MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-12

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017423	T	6	6	2	7	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017423	AT	5	10	33	42	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017423	TAA	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017423	AGG	2	6	3364	3369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017423	TAAA	2	8	4941	4948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017423	TAA	2	6	10330	10335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017423	T	8	8	15108	15115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017423	TA	3	6	15137	15142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017423	AT	4	8	15143	15150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017423	A	6	6	15159	15164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017423	AGT	2	6	16451	16456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017423	TCC	2	6	17525	17530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017423	TAT	2	6	17531	17536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017423	ACT	2	6	17541	17546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017423	AAT	2	6	17547	17552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017423	A	7	7	17560	17566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017423	T	7	7	17581	17587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017423	ATT	2	6	17594	17599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017423	A	7	7	17602	17608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017423	CT	3	6	17625	17630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017423	TAT	2	6	17660	17665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017423	ATA	2	6	17684	17689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017423	GTA	2	6	17729	17734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017423	A	6	6	17780	17785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017423	ATTAA	2	10	17789	17798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017423	TTAAT	2	10	17799	17808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017423	T	7	7	17824	17830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017423	ATTA	2	8	17872	17879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017423	ATA	2	6	17889	17894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017423	T	6	6	20358	20363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017423	ATA	2	6	21565	21570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017423	TAT	2	6	21589	21594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017423	A	6	6	21617	21622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017423	ATTT	2	8	21627	21634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017423	T	7	7	21632	21638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017423	ATTT	2	8	21649	21656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017423	AAG	2	6	21706	21711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017423	T	7	7	21729	21735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017423	A	6	6	21738	21743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017423	A	7	7	21751	21757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017423	T	7	7	21772	21778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017423	ATT	2	6	21786	21791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017423	AGT	2	6	21792	21797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017423	ATA	2	6	21802	21807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017423	GGA	2	6	21808	21813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017423	A	7	7	23181	23187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017423	GGA	2	6	23200	23205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017423	AAGTAA	2	12	24456	24467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017423	AT	3	6	24473	24478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017423	A	6	6	24510	24515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017423	GT	3	6	24531	24536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017423	GGAT	2	8	24564	24571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017423	CA	3	6	24605	24610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017423	TG	3	6	24628	24633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017423	AT	3	6	24634	24639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017423	AATTT	2	10	24654	24663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017423	ATT	2	6	24782	24787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017423	AATTGT	2	12	24801	24812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017423	TTA	2	6	25662	25667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017423	T	7	7	25674	25680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017423	AGT	2	6	25756	25761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017423	TAT	2	6	25802	25807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.