MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 5339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017867	CTC	2	6	290871	290876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_017867	TAA	2	6	290948	290953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017867	GGT	2	6	290988	290993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017867	ACTC	2	8	291165	291172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_017867	AGA	2	6	291186	291191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017867	ATGA	2	8	291270	291277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017867	TGAA	2	8	291281	291288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017867	GTC	2	6	291397	291402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017867	GTC	2	6	291481	291486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017867	GAC	2	6	291578	291583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017867	AGGAG	2	10	291598	291607	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017867	AGGA	2	8	291612	291619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017867	AGAGGA	2	12	291620	291631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017867	AGA	2	6	291632	291637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017867	GGA	2	6	291675	291680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017867	G	12	12	291690	291701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017867	C	9	9	291721	291729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1018	NC_017867	AGG	2	6	291733	291738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017867	TGCT	2	8	294691	294698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_017867	CTG	2	6	294727	294732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017867	GGC	2	6	294735	294740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017867	CTT	2	6	294760	294765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017867	GTC	2	6	294780	294785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017867	CGC	2	6	294812	294817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017867	T	6	6	294855	294860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017867	GAC	2	6	294898	294903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017867	CGCT	2	8	296250	296257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_017867	AGA	2	6	296391	296396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017867	AGCG	2	8	296477	296484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017867	CCCG	2	8	297520	297527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1031	NC_017867	GC	3	6	297551	297556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_017867	GC	3	6	297574	297579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_017867	AGC	2	6	297720	297725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017867	CGTTC	2	10	297797	297806	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1035	NC_017867	GGC	3	9	297815	297823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017867	GCC	2	6	299034	299039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_017867	CCA	2	6	299131	299136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_017867	CATG	2	8	299150	299157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_017867	GCTGTT	2	12	299252	299263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1040	NC_017867	TTGC	2	8	300432	300439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_017867	CG	3	6	300445	300450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_017867	GGC	2	6	300455	300460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017867	CGG	2	6	300503	300508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017867	GTTT	2	8	300544	300551	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017867	GCGG	2	8	300569	300576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_017867	AGG	2	6	300586	300591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017867	CAA	2	6	300596	300601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017867	AGCGT	2	10	302586	302595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1049	NC_017867	GGT	2	6	302598	302603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017867	CAC	2	6	302604	302609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_017867	GCT	2	6	303198	303203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017867	CTC	2	6	303249	303254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_017867	TGG	3	9	303277	303285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017867	AAT	2	6	303286	303291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017867	TCA	2	6	303303	303308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017867	CAT	2	6	303327	303332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017867	TAG	2	6	304639	304644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017867	CG	3	6	307064	307069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_017867	GCC	2	6	310020	310025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_017867	GGC	2	6	310117	310122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017867	GC	3	6	310121	310126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_017867	GGTT	2	8	310161	310168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017867	AGA	3	9	310197	310205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017867	GTG	2	6	310293	310298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017867	GTG	2	6	313180	313185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017867	CAGG	2	8	313608	313615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_017867	ACA	2	6	313744	313749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017867	AGG	2	6	313750	313755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017867	TGA	2	6	316215	316220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017867	TGG	2	6	316237	316242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017867	TGT	2	6	316256	316261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017867	TCG	2	6	316299	316304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017867	G	6	6	316339	316344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017867	GAA	2	6	316382	316387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017867	TGG	2	6	316400	316405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017867	TA	4	8	316479	316486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017867	TCT	2	6	316580	316585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017867	GAA	2	6	316599	316604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017867	GAA	2	6	316677	316682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017867	GCG	2	6	316705	316710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_017867	TGG	2	6	316730	316735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017867	GGC	2	6	316749	316754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_017867	CCGAC	2	10	316769	316778	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1084	NC_017867	CCGA	2	8	316813	316820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_017867	GAC	2	6	316891	316896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017867	GTTC	2	8	316925	316932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_017867	GC	3	6	316958	316963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_017867	TCGTGC	2	12	317006	317017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017867	ATGG	2	8	317047	317054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017867	GAT	2	6	317056	317061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017867	CAC	2	6	317097	317102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_017867	TAC	2	6	317113	317118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017867	TAC	2	6	317170	317175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017867	AGG	2	6	317181	317186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017867	CAG	2	6	317187	317192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017867	CCG	3	9	317216	317224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_017867	CGC	2	6	317232	317237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_017867	CGG	2	6	317257	317262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017867	GAC	2	6	317268	317273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017867	GCG	2	6	317335	317340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_017867	AAG	2	6	317365	317370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017867	GAC	2	6	317458	317463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017867	TTC	2	6	317560	317565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017867	CAAAT	2	10	317583	317592	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_017867	ACG	2	6	317603	317608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017867	CCA	2	6	317789	317794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_017867	ACT	2	6	317831	317836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017867	GGT	2	6	318072	318077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017867	ACC	2	6	318094	318099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_017867	TCACCG	2	12	318167	318178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_017867	CGG	2	6	318221	318226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017867	GAC	2	6	318279	318284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017867	CGCA	3	12	318291	318302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_017867	ACG	2	6	318320	318325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017867	GCG	2	6	318370	318375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017867	GCG	2	6	318410	318415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017867	CGG	3	9	318458	318466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017867	ACG	2	6	318475	318480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017867	CCG	2	6	318482	318487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_017867	CGA	3	9	318500	318508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017867	CTA	2	6	318516	318521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017867	CGC	2	6	318536	318541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_017867	CTA	3	9	318603	318611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017867	TAC	2	6	318622	318627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017867	GCA	2	6	318668	318673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017867	GAA	2	6	318768	318773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017867	CAA	2	6	318849	318854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017867	TG	3	6	318906	318911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017867	ACCA	2	8	319114	319121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_017867	GAC	2	6	319182	319187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017867	CGA	2	6	319223	319228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017867	TCAA	2	8	319243	319250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1134	NC_017867	GAA	2	6	319332	319337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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