MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir chromosome linear

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017717	AATTT	2	10	7999	8008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017717	TAAAT	2	10	19675	19684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017717	AATTA	2	10	22428	22437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017717	TTATT	2	10	56496	56505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017717	AAAAT	3	15	80632	80646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017717	TACAA	2	10	107868	107877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017717	TTAAT	2	10	114391	114400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017717	TAAAA	2	10	130886	130895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017717	TTATA	2	10	130898	130907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017717	AAAAC	2	10	137672	137681	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017717	ATTAT	2	10	143802	143811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017717	AAAAT	2	10	150356	150365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017717	TAAAA	2	10	150405	150414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017717	ATCAG	2	10	169074	169083	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017717	TTTAA	2	10	188897	188906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017717	CTATT	2	10	193275	193284	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017717	GTCAA	2	10	202353	202362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017717	TCTTT	2	10	205844	205853	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017717	AAATT	2	10	208266	208275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017717	TAAAA	2	10	243780	243789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017717	TAAAA	2	10	244483	244492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017717	ATAAA	2	10	244532	244541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017717	TAAAA	2	10	245614	245623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017717	AGAAA	2	10	247375	247384	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017717	TTTAA	2	10	249027	249036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017717	TAAAA	2	10	251974	251983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017717	AACAA	2	10	262635	262644	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017717	TTTAT	2	10	272535	272544	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017717	TATAA	3	15	272592	272606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017717	TTTTA	2	10	272635	272644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017717	TAATT	2	10	326798	326807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017717	ATAAA	2	10	354285	354294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017717	AGCAA	2	10	355776	355785	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017717	TAAAA	2	10	360027	360036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017717	AAAAT	2	10	387366	387375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017717	ATCTA	2	10	411121	411130	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017717	TTTGT	2	10	411177	411186	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017717	TAAAA	2	10	411409	411418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017717	TTAAT	2	10	411497	411506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017717	TAAAA	2	10	435977	435986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017717	CTCCC	2	10	438482	438491	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
42	NC_017717	TAAAA	2	10	439221	439230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017717	CTCCC	2	10	441726	441735	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
44	NC_017717	ATTAA	2	10	444597	444606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017717	AAAAG	2	10	446931	446940	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017717	AAAAC	2	10	451805	451814	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017717	TTTAT	2	10	461915	461924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017717	AATTC	2	10	466389	466398	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017717	AAATA	2	10	466449	466458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017717	ATATT	2	10	467730	467739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017717	ATGTT	2	10	467758	467767	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017717	TTTTG	2	10	467830	467839	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017717	AAATT	2	10	467881	467890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017717	CTTAT	2	10	472166	472175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017717	AATTG	2	10	473665	473674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017717	AGTTT	2	10	475051	475060	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017717	TTGTT	2	10	478123	478132	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017717	TAATA	2	10	483600	483609	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017717	AATGT	2	10	484955	484964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017717	TTTTA	2	10	487922	487931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017717	ATGTT	2	10	488058	488067	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017717	GCTTT	2	10	494790	494799	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017717	TAAGT	2	10	498996	499005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017717	TTTGC	2	10	515630	515639	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017717	TTTAA	2	10	529733	529742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017717	GTTAT	2	10	536738	536747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017717	GTTTA	2	10	536766	536775	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017717	TTTTA	2	10	542050	542059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017717	TTAAT	2	10	544909	544918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017717	GATTT	2	10	566777	566786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017717	TATTT	2	10	578439	578448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017717	TGATT	2	10	578514	578523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017717	AAATT	2	10	579844	579853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017717	TATTT	2	10	586479	586488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017717	AAATT	2	10	586561	586570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017717	TTTTA	2	10	590493	590502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017717	ATTTG	2	10	593650	593659	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017717	GGATA	2	10	609567	609576	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017717	TCTTT	2	10	610542	610551	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017717	GTGAA	2	10	612797	612806	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017717	ATTAA	2	10	612994	613003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017717	GTTTT	2	10	621332	621341	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017717	ATGTT	2	10	621360	621369	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017717	TATAT	2	10	637077	637086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017717	AATTA	2	10	645856	645865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017717	TTATT	2	10	648208	648217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017717	TTTTA	2	10	659861	659870	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017717	GATTT	2	10	665112	665121	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017717	TAAAT	2	10	665535	665544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017717	TTAAA	2	10	689088	689097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017717	TATAT	2	10	690895	690904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017717	ATTTT	2	10	702559	702568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017717	TAATT	2	10	705537	705546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017717	TTTTA	2	10	717363	717372	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017717	TATAA	2	10	726757	726766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017717	ATATT	2	10	736583	736592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017717	ATTAT	2	10	745183	745192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017717	ATTTT	2	10	747447	747456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017717	TGTGT	2	10	747703	747712	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017717	TTTAT	2	10	778049	778058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017717	AAGCA	2	10	780240	780249	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017717	TCCTT	2	10	784615	784624	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017717	ATTAA	2	10	786031	786040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017717	CTTAA	2	10	801651	801660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017717	ATTAT	2	10	801663	801672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017717	TTATT	2	10	803825	803834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017717	GGCAA	2	10	804170	804179	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017717	TGCAA	2	10	812163	812172	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017717	AAATT	2	10	815871	815880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017717	CTTTT	2	10	821108	821117	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017717	GTAAT	2	10	821145	821154	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017717	ATTTA	2	10	823130	823139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017717	ATATA	2	10	862458	862467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017717	AGTTT	2	10	868821	868830	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017717	AAATG	2	10	871104	871113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017717	TGTTT	2	10	871567	871576	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017717	TGTTA	2	10	888805	888814	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017717	TTTAT	2	10	890549	890558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.