MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 493

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TA	3	6	554	559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017787	ATT	2	6	560	565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017787	ATC	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017787	TAAA	2	8	834	841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017787	ACA	2	6	845	850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017787	N	641	641	875	1515	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017787	A	6	6	1520	1525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017787	GTCA	2	8	1562	1569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017787	TAT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017787	ATA	2	6	1578	1583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017787	A	6	6	1583	1588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017787	A	6	6	1606	1611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017787	TAAA	2	8	1665	1672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017787	AGA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017787	AAATAA	2	12	1681	1692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017787	A	7	7	1691	1697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017787	AG	3	6	1705	1710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017787	ATT	2	6	1769	1774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017787	A	6	6	1815	1820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017787	GTT	2	6	1956	1961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017787	CAAA	2	8	1968	1975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017787	ATA	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017787	A	6	6	2023	2028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017787	GTA	2	6	2060	2065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017787	AT	3	6	2068	2073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017787	TAG	2	6	2133	2138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017787	TTA	2	6	2165	2170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017787	TTTATA	2	12	2196	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017787	TAG	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017787	TA	3	6	2231	2236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017787	T	6	6	2248	2253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017787	AAAT	2	8	2310	2317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017787	TAT	2	6	2335	2340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017787	T	6	6	2350	2355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017787	ATT	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017787	TA	3	6	2375	2380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017787	TTTA	2	8	2382	2389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017787	TTTA	2	8	2409	2416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017787	TATTT	2	10	2451	2460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017787	GTT	2	6	2474	2479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017787	AAT	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017787	TAA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017787	TTTA	2	8	2943	2950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017787	TTATTT	2	12	3000	3011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017787	TTA	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017787	T	6	6	3050	3055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017787	TGC	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017787	TTTA	2	8	3069	3076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017787	AAT	2	6	3100	3105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017787	A	7	7	3125	3131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017787	TAT	2	6	3132	3137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017787	A	6	6	3149	3154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017787	GTA	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017787	CAAA	2	8	3184	3191	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017787	ATTA	2	8	3281	3288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017787	CAAA	2	8	3293	3300	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017787	T	6	6	3319	3324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017787	GAT	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017787	N	518	518	3349	3866	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017787	A	6	6	3871	3876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017787	GTCA	2	8	3913	3920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017787	TAT	2	6	3921	3926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017787	ATA	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017787	A	6	6	3934	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017787	A	6	6	3957	3962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017787	AGA	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017787	AAATAA	2	12	4032	4043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017787	A	7	7	4042	4048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017787	AG	3	6	4056	4061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017787	A	6	6	4074	4079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017787	TTA	2	6	4122	4127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017787	TA	4	8	6147	6154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017787	T	6	6	6237	6242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017787	T	6	6	6245	6250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017787	A	6	6	6263	6268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017787	AGG	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017787	TTA	2	6	6371	6376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017787	TGAAGG	2	12	6412	6423	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017787	TCA	2	6	6473	6478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017787	GAT	2	6	6482	6487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017787	T	6	6	6548	6553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017787	GAA	2	6	6562	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017787	T	7	7	6571	6577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017787	TAG	2	6	6792	6797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017787	AGG	2	6	6798	6803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017787	AGA	2	6	6810	6815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017787	AAGG	2	8	6826	6833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017787	AT	3	6	8476	8481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017787	ATTA	2	8	8493	8500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017787	TAAT	2	8	8508	8515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017787	AGG	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017787	CT	3	6	8534	8539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017787	T	8	8	8539	8546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017787	ATTAT	2	10	9795	9804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017787	ATT	2	6	9810	9815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017787	T	7	7	9862	9868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017787	T	6	6	9880	9885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017787	TTA	2	6	9894	9899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017787	ATT	3	9	9924	9932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017787	ATGA	2	8	9950	9957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017787	T	6	6	9977	9982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017787	A	6	6	11372	11377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017787	A	7	7	11414	11420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017787	ATA	2	6	11500	11505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017787	ATTC	2	8	11563	11570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017787	TTTG	2	8	11575	11582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017787	ATTTT	2	10	11583	11592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017787	T	6	6	11589	11594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017787	A	7	7	11622	11628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017787	ATAA	2	8	11630	11637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017787	AGG	2	6	11639	11644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017787	GAA	2	6	11646	11651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017787	AAG	2	6	11669	11674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017787	AG	3	6	11690	11695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017787	GAA	2	6	11708	11713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017787	GAGAG	2	10	11714	11723	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017787	AG	3	6	11725	11730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017787	AG	3	6	11734	11739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017787	AGA	2	6	11743	11748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017787	ATA	2	6	11749	11754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017787	ATG	3	9	11767	11775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017787	GGA	2	6	11794	11799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017787	TGAG	2	8	11825	11832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017787	N	1277	1277	11838	13114	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017787	GAA	2	6	13124	13129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017787	AG	3	6	13154	13159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017787	AATT	2	8	13162	13169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017787	GTA	2	6	13238	13243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017787	GCA	2	6	13250	13255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017787	GTG	3	9	13257	13265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017787	AGC	2	6	13276	13281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017787	AAG	2	6	13910	13915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017787	TAAG	2	8	13917	13924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017787	ATC	2	6	14337	14342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017787	TGC	3	9	14379	14387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017787	ACA	2	6	14395	14400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017787	AGG	2	6	14421	14426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017787	GCA	2	6	14464	14469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017787	ATC	2	6	14520	14525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017787	AGG	2	6	14547	14552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017787	AGA	2	6	14556	14561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017787	GAGT	2	8	14576	14583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017787	TTA	2	6	14596	14601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017787	AGA	2	6	14610	14615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017787	N	878	878	14638	15515	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017787	CAAAA	2	10	15532	15541	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017787	A	6	6	15538	15543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017787	A	7	7	15563	15569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017787	AATAA	2	10	15577	15586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017787	AGA	2	6	15619	15624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017787	TAGTT	2	10	15637	15646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017787	CTT	2	6	15650	15655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017787	T	6	6	15654	15659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.