MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017778	ATTTT	2	10	432	441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017778	ACAAT	2	10	694	703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017778	TCAAT	2	10	774	783	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017778	TAATA	2	10	1119	1128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017778	ACCAT	2	10	3407	3416	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017778	AATAA	2	10	4554	4563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017778	ATTAT	2	10	4697	4706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017778	ATGTT	2	10	4719	4728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017778	AAATT	2	10	5708	5717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017778	ATTTT	2	10	8537	8546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017778	TAATT	2	10	8623	8632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017778	TTATA	2	10	8682	8691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017778	TTTTA	2	10	10424	10433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017778	ATTTA	2	10	13056	13065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017778	ATTTA	2	10	32423	32432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017778	CTTCT	2	10	40679	40688	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017778	AATAA	2	10	40797	40806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017778	ATTTA	2	10	41765	41774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017778	TTTAA	2	10	45672	45681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017778	ATATA	2	10	45937	45946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017778	TTAAA	2	10	46476	46485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017778	TAAAA	2	10	49527	49536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017778	TATAT	2	10	49575	49584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017778	AAATA	2	10	51529	51538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017778	ATTAT	2	10	58707	58716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017778	ATGTA	2	10	63818	63827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017778	TTTAA	2	10	65026	65035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017778	TTACA	2	10	65979	65988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017778	ATATA	2	10	66095	66104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017778	AATAT	2	10	67151	67160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017778	TTAAA	2	10	68492	68501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017778	TAAAA	2	10	68596	68605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017778	GTATG	2	10	70239	70248	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017778	ATATT	2	10	78698	78707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017778	ATTAA	2	10	78730	78739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017778	TAATT	2	10	78756	78765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017778	ATACC	2	10	82423	82432	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017778	CAAAA	2	10	85995	86004	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017778	TTATA	2	10	86053	86062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017778	TAATA	2	10	86065	86074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017778	TATAA	2	10	86085	86094	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017778	TATAA	2	10	88382	88391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017778	ATCAC	2	10	88419	88428	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017778	AATAT	2	10	91998	92007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017778	TATTT	2	10	95693	95702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017778	CAAAA	2	10	96030	96039	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017778	ATTAA	2	10	97275	97284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017778	AATTT	2	10	100106	100115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017778	ATTTA	2	10	104946	104955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017778	TAAAT	2	10	105004	105013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017778	AAATT	2	10	107889	107898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017778	ATTAT	2	10	110742	110751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017778	TTAAA	2	10	118046	118055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017778	TAAAT	2	10	119869	119878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017778	TTAAT	2	10	119937	119946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017778	TTAAT	2	10	121624	121633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017778	ATAAA	2	10	123001	123010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017778	GTATA	2	10	127560	127569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017778	TTCAA	2	10	127691	127700	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017778	AAAAT	2	10	131905	131914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017778	AAATA	2	10	131956	131965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017778	AAAAT	2	10	135521	135530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017778	ATTAA	2	10	139118	139127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017778	CTACA	2	10	139146	139155	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017778	AGATT	2	10	139470	139479	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017778	TTTTA	2	10	140467	140476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017778	TAATT	2	10	142483	142492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017778	CTTTA	2	10	150898	150907	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017778	TTTTG	2	10	151973	151982	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017778	TTAAT	2	10	153078	153087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017778	GTTTT	2	10	153405	153414	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017778	TTTTG	2	10	161625	161634	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017778	TTAAT	2	10	161691	161700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017778	TTAAT	2	10	166278	166287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017778	ATTTT	2	10	169371	169380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.