MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp25

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017420	A	6	6	113	118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017420	T	7	7	151	157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017420	T	9	9	205	213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017420	A	7	7	214	220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017420	T	9	9	239	247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017420	T	6	6	386	391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017420	T	6	6	393	398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017420	A	6	6	4246	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017420	A	7	7	4310	4316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017420	A	7	7	4487	4493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017420	A	6	6	4591	4596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017420	T	6	6	4686	4691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017420	T	6	6	4969	4974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017420	A	7	7	5294	5300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017420	A	6	6	5680	5685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017420	T	6	6	5839	5844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017420	T	6	6	5876	5881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017420	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017420	T	7	7	5920	5926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017420	A	6	6	5927	5932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017420	T	6	6	6070	6075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017420	T	7	7	6230	6236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017420	T	7	7	6470	6476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017420	A	6	6	6625	6630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017420	A	7	7	7567	7573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017420	T	6	6	7697	7702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017420	A	6	6	7899	7904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017420	A	7	7	7933	7939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017420	T	6	6	8001	8006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017420	T	6	6	8078	8083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017420	T	7	7	8151	8157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017420	T	7	7	8235	8241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017420	A	7	7	8244	8250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017420	T	6	6	8262	8267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017420	T	6	6	8295	8300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017420	T	7	7	8339	8345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017420	A	6	6	8567	8572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017420	T	6	6	8632	8637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017420	A	6	6	8891	8896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017420	A	6	6	8904	8909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017420	A	7	7	8933	8939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017420	T	6	6	9071	9076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017420	T	8	8	9162	9169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017420	A	6	6	9264	9269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017420	A	6	6	10555	10560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017420	T	6	6	10573	10578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017420	T	6	6	10658	10663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017420	A	7	7	10758	10764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017420	T	6	6	10853	10858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017420	A	6	6	10872	10877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017420	T	7	7	10907	10913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017420	A	6	6	11130	11135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017420	A	6	6	14360	14365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017420	T	6	6	14372	14377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017420	A	6	6	14772	14777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017420	A	6	6	15394	15399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017420	A	6	6	15664	15669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017420	T	6	6	15830	15835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017420	A	7	7	15942	15948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017420	A	7	7	16051	16057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017420	T	6	6	16091	16096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017420	T	6	6	16102	16107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017420	A	6	6	16120	16125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017420	A	8	8	16204	16211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017420	A	6	6	16262	16267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017420	A	7	7	16282	16288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017420	A	6	6	16308	16313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017420	A	7	7	16319	16325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017420	T	6	6	16378	16383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017420	A	6	6	16571	16576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017420	A	6	6	16664	16669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017420	A	6	6	16809	16814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017420	T	8	8	16909	16916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017420	G	6	6	16930	16935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017420	A	6	6	16941	16946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017420	T	6	6	17036	17041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017420	A	6	6	17109	17114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017420	A	6	6	17205	17210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017420	A	7	7	17259	17265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017420	T	6	6	17455	17460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017420	A	7	7	17576	17582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017420	A	6	6	17711	17716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017420	A	7	7	17905	17911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017420	A	8	8	17923	17930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017420	A	6	6	18023	18028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017420	A	7	7	18331	18337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017420	G	8	8	18443	18450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017420	T	7	7	18456	18462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017420	T	7	7	18471	18477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017420	A	7	7	18666	18672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017420	A	6	6	18816	18821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017420	A	6	6	18878	18883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017420	A	6	6	19027	19032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017420	T	7	7	19229	19235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017420	T	7	7	19553	19559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017420	T	7	7	20095	20101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017420	A	7	7	20273	20279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017420	A	6	6	20716	20721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017420	A	7	7	20761	20767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017420	A	7	7	20789	20795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017420	A	6	6	20979	20984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017420	T	8	8	21129	21136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017420	A	7	7	21304	21310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017420	A	6	6	21360	21365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017420	A	9	9	21416	21424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017420	A	7	7	21554	21560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017420	A	7	7	21614	21620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017420	T	6	6	21770	21775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017420	T	6	6	22667	22672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017420	T	7	7	22777	22783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017420	A	6	6	22791	22796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017420	T	6	6	23046	23051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017420	T	7	7	23112	23118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017420	T	6	6	23251	23256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017420	T	7	7	23310	23316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.