MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017867	AGGA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017867	CTGC	2	8	11473	11480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017867	CGCA	2	8	11481	11488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017867	TGCA	2	8	13668	13675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017867	GTTG	2	8	13879	13886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017867	CCTC	2	8	15392	15399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017867	TGCA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017867	ATGT	2	8	19468	19475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017867	AGAA	2	8	19856	19863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017867	GGTG	2	8	19923	19930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017867	ATTC	2	8	19931	19938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017867	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017867	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017867	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017867	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017867	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017867	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017867	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017867	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017867	GCTT	2	8	29053	29060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017867	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017867	TGGC	2	8	32674	32681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017867	TGAT	2	8	34097	34104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017867	GTTT	2	8	34200	34207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017867	AATT	2	8	34339	34346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017867	CTCG	2	8	36208	36215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017867	TGTC	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017867	GATT	2	8	44113	44120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017867	AGAA	2	8	44644	44651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017867	TGCT	2	8	45948	45955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017867	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017867	ATCG	2	8	55313	55320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017867	TACG	2	8	60419	60426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017867	CAAA	2	8	61992	61999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017867	TCGC	2	8	64033	64040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017867	AAGG	2	8	65509	65516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017867	GGTC	2	8	66895	66902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017867	GGGC	2	8	71414	71421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017867	TTCC	2	8	73037	73044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017867	TATC	2	8	85922	85929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017867	GTCT	2	8	89939	89946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017867	GCCA	2	8	89987	89994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017867	AGCG	2	8	92722	92729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017867	TGCC	2	8	111542	111549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017867	CCCG	2	8	112118	112125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_017867	AGCT	2	8	116080	116087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017867	TTGC	2	8	116156	116163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017867	CATG	2	8	127416	127423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017867	GCTG	2	8	127516	127523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017867	TGCA	2	8	131348	131355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017867	GCTC	2	8	132953	132960	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017867	GGCT	2	8	133155	133162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017867	CCGC	2	8	133299	133306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_017867	GCGG	2	8	136955	136962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017867	TGTT	2	8	138033	138040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017867	CGTG	2	8	143580	143587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017867	GGCC	2	8	143787	143794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017867	CAGA	2	8	157823	157830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017867	GGGA	2	8	164220	164227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017867	GCGT	2	8	164398	164405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017867	TGAG	2	8	164640	164647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017867	AGAA	2	8	164801	164808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017867	ATCT	2	8	166319	166326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017867	GCGT	2	8	166434	166441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017867	GCAT	2	8	167728	167735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017867	GTTT	2	8	167877	167884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017867	GCAT	2	8	168159	168166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017867	GGGT	2	8	170294	170301	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017867	CTTT	2	8	171746	171753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017867	GCGG	2	8	171896	171903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017867	AGTA	2	8	171949	171956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017867	AATG	2	8	171957	171964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017867	TGCT	2	8	176872	176879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017867	AGTG	2	8	177647	177654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017867	CTTG	2	8	179695	179702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017867	TAAG	2	8	179824	179831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017867	CGGT	2	8	183514	183521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017867	TGAA	2	8	192659	192666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017867	GTAA	2	8	192681	192688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017867	GATA	2	8	195355	195362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017867	GCAA	2	8	201552	201559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017867	AAAC	2	8	201977	201984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017867	TGGT	2	8	203564	203571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017867	CGGT	2	8	203844	203851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017867	GGCG	2	8	211196	211203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017867	ATGA	2	8	215487	215494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017867	CACG	2	8	223494	223501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017867	TGCA	2	8	223711	223718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017867	TCAT	2	8	225748	225755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017867	AGGC	2	8	227744	227751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017867	AGGG	2	8	232893	232900	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017867	TTGT	2	8	234697	234704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017867	CCGG	2	8	235097	235104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017867	GGGC	2	8	239755	239762	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017867	GGCA	2	8	245153	245160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017867	GACA	2	8	249340	249347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017867	CGGT	2	8	251091	251098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017867	GTTC	2	8	251130	251137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017867	GCCG	2	8	254387	254394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017867	GCCG	2	8	256972	256979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017867	CTGG	2	8	257004	257011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017867	GACC	2	8	257462	257469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017867	CTGC	2	8	257655	257662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017867	CGCC	2	8	257778	257785	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_017867	GTCC	2	8	257960	257967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017867	GGCC	2	8	258144	258151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017867	TGAC	2	8	266770	266777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017867	TCCC	2	8	271023	271030	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_017867	CCAT	2	8	274197	274204	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017867	TGAT	2	8	274930	274937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017867	AGGG	2	8	275033	275040	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017867	GAAC	2	8	275297	275304	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017867	GCTT	2	8	276828	276835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017867	GCGG	2	8	277015	277022	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017867	TTCG	2	8	278014	278021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017867	GCGG	2	8	278068	278075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017867	GAAA	2	8	278314	278321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017867	CGGA	2	8	279469	279476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017867	AAAG	2	8	281169	281176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017867	GGCT	2	8	284623	284630	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017867	TGGC	2	8	286757	286764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017867	ATGT	2	8	286946	286953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017867	TACC	2	8	290407	290414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017867	ACTC	2	8	291165	291172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017867	ATGA	2	8	291270	291277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017867	TGAA	2	8	291281	291288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017867	AGGA	2	8	291612	291619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017867	TGCT	2	8	294691	294698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017867	CGCT	2	8	296250	296257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017867	AGCG	2	8	296477	296484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017867	CCCG	2	8	297520	297527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_017867	CATG	2	8	299150	299157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017867	TTGC	2	8	300432	300439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017867	GTTT	2	8	300544	300551	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017867	GCGG	2	8	300569	300576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017867	GGTT	2	8	310161	310168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017867	CAGG	2	8	313608	313615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017867	CCGA	2	8	316813	316820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017867	GTTC	2	8	316925	316932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017867	ATGG	2	8	317047	317054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017867	CGCA	3	12	318291	318302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017867	ACCA	2	8	319114	319121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017867	TCAA	2	8	319243	319250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017867	GGCC	2	8	319389	319396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017867	AGGC	2	8	319481	319488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017867	CCCA	2	8	319789	319796	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_017867	CCAG	2	8	319871	319878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017867	AAAG	2	8	320100	320107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017867	TGCC	2	8	320342	320349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017867	ACGA	2	8	320905	320912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017867	GGCA	2	8	320925	320932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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160	NC_017867	CCGA	2	8	323740	323747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_017867	CCGA	2	8	323758	323765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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491	NC_017867	CGGC	2	8	1285411	1285418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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498	NC_017867	CATA	2	8	1315914	1315921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_017867	GCCG	2	8	1316706	1316713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_017867	TCGT	2	8	1316754	1316761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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