MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TATTT	2	10	2451	2460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017787	ATTAT	2	10	9795	9804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017787	ATTTT	2	10	11583	11592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017787	GAGAG	2	10	11714	11723	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017787	CAAAA	2	10	15532	15541	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017787	AATAA	2	10	15577	15586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017787	TAGTT	2	10	15637	15646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017787	TGTCT	2	10	15969	15978	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017787	TAAAA	2	10	19229	19238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017787	CTTTA	2	10	19265	19274	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017787	ATTTA	2	10	19960	19969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017787	CTTTT	2	10	21219	21228	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017787	TTATT	2	10	24051	24060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017787	ATCAT	2	10	24066	24075	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017787	TAAAA	2	10	25345	25354	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017787	CTTTA	2	10	25381	25390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017787	TTATT	2	10	25403	25412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017787	CTTTT	2	10	30725	30734	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017787	ATTTT	2	10	30810	30819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017787	ATATG	2	10	39657	39666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017787	ATAAA	2	10	39848	39857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017787	ATATT	2	10	43266	43275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017787	GAGAG	2	10	45977	45986	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017787	TAAAG	2	10	48124	48133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017787	AATAA	2	10	49554	49563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017787	TAAAG	2	10	49578	49587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017787	CTCTT	2	10	49906	49915	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.