MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 chromosome

Total Repeats: 5523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017866	TGTAG	2	10	279279	279288	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017866	GCG	2	6	279332	279337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017866	CGGA	2	8	279468	279475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_017866	GCG	2	6	279525	279530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017866	ATT	2	6	281037	281042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017866	TGA	2	6	281112	281117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017866	AGA	2	6	281121	281126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017866	TTG	2	6	281134	281139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017866	AAAG	2	8	281168	281175	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017866	GCA	2	6	281338	281343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017866	CGC	2	6	282537	282542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_017866	GC	3	6	282556	282561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_017866	CGC	2	6	282623	282628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_017866	CA	3	6	282733	282738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_017866	ATG	2	6	282743	282748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017866	AC	3	6	282762	282767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_017866	AAC	2	6	284459	284464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017866	GC	3	6	284585	284590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_017866	GC	3	6	284605	284610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_017866	GGCT	2	8	284622	284629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_017866	CGA	2	6	284717	284722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017866	GAT	2	6	284723	284728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017866	TTC	2	6	284806	284811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017866	T	6	6	284936	284941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017866	CG	3	6	284996	285001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_017866	ACG	2	6	286484	286489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017866	CGT	2	6	286505	286510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017866	TG	3	6	286516	286521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017866	CAA	3	9	286644	286652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017866	TGGC	2	8	286756	286763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_017866	GAGACG	2	12	286877	286888	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1032	NC_017866	GGC	2	6	286901	286906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017866	GCC	2	6	286921	286926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_017866	ATGT	2	8	286945	286952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017866	GAT	2	6	287014	287019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017866	GCC	2	6	287054	287059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_017866	ATT	2	6	287893	287898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017866	CG	3	6	290316	290321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_017866	GGC	2	6	290322	290327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017866	CG	3	6	290342	290347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_017866	TACC	2	8	290406	290413	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_017866	CAA	2	6	290417	290422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017866	GTT	2	6	290539	290544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017866	CTC	2	6	290870	290875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_017866	TAA	2	6	290947	290952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017866	GGT	2	6	290987	290992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017866	ACTC	2	8	291164	291171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_017866	AGA	2	6	291185	291190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017866	ATGA	2	8	291269	291276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017866	TGAA	2	8	291280	291287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017866	GTC	2	6	291396	291401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017866	GTC	2	6	291480	291485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017866	GAC	2	6	291577	291582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017866	AGGAG	2	10	291597	291606	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017866	AGGA	2	8	291611	291618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017866	AGAGGA	2	12	291619	291630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017866	AGA	2	6	291631	291636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017866	GGA	2	6	291674	291679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017866	G	11	11	291689	291699	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017866	C	9	9	291719	291727	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1061	NC_017866	AGG	2	6	291731	291736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017866	TGCT	2	8	294689	294696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_017866	CTG	2	6	294725	294730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017866	GGC	2	6	294733	294738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017866	CTT	2	6	294758	294763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017866	GTC	2	6	294778	294783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017866	CGC	2	6	294810	294815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_017866	T	6	6	294853	294858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017866	GAC	2	6	294896	294901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017866	CGCT	2	8	296248	296255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_017866	AGA	2	6	296389	296394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017866	AGCG	2	8	296475	296482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_017866	CCCG	2	8	297518	297525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1074	NC_017866	GC	3	6	297549	297554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_017866	GC	3	6	297572	297577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_017866	AGC	2	6	297718	297723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017866	CGTTC	2	10	297795	297804	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1078	NC_017866	GGC	3	9	297813	297821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017866	GCC	2	6	299032	299037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_017866	CCA	2	6	299129	299134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_017866	CATG	2	8	299148	299155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_017866	GCTGTT	2	12	299250	299261	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1083	NC_017866	TTGC	2	8	300430	300437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_017866	CG	3	6	300443	300448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_017866	GGC	2	6	300453	300458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017866	CGG	2	6	300501	300506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017866	GTTT	2	8	300542	300549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017866	GCGG	2	8	300567	300574	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_017866	AGG	2	6	300584	300589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017866	CAA	2	6	300594	300599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017866	AGCGT	2	10	302584	302593	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_017866	GGT	2	6	302596	302601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017866	CAC	2	6	302602	302607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_017866	GCT	2	6	303196	303201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017866	CTC	2	6	303247	303252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_017866	TGG	3	9	303275	303283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017866	AAT	2	6	303284	303289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017866	TCA	2	6	303301	303306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017866	CAT	2	6	303325	303330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017866	TAG	2	6	304637	304642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017866	CG	3	6	307062	307067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_017866	GCC	2	6	310018	310023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_017866	GGC	2	6	310115	310120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017866	GC	3	6	310119	310124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_017866	GGTT	2	8	310159	310166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017866	AGA	3	9	310195	310203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017866	GTG	2	6	310291	310296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017866	GTG	2	6	313178	313183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017866	CAGG	2	8	313606	313613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_017866	ACA	2	6	313742	313747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017866	AGG	2	6	313748	313753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017866	TGA	2	6	316213	316218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017866	TGG	2	6	316235	316240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017866	TGT	2	6	316254	316259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017866	TCG	2	6	316297	316302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017866	G	6	6	316337	316342	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017866	GAA	2	6	316380	316385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017866	TGG	2	6	316398	316403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017866	TA	4	8	316477	316484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017866	TCT	2	6	316578	316583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017866	GAA	2	6	316597	316602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017866	GAA	2	6	316675	316680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017866	GCG	2	6	316703	316708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017866	TGG	2	6	316728	316733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017866	GGC	2	6	316747	316752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017866	CCGAC	2	10	316767	316776	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1127	NC_017866	CCGA	2	8	316811	316818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_017866	GAC	2	6	316889	316894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_017866	GTTC	2	8	316923	316930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_017866	GC	3	6	316956	316961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_017866	TCGTGC	2	12	317004	317015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017866	ATGG	2	8	317045	317052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017866	GAT	2	6	317054	317059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017866	CAC	2	6	317095	317100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1136	NC_017866	TAC	2	6	317168	317173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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