MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid lp54

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017804	TTA	2	6	845	850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017804	TAT	2	6	2039	2044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017804	ATC	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017804	TAA	2	6	2096	2101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017804	ACA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017804	TAT	3	9	4404	4412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017804	TAA	2	6	4426	4431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017804	TAA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017804	ATA	2	6	5290	5295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017804	TTA	2	6	5310	5315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017804	ATT	2	6	5401	5406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017804	ATT	2	6	5434	5439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017804	TAT	2	6	5443	5448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017804	TTA	2	6	5451	5456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017804	ATT	3	9	6260	6268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017804	TTC	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017804	AAT	2	6	6340	6345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017804	TTA	2	6	6369	6374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017804	ATT	2	6	6434	6439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017804	TAT	2	6	6443	6448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017804	TTA	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017804	AGG	2	6	6477	6482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017804	AAT	2	6	6531	6536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017804	AAG	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017804	TTC	2	6	7248	7253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017804	ACA	2	6	7292	7297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017804	TTA	2	6	7322	7327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017804	AAT	2	6	7429	7434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017804	TAT	3	9	7442	7450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017804	TAT	2	6	7455	7460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017804	TTA	2	6	7463	7468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017804	TTC	2	6	8337	8342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017804	TCT	2	6	8343	8348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017804	AAT	2	6	8391	8396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017804	TAT	3	9	8606	8614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017804	TAT	2	6	8619	8624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017804	TTA	2	6	8627	8632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017804	TTC	2	6	9470	9475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017804	TCT	2	6	9476	9481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017804	ACA	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017804	AAC	3	9	9542	9550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017804	ATT	2	6	9610	9615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017804	ATT	2	6	9676	9681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017804	TCT	2	6	11053	11058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017804	TTA	2	6	12091	12096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017804	AAT	3	9	12121	12129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017804	ATT	2	6	13449	13454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017804	AAT	2	6	13502	13507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017804	ATT	2	6	13520	13525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017804	AAT	2	6	13549	13554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017804	AAT	2	6	13616	13621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017804	AAT	2	6	14335	14340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017804	TTA	2	6	14341	14346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017804	AAT	2	6	14408	14413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017804	TAA	2	6	14450	14455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017804	TTA	2	6	14484	14489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017804	TAC	2	6	14505	14510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017804	AAG	2	6	14526	14531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017804	TTA	2	6	14537	14542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017804	CTT	2	6	14552	14557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017804	TAA	2	6	14631	14636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017804	TAA	2	6	14844	14849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017804	AAG	2	6	15004	15009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017804	ATA	2	6	15041	15046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017804	TAA	2	6	15462	15467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017804	AGA	2	6	15534	15539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017804	ACT	2	6	15581	15586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017804	AAT	2	6	15657	15662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017804	GTA	2	6	15768	15773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017804	CTA	2	6	17056	17061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017804	TCA	2	6	17304	17309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017804	TTA	2	6	17325	17330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017804	TAA	2	6	17335	17340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017804	AAT	2	6	17356	17361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017804	ATT	2	6	17375	17380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017804	ACT	2	6	17421	17426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017804	TCT	3	9	17430	17438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017804	AAC	2	6	17507	17512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017804	TAA	2	6	17542	17547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017804	AGA	2	6	17603	17608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017804	ATC	2	6	18628	18633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017804	TCT	2	6	18652	18657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017804	CTT	2	6	18751	18756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017804	TAA	2	6	18757	18762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017804	CTG	2	6	18800	18805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017804	TAA	2	6	18835	18840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017804	CAT	2	6	18844	18849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017804	ATT	2	6	19257	19262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017804	TTA	2	6	20439	20444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017804	TAT	2	6	21021	21026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017804	ATT	2	6	21066	21071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017804	TTG	2	6	21080	21085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017804	ATT	2	6	21111	21116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017804	TTA	2	6	21137	21142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017804	GCT	2	6	21891	21896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017804	TAC	2	6	21998	22003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017804	AAC	2	6	27318	27323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017804	GCC	3	9	27378	27386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017804	TAA	2	6	27704	27709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017804	ATT	2	6	29612	29617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017804	TTA	2	6	29647	29652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017804	TAT	2	6	29662	29667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017804	ATA	2	6	29671	29676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017804	TTG	2	6	29813	29818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017804	TAA	2	6	30653	30658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017804	ATA	2	6	30659	30664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017804	ATA	2	6	31291	31296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017804	AGT	2	6	31299	31304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017804	CGC	2	6	31350	31355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017804	CAA	2	6	31502	31507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017804	CTT	2	6	31519	31524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017804	TAA	3	9	31571	31579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017804	ATT	2	6	31766	31771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017804	CCT	2	6	32051	32056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017804	GAC	2	6	32074	32079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017804	CAG	2	6	32108	32113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017804	AAT	2	6	33492	33497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017804	ATA	2	6	33527	33532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017804	ACT	3	9	34037	34045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017804	CCA	2	6	34166	34171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017804	TAA	2	6	34218	34223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017804	TTC	2	6	34303	34308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017804	ATA	2	6	34355	34360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017804	TTA	2	6	34378	34383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017804	ATT	2	6	34506	34511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017804	ATA	2	6	34514	34519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017804	AAG	2	6	34529	34534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017804	TAA	2	6	35039	35044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017804	TAA	2	6	36724	36729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017804	TAA	2	6	37298	37303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017804	ATT	2	6	37784	37789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017804	ATA	2	6	37853	37858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017804	TTA	2	6	37859	37864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017804	TAA	2	6	37896	37901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017804	ATA	2	6	37916	37921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017804	TTA	2	6	37962	37967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017804	TAT	2	6	38016	38021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017804	TAA	2	6	39256	39261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017804	AAC	2	6	39302	39307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017804	GTT	2	6	39321	39326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017804	TAA	2	6	39361	39366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017804	AAT	2	6	40011	40016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017804	TTA	2	6	40068	40073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.