MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-7

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017422	TGA	2	6	1846	1851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017422	TAC	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017422	TAC	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017422	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017422	TTA	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017422	ATT	2	6	2119	2124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017422	TAA	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017422	AAC	2	6	2182	2187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017422	AGG	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017422	TGA	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017422	TGA	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017422	AGA	2	6	2235	2240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017422	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017422	CTT	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017422	ATC	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017422	ATG	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017422	TCT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017422	TTG	2	6	2641	2646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017422	AAT	2	6	2694	2699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017422	ATG	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017422	TGA	4	12	2781	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017422	TGA	2	6	2865	2870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017422	AGA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017422	TCA	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017422	ATA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017422	CTA	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017422	ATA	2	6	5005	5010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017422	TAA	2	6	5034	5039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017422	TAA	3	9	5056	5064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017422	TAG	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017422	TAA	2	6	6515	6520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017422	TAT	3	9	6635	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017422	GTA	2	6	6706	6711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017422	TAA	2	6	6783	6788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017422	ATT	2	6	6854	6859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017422	AAG	2	6	9845	9850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017422	TTG	2	6	10644	10649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017422	TAA	2	6	10668	10673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017422	TTA	2	6	10877	10882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017422	AAT	3	9	10920	10928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017422	CAA	2	6	10974	10979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017422	TCT	2	6	11013	11018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017422	AGT	2	6	11073	11078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017422	TTG	2	6	11170	11175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017422	ATA	2	6	11320	11325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017422	ATT	2	6	11374	11379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017422	CAA	2	6	11416	11421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017422	AAT	3	9	11439	11447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017422	AGT	2	6	11496	11501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017422	TGC	2	6	11630	11635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017422	TAA	2	6	11696	11701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017422	TTG	2	6	11803	11808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017422	TAG	2	6	11815	11820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017422	ACT	2	6	12152	12157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017422	CAA	2	6	12160	12165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017422	AGG	2	6	12266	12271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017422	AGA	2	6	13647	13652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017422	AGT	2	6	13757	13762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017422	ATT	2	6	13875	13880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017422	TAA	2	6	15194	15199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017422	TGT	2	6	15267	15272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017422	TAA	2	6	15875	15880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017422	ATA	2	6	15923	15928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.