	206802	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017912	TTAGA	2	10	206803	206812	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017912	AGG	2	6	206829	206834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017912	T	6	6	206854	206859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017912	GAAT	2	8	206959	206966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017912	TA	3	6	207024	207029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017912	ATT	2	6	207045	207050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017912	A	6	6	207081	207086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017912	TGAA	2	8	207087	207094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017912	T	6	6	207096	207101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017912	A	6	6	207103	207108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017912	TTAAAC	2	12	207144	207155	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1105	NC_017912	ATT	2	6	207164	207169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017912	AACT	2	8	207172	207179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017912	GAA	2	6	207194	207199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017912	GAA	2	6	207209	207214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017912	T	6	6	207221	207226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017912	TAA	2	6	207268	207273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017912	TAT	2	6	207277	207282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017912	ATT	2	6	207342	207347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017912	ACA	2	6	209819	209824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017912	ATTT	2	8	209826	209833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017912	T	6	6	209874	209879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017912	TA	3	6	209949	209954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017912	TCA	2	6	210077	210082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017912	TA	3	6	210095	210100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017912	AATC	2	8	210106	210113	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_017912	A	6	6	210137	210142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017912	TGT	2	6	210157	210162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017912	AAC	2	6	210212	210217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017912	T	6	6	210219	210224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017912	AAT	2	6	210226	210231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017912	A	6	6	210246	210251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017912	ACA	2	6	210258	210263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017912	CAG	2	6	211210	211215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017912	T	6	6	211219	211224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017912	TTG	2	6	211252	211257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017912	GCC	2	6	211838	211843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_017912	TTC	2	6	211861	211866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017912	ATG	2	6	212795	212800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017912	CAT	2	6	212860	212865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017912	A	6	6	214059	214064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017912	ATG	2	6	214073	214078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017912	CCT	2	6	214957	214962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1138	NC_017912	ATA	2	6	214999	215004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_017912	TTA	2	6	311445	311450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_017912	CAG	2	6	312491	312496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_017912	T	6	6	312519	312524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_017912	CTT	2	6	313498	313503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1419	NC_017912	TCC	2	6	316023	316028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1420	NC_017912	G	6	6	316033	316038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_017912	GGA	3	9	316067	316075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_017912	T	7	7	317641	317647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1425	NC_017912	ATTGAT	2	12	319083	319094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1427	NC_017912	A	6	6	321673	321678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_017912	GAT	2	6	324475	324480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_017912	A	6	6	324556	324561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_017912	A	6	6	324566	324571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1438	NC_017912	AATA	2	8	330515	330522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_017912	T	7	7	333482	333488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_017912	A	6	6	333493	333498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_017912	AGG	2	6	333531	333536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_017912	GA	3	6	335418	335423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_017912	TC	3	6	335432	335437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1451	NC_017912	TCC	2	6	335856	335861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1453	NC_017912	TTA	2	6	336533	336538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1481	NC_017912	TA	3	6	365023	365028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1482	NC_017912	A	6	6	365061	365066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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