MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-8

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017426	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017426	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017426	AGG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017426	TA	3	6	15179	15184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017426	CTA	2	6	17243	17248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017426	ATA	2	6	17274	17279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017426	TAA	3	9	17325	17333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017426	A	7	7	17332	17338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017426	TCC	2	6	18847	18852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017426	TAA	2	6	18862	18867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017426	TA	3	6	18873	18878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017426	T	6	6	18900	18905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017426	A	8	8	18920	18927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017426	TAT	2	6	18979	18984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017426	TGTAG	2	10	19045	19054	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017426	ATCA	2	8	19072	19079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017426	TAA	2	6	19123	19128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017426	T	6	6	19142	19147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017426	TAA	2	6	19186	19191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017426	ATT	2	6	19195	19200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017426	GA	3	6	19216	19221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017426	TAT	2	6	21622	21627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017426	A	8	8	21628	21635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017426	T	6	6	21650	21655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017426	T	6	6	21669	21674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017426	TGA	2	6	22959	22964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017426	TAT	2	6	22969	22974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017426	T	6	6	23023	23028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017426	TTTTA	2	10	23052	23061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017426	ACAAAT	2	12	23062	23073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017426	ATT	2	6	23104	23109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017426	ATT	2	6	23125	23130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017426	TAA	2	6	23132	23137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017426	TTA	2	6	23161	23166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017426	TAA	2	6	23187	23192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017426	ATTA	2	8	23200	23207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017426	TAA	2	6	23208	23213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017426	A	6	6	23232	23237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017426	ATT	2	6	23249	23254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017426	AGG	2	6	23266	23271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017426	TTA	2	6	23278	23283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017426	TTTG	2	8	23318	23325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017426	T	8	8	23343	23350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017426	TA	4	8	23391	23398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017426	A	6	6	23414	23419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017426	ATA	2	6	23472	23477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017426	TAAA	2	8	23483	23490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017426	T	7	7	23499	23505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017426	T	6	6	23512	23517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017426	A	6	6	23520	23525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017426	TA	3	6	23547	23552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017426	ATT	2	6	23553	23558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017426	AGG	2	6	23572	23577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017426	A	6	6	24918	24923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017426	AAT	2	6	24931	24936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017426	AAGTAA	2	12	26218	26229	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017426	AT	3	6	26235	26240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017426	TGCA	2	8	26304	26311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017426	AGG	2	6	26325	26330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017426	TAA	2	6	26335	26340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017426	AGA	2	6	26343	26348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017426	GGT	2	6	26362	26367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017426	AAGA	2	8	26372	26379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017426	AT	3	6	26396	26401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017426	AATTT	2	10	26416	26425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017426	AGT	2	6	26453	26458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017426	GA	3	6	26471	26476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017426	TA	3	6	26543	26548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017426	ATT	2	6	26571	26576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017426	GA	3	6	27257	27262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017426	TA	3	6	28300	28305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017426	ATA	2	6	28329	28334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017426	T	7	7	28342	28348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017426	ATA	2	6	28370	28375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017426	A	6	6	28401	28406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017426	TTTA	2	8	28434	28441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017426	TA	3	6	28440	28445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017426	CT	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017426	AATA	2	8	29048	29055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017426	ATA	2	6	29085	29090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.