MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid cp26

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017725	TAA	2	6	295	300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017725	TAA	2	6	771	776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017725	TCC	2	6	3801	3806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017725	TAT	2	6	3927	3932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017725	TAA	2	6	6492	6497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017725	ATT	2	6	6518	6523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017725	TAT	2	6	7669	7674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017725	AAC	2	6	7737	7742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017725	TAA	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017725	TAA	2	6	8492	8497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017725	TAA	2	6	8599	8604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017725	ATT	2	6	8709	8714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017725	ATA	2	6	8736	8741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017725	AAT	2	6	8742	8747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017725	CAA	2	6	8836	8841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017725	TAT	2	6	8900	8905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017725	AAG	2	6	9002	9007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017725	AGT	2	6	9123	9128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017725	AAT	2	6	9339	9344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017725	GAA	2	6	9450	9455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017725	TTG	2	6	10631	10636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017725	AAT	2	6	10646	10651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017725	ATT	2	6	10691	10696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017725	ATA	3	9	11316	11324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017725	AAT	2	6	11347	11352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017725	TAA	2	6	11356	11361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017725	TAG	2	6	11605	11610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017725	AAT	2	6	11654	11659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017725	ATT	2	6	11788	11793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017725	ATT	2	6	11829	11834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017725	TAT	2	6	12114	12119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017725	AAT	2	6	12128	12133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017725	ATT	2	6	12239	12244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017725	AAT	2	6	12315	12320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017725	AAG	2	6	12379	12384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017725	AAT	2	6	12427	12432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017725	TTA	2	6	14228	14233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017725	ATT	2	6	14239	14244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017725	TTA	2	6	14251	14256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017725	ATT	2	6	14320	14325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017725	ATT	2	6	14335	14340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017725	CCT	2	6	14343	14348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017725	GTT	2	6	14355	14360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017725	TAC	2	6	14969	14974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017725	CTT	2	6	15032	15037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017725	TAT	2	6	15105	15110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017725	CAG	2	6	15209	15214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017725	CTA	2	6	15229	15234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017725	TCT	2	6	15262	15267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017725	TTC	2	6	15297	15302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017725	TGT	2	6	15307	15312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017725	GTT	2	6	15331	15336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017725	TTA	2	6	17242	17247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017725	AAT	2	6	17335	17340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017725	AAT	2	6	17346	17351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017725	AAT	2	6	17357	17362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017725	ATT	2	6	17386	17391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017725	ATT	2	6	17397	17402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017725	TTG	2	6	17432	17437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017725	TAA	2	6	17441	17446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017725	AGG	2	6	17458	17463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017725	TAT	2	6	18121	18126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017725	TAA	2	6	18300	18305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017725	ATA	2	6	18415	18420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017725	TGA	2	6	18478	18483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017725	CTC	2	6	19929	19934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017725	TTA	2	6	19972	19977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017725	AAC	3	9	21422	21430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017725	TTA	2	6	25167	25172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017725	AAT	2	6	25192	25197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017725	TAA	3	9	25229	25237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017725	TAT	3	9	25313	25321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017725	TAT	2	6	25374	25379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017725	TAA	2	6	25414	25419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017725	AAC	2	6	27082	27087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.