MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017818	CAA	2	6	98	103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017818	CTT	2	6	1233	1238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017818	CCT	2	6	1263	1268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017818	TAA	2	6	1322	1327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017818	TTA	2	6	1471	1476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017818	ACA	2	6	1556	1561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017818	CCT	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017818	TAA	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017818	TAA	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017818	TTA	2	6	3325	3330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017818	TCT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017818	ATT	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017818	ATC	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017818	TCA	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017818	ACT	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017818	ATA	2	6	4501	4506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017818	TAA	2	6	4523	4528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017818	TGA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017818	TAA	2	6	4641	4646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017818	ATA	2	6	4668	4673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017818	ATC	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017818	CTT	2	6	4707	4712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017818	GAG	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017818	ATT	2	6	5446	5451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017818	TAA	2	6	5588	5593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017818	ATA	2	6	5733	5738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017818	ATC	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017818	TTG	2	6	5841	5846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017818	TAA	2	6	6115	6120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017818	TTA	3	9	6129	6137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017818	ATT	2	6	6140	6145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017818	AAT	2	6	6146	6151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017818	ATA	2	6	8572	8577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017818	ATA	2	6	9268	9273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017818	TGA	2	6	9300	9305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017818	AAT	2	6	9359	9364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017818	TAG	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017818	AAT	2	6	9578	9583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017818	TAG	2	6	9622	9627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017818	AGT	2	6	9689	9694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017818	ATT	3	9	9837	9845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017818	ATA	2	6	9858	9863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017818	TTC	2	6	10628	10633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017818	AAT	2	6	10643	10648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017818	TTG	2	6	10669	10674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017818	AGT	2	6	10688	10693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017818	TTG	2	6	10737	10742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017818	TAT	2	6	10818	10823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017818	AAT	2	6	10915	10920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017818	AAT	2	6	10933	10938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017818	TGG	2	6	10942	10947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017818	TAT	2	6	11085	11090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017818	ATT	2	6	11247	11252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017818	GTA	2	6	11254	11259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017818	ATC	2	6	11289	11294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017818	TTA	2	6	11361	11366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017818	AAT	2	6	11372	11377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017818	ATA	2	6	11406	11411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017818	TTG	2	6	11491	11496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017818	AAG	2	6	11515	11520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017818	TAA	2	6	11534	11539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017818	TAA	2	6	11561	11566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017818	TGA	2	6	11588	11593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017818	TTG	2	6	11649	11654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017818	GTA	2	6	11744	11749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017818	CAT	2	6	11791	11796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017818	TTA	2	6	11906	11911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017818	TTA	2	6	11980	11985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017818	AAT	2	6	13740	13745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017818	TAT	2	6	13887	13892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017818	ATA	2	6	13937	13942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017818	TAA	2	6	13948	13953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017818	ATT	2	6	13962	13967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017818	ATA	2	6	14069	14074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017818	AGG	2	6	14081	14086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017818	GAA	2	6	14088	14093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017818	GTA	2	6	14163	14168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017818	TAA	2	6	14240	14245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017818	GAA	2	6	14557	14562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017818	TTA	2	6	14564	14569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017818	AAT	2	6	14679	14684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017818	GAA	2	6	14741	14746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017818	TTA	2	6	14924	14929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017818	AGC	2	6	14949	14954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017818	AAG	2	6	14957	14962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017818	GTT	2	6	14977	14982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017818	GTT	2	6	15010	15015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017818	ATG	2	6	15219	15224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017818	TAA	2	6	15235	15240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017818	TAA	2	6	15351	15356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017818	CTA	2	6	15361	15366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017818	GGT	2	6	15523	15528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017818	AAG	2	6	15544	15549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017818	TAG	2	6	16655	16660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017818	AAT	2	6	16662	16667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017818	ATT	2	6	16820	16825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017818	CAA	2	6	16855	16860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017818	GTA	2	6	16916	16921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017818	GAG	2	6	16922	16927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017818	GTG	2	6	16956	16961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017818	TAT	2	6	18088	18093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017818	TAT	2	6	18160	18165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017818	ATA	2	6	18191	18196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017818	TTA	2	6	18210	18215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017818	TTG	2	6	18277	18282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017818	TAA	2	6	18407	18412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017818	ATC	2	6	18418	18423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017818	TAA	2	6	18784	18789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017818	TAA	2	6	18851	18856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017818	ATT	2	6	18876	18881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017818	ATT	2	6	18953	18958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017818	AGG	2	6	19024	19029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017818	AGA	2	6	19032	19037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017818	ATA	2	6	20127	20132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017818	TTA	2	6	20217	20222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017818	ATA	2	6	20490	20495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017818	TAA	2	6	20501	20506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017818	AGA	2	6	20603	20608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017818	TGA	2	6	20656	20661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017818	ATG	3	9	20664	20672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017818	TGG	2	6	20677	20682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017818	ATA	3	9	23012	23020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017818	ATT	2	6	23067	23072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017818	TGT	2	6	23093	23098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017818	GAT	2	6	23138	23143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017818	ATG	3	9	23170	23178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017818	TGG	2	6	23183	23188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017818	AAG	2	6	23389	23394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017818	GAA	2	6	23461	23466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017818	TTA	2	6	23527	23532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017818	AGT	2	6	23577	23582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017818	CAA	2	6	23599	23604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017818	AGA	2	6	23622	23627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017818	AAG	2	6	23632	23637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017818	AGT	2	6	23704	23709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017818	ATG	2	6	23741	23746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017818	AGC	2	6	23790	23795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017818	GCA	2	6	23809	23814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017818	TAC	2	6	24703	24708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017818	AGG	2	6	24730	24735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017818	ATG	2	6	24738	24743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.