MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 250

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017798	A	7	7	14	20	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017798	ATT	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017798	TAC	2	6	54	59	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017798	CTT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017798	TCTT	2	8	101	108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017798	CAA	2	6	153	158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017798	A	6	6	165	170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017798	CTT	2	6	181	186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017798	CTCTT	2	10	230	239	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017798	T	7	7	258	264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017798	T	6	6	281	286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017798	ATA	2	6	287	292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017798	TTTG	2	8	300	307	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017798	ATA	2	6	363	368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017798	TAA	2	6	386	391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017798	TAAAA	2	10	410	419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017798	CTTTA	2	10	446	455	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017798	T	7	7	468	474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017798	TTA	2	6	479	484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017798	TA	3	6	508	513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017798	AT	3	6	514	519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017798	TAT	2	6	1130	1135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017798	ATCA	2	8	1201	1208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017798	T	6	6	1230	1235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017798	T	6	6	1245	1250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017798	TTA	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017798	TAA	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017798	TAA	2	6	1306	1311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017798	CA	3	6	1317	1322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017798	A	7	7	1328	1334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017798	CAAAAA	2	12	1371	1382	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017798	A	7	7	1378	1384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017798	TC	3	6	1393	1398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017798	ATG	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017798	ATT	2	6	1442	1447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017798	AAC	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017798	A	6	6	2395	2400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017798	N	435	435	2427	2861	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017798	A	6	6	2875	2880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017798	TAA	2	6	2901	2906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017798	ATT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017798	CAA	2	6	2926	2931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017798	TTC	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017798	CCT	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017798	TCTT	2	8	4089	4096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017798	TTAT	2	8	4114	4121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017798	TA	3	6	4144	4149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017798	A	7	7	4187	4193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017798	CT	3	6	4207	4212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017798	T	8	8	5359	5366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017798	TTA	2	6	5374	5379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017798	TAA	2	6	5397	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017798	A	6	6	5408	5413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017798	AAT	2	6	5428	5433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017798	TTA	2	6	5439	5444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017798	ACT	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017798	T	6	6	5482	5487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017798	TA	4	8	5518	5525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017798	TAT	2	6	5527	5532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017798	T	7	7	5566	5572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017798	T	6	6	5685	5690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017798	TA	3	6	5706	5711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017798	TA	3	6	5726	5731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017798	TAA	2	6	5773	5778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017798	TAA	2	6	5782	5787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017798	AGA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017798	AAT	2	6	5811	5816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017798	CTT	2	6	5841	5846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017798	TAA	2	6	5854	5859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017798	CTG	2	6	5890	5895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017798	CTT	2	6	5920	5925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017798	N	163	163	6683	6845	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017798	ATGC	2	8	6852	6859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017798	T	6	6	6867	6872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017798	CAT	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017798	TCC	2	6	6910	6915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017798	TCC	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017798	TCC	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017798	CAT	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017798	CAT	3	9	6973	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017798	T	6	6	7018	7023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017798	TTC	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017798	TCA	2	6	7053	7058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017798	CT	3	6	7066	7071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017798	CTT	2	6	7083	7088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017798	CAA	2	6	7094	7099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017798	TTC	2	6	7119	7124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017798	TTTA	2	8	7130	7137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017798	ACTT	2	8	7161	7168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017798	TAA	2	6	7183	7188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017798	A	6	6	7232	7237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017798	TTAT	2	8	7246	7253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017798	TAT	2	6	7257	7262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017798	ATTT	2	8	7274	7281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017798	TAA	2	6	7295	7300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017798	AT	3	6	7319	7324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017798	TTAAA	2	10	7333	7342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017798	A	6	6	7367	7372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017798	CTT	2	6	7400	7405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017798	TAT	2	6	7422	7427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017798	CAC	2	6	8440	8445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017798	CAT	2	6	8446	8451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017798	TTC	2	6	8463	8468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017798	N	1182	1182	8487	9668	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017798	AGT	2	6	9768	9773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017798	TAT	2	6	9791	9796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017798	TAA	2	6	9824	9829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017798	TACA	2	8	9851	9858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017798	CAT	2	6	9896	9901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017798	CTT	2	6	9911	9916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017798	AAG	2	6	10006	10011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017798	AAT	2	6	10014	10019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017798	TAAT	2	8	10046	10053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017798	AT	3	6	10098	10103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017798	ATT	2	6	10106	10111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017798	TAT	3	9	10127	10135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017798	TGT	2	6	10141	10146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017798	A	7	7	10183	10189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017798	ATTT	2	8	10208	10215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017798	ATG	2	6	10301	10306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017798	A	8	8	10322	10329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017798	GAA	2	6	10348	10353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017798	TTA	2	6	10357	10362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017798	ACAAAA	2	12	10371	10382	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017798	AT	4	8	10404	10411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017798	T	6	6	10416	10421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017798	ACAA	2	8	10440	10447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017798	A	6	6	10446	10451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017798	ATG	2	6	10520	10525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017798	AAT	3	9	10540	10548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017798	ATT	2	6	10550	10555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017798	TAAA	2	8	10592	10599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017798	TAA	2	6	10614	10619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017798	TAC	2	6	10620	10625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017798	A	6	6	10637	10642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017798	AAT	2	6	10678	10683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017798	GAA	2	6	10705	10710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017798	CAAATA	2	12	10744	10755	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017798	AAT	2	6	10854	10859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017798	CAA	2	6	10912	10917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017798	A	6	6	10944	10949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017798	ATG	2	6	10973	10978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017798	AAC	2	6	10988	10993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017798	N	1594	1594	11025	12618	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017798	AATA	2	8	12622	12629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017798	A	8	8	12677	12684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017798	GA	3	6	12771	12776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017798	TAT	2	6	12777	12782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017798	AAAT	2	8	12818	12825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017798	A	6	6	12833	12838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017798	AAAGG	2	10	12851	12860	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017798	AAG	2	6	12861	12866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017798	ACA	2	6	12884	12889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017798	A	6	6	12901	12906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017798	GCT	2	6	12915	12920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017798	ATTA	2	8	12937	12944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017798	TA	3	6	12950	12955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017798	TAAT	3	12	12957	12968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017798	TGA	2	6	12978	12983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017798	AACTTA	2	12	12992	13003	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_017798	AAAAG	2	10	13079	13088	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017798	AT	3	6	13189	13194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017798	A	6	6	13201	13206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017798	AAT	2	6	13209	13214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017798	AAG	2	6	13252	13257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_017798	ATT	2	6	13340	13345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017798	ATT	2	6	13357	13362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017798	A	6	6	13405	13410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017798	ACA	2	6	13428	13433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_017798	ATAA	2	8	13442	13449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017798	TAC	2	6	13470	13475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_017798	AT	3	6	13512	13517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017798	AT	3	6	13524	13529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017798	TGC	2	6	13534	13539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_017798	ATA	2	6	13695	13700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017798	TA	3	6	13735	13740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017798	AT	3	6	13767	13772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017798	TAC	2	6	13773	13778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_017798	AAG	2	6	13790	13795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017798	A	7	7	13852	13858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017798	ATA	3	9	13909	13917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017798	A	6	6	13925	13930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017798	AT	3	6	13958	13963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017798	ATA	2	6	13968	13973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_017798	AT	3	6	13975	13980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017798	AGA	2	6	14055	14060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017798	ATT	2	6	14108	14113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_017798	AAT	2	6	14351	14356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017798	TAT	2	6	14399	14404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_017798	CTAC	2	8	14454	14461	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.