MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 5183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017834	CTC	2	6	440201	440206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_017834	CGC	2	6	440225	440230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_017834	T	6	6	440303	440308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017834	TTG	2	6	440311	440316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017834	AG	3	6	440430	440435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017834	AC	3	6	440437	440442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_017834	CGTGG	2	10	444392	444401	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_017834	TCG	2	6	444427	444432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017834	CTC	2	6	444453	444458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_017834	AC	3	6	444527	444532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_017834	CTGTC	2	10	444549	444558	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1512	NC_017834	GCG	2	6	444563	444568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017834	GGC	2	6	444570	444575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017834	GAA	2	6	444592	444597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017834	TA	3	6	446086	446091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017834	GAT	2	6	446106	446111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017834	AGT	2	6	447391	447396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017834	GCA	2	6	447419	447424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_017834	CAT	2	6	447433	447438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017834	AAG	2	6	447462	447467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017834	GT	3	6	447496	447501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017834	GATGG	2	10	447516	447525	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017834	TGGA	2	8	447574	447581	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017834	GCG	2	6	447604	447609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017834	AGGG	2	8	448196	448203	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017834	AAT	2	6	448211	448216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017834	CTAT	2	8	448233	448240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_017834	GT	3	6	448320	448325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017834	GGA	2	6	448338	448343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017834	CG	3	6	448413	448418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_017834	ATC	2	6	448522	448527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017834	CG	3	6	448557	448562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_017834	AGGTG	2	10	448577	448586	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017834	CGG	2	6	448619	448624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017834	TCA	2	6	448631	448636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017834	GT	3	6	448652	448657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017834	GAA	2	6	448659	448664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017834	ATGC	2	8	448716	448723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_017834	TCT	2	6	448724	448729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017834	CGT	2	6	448978	448983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_017834	ACA	2	6	448989	448994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017834	GGC	2	6	449018	449023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017834	GAAA	2	8	449136	449143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017834	TTC	2	6	453738	453743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_017834	CCG	2	6	453847	453852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_017834	GTTG	2	8	453908	453915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017834	AAT	2	6	453933	453938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017834	GAT	2	6	454001	454006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017834	TG	3	6	454015	454020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017834	T	7	7	454029	454035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017834	AGGA	2	8	454069	454076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017834	ACA	2	6	454645	454650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017834	AAT	2	6	454676	454681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017834	AT	3	6	455154	455159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017834	ACG	2	6	455286	455291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_017834	AGC	2	6	455321	455326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017834	GGTG	2	8	455346	455353	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017834	CA	3	6	455368	455373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_017834	AGGC	2	8	460622	460629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_017834	CAG	2	6	461468	461473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017834	AC	3	6	461491	461496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_017834	GCGA	2	8	461537	461544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_017834	CAT	2	6	461561	461566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_017834	ATG	2	6	461573	461578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017834	GAT	2	6	461610	461615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017834	GTTA	2	8	461620	461627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017834	GC	4	8	461968	461975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_017834	ACA	2	6	461994	461999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_017834	CTG	2	6	462833	462838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017834	GCC	2	6	462887	462892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_017834	TTC	2	6	463594	463599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017834	GCCG	2	8	464860	464867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_017834	TC	3	6	464910	464915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_017834	AACG	2	8	464947	464954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_017834	CTA	2	6	464957	464962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_017834	TG	3	6	464963	464968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017834	GCC	3	9	465003	465011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_017834	AG	3	6	465046	465051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017834	GC	3	6	465052	465057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_017834	GC	3	6	465448	465453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_017834	GC	3	6	465498	465503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_017834	TGCG	2	8	465531	465538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_017834	GC	3	6	465539	465544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_017834	TCG	2	6	465556	465561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_017834	CTA	2	6	465974	465979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_017834	T	6	6	466239	466244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017834	CAC	2	6	466280	466285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_017834	GAA	2	6	467578	467583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017834	GAC	2	6	467701	467706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_017834	AG	3	6	467719	467724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017834	TC	3	6	467840	467845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_017834	TGG	2	6	467861	467866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017834	CG	3	6	469455	469460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_017834	AGG	2	6	469538	469543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017834	CGC	2	6	471124	471129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_017834	AG	3	6	472543	472548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017834	CAA	2	6	472557	472562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_017834	ATG	2	6	472615	472620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017834	TTG	2	6	472626	472631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017834	GCA	2	6	472639	472644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_017834	TCTG	2	8	472783	472790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_017834	ATTG	2	8	472852	472859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017834	TCA	2	6	472877	472882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_017834	ATG	2	6	472893	472898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017834	AGC	2	6	472938	472943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_017834	TCGCT	2	10	472960	472969	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1607	NC_017834	GGT	2	6	473034	473039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017834	CTG	2	6	473040	473045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017834	ATTCG	2	10	473050	473059	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1610	NC_017834	GCGG	2	8	474106	474113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_017834	GAG	2	6	474155	474160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017834	CGC	2	6	474801	474806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_017834	CGC	2	6	474808	474813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_017834	ATG	2	6	474817	474822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017834	GCACG	2	10	474865	474874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_017834	A	6	6	475680	475685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017834	CG	3	6	477960	477965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_017834	ATA	2	6	477990	477995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017834	TTG	2	6	478001	478006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017834	CGC	2	6	478086	478091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_017834	GAA	2	6	479121	479126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017834	GCC	2	6	479128	479133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_017834	CTT	2	6	479151	479156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_017834	GAT	2	6	479188	479193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017834	CGGTC	2	10	481952	481961	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1626	NC_017834	GCT	2	6	483076	483081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017834	CCA	2	6	483136	483141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_017834	AGTG	2	8	483206	483213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017834	TG	3	6	483232	483237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017834	CGA	2	6	483245	483250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017834	TCA	2	6	483318	483323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_017834	AC	3	6	483343	483348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_017834	AGG	2	6	483457	483462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017834	GAA	2	6	486332	486337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017834	CG	4	8	486341	486348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_017834	TTC	2	6	486354	486359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_017834	CGAG	2	8	486363	486370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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