MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 5339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017867	ATGAG	2	10	151762	151771	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017867	CGG	2	6	151787	151792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017867	AGA	2	6	151793	151798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017867	GA	3	6	151797	151802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017867	CTC	2	6	153089	153094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_017867	GGC	2	6	153116	153121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017867	CCT	2	6	154188	154193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_017867	TCC	2	6	154273	154278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_017867	TCG	2	6	154309	154314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017867	GAA	2	6	154364	154369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017867	AGG	2	6	154479	154484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017867	CT	3	6	157688	157693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_017867	CAGA	2	8	157823	157830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_017867	AAG	2	6	157838	157843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017867	ACC	2	6	157863	157868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_017867	CG	3	6	157905	157910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_017867	AG	4	8	157922	157929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017867	CGC	2	6	160023	160028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017867	CGG	2	6	160035	160040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017867	TCCCG	2	10	160045	160054	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
521	NC_017867	CGG	2	6	160079	160084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017867	CGG	2	6	160100	160105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017867	CGG	2	6	160110	160115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017867	GTG	2	6	160120	160125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017867	CGA	2	6	160137	160142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017867	TCG	2	6	160172	160177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017867	GAG	2	6	160338	160343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017867	GCG	3	9	161384	161392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017867	GC	4	8	163013	163020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_017867	CAG	2	6	163831	163836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017867	TGA	2	6	163847	163852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017867	GCGAA	2	10	163882	163891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
533	NC_017867	GTA	2	6	163893	163898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017867	AGC	2	6	164084	164089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017867	GC	3	6	164147	164152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_017867	AGG	2	6	164157	164162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017867	GTT	2	6	164175	164180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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539	NC_017867	GAA	2	6	164235	164240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017867	GGT	2	6	164292	164297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017867	AGTGT	2	10	164379	164388	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017867	GCGT	2	8	164398	164405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
543	NC_017867	ATG	2	6	164426	164431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017867	GC	4	8	164588	164595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_017867	AGG	2	6	164627	164632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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547	NC_017867	ATT	2	6	164678	164683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_017867	GATAGG	2	12	166273	166284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017867	ATCT	2	8	166319	166326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_017867	CCG	2	6	166402	166407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_017867	GCGT	2	8	166434	166441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_017867	CGGCG	2	10	166540	166549	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
554	NC_017867	ACA	2	6	166554	166559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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558	NC_017867	GCAT	2	8	167728	167735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_017867	CCG	2	6	167796	167801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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561	NC_017867	CG	4	8	167848	167855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_017867	GTTT	2	8	167877	167884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017867	GAT	2	6	167920	167925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017867	GT	3	6	167981	167986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017867	GCC	2	6	167990	167995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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567	NC_017867	CG	3	6	168227	168232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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569	NC_017867	TGT	2	6	170068	170073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017867	GCC	2	6	170141	170146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_017867	CAG	2	6	170152	170157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017867	TGG	2	6	170180	170185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017867	G	7	7	170190	170196	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017867	GAC	2	6	170243	170248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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583	NC_017867	G	7	7	171859	171865	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_017867	AATG	2	8	171957	171964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017867	AGG	2	6	172034	172039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_017867	TAA	2	6	173619	173624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_017867	ATT	2	6	173745	173750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017867	CG	3	6	174678	174683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_017867	CG	3	6	174701	174706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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602	NC_017867	TG	3	6	174736	174741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017867	GT	3	6	175906	175911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_017867	ATT	2	6	175935	175940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_017867	GAG	2	6	176143	176148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_017867	CTCAT	2	10	177634	177643	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
611	NC_017867	AGTG	2	8	177647	177654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017867	TG	3	6	177762	177767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017867	AT	3	6	177836	177841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017867	GCG	2	6	178095	178100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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620	NC_017867	CG	3	6	178358	178363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_017867	GCC	2	6	179668	179673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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623	NC_017867	GCG	2	6	179751	179756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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625	NC_017867	TAAG	2	8	179824	179831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017867	CGG	2	6	179832	179837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017867	TCT	2	6	179843	179848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017867	TTC	2	6	179882	179887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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633	NC_017867	CG	3	6	180107	180112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_017867	GT	3	6	180140	180145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017867	GCACC	2	10	181804	181813	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
636	NC_017867	CG	3	6	181837	181842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_017867	GCA	2	6	181858	181863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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639	NC_017867	GCG	3	9	181880	181888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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