MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 chromosome

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017418	TA	3	6	425	430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017418	TA	3	6	1580	1585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017418	AT	3	6	1682	1687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017418	AT	3	6	1820	1825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017418	AT	4	8	2162	2169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017418	AT	3	6	2654	2659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017418	AT	3	6	8149	8154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017418	TA	3	6	19839	19844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017418	AT	3	6	20512	20517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017418	TA	3	6	20560	20565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017418	AT	3	6	48929	48934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017418	TA	3	6	48956	48961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017418	AT	3	6	58718	58723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017418	AT	3	6	65527	65532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017418	TC	3	6	65965	65970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017418	AT	3	6	66020	66025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017418	TA	3	6	66437	66442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017418	AT	3	6	66701	66706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017418	TA	3	6	83561	83566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017418	TG	3	6	85419	85424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017418	AT	3	6	86483	86488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017418	AC	3	6	101036	101041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017418	TA	3	6	105483	105488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017418	TA	3	6	112449	112454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017418	AT	3	6	114386	114391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017418	AC	3	6	120250	120255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017418	AT	3	6	130753	130758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017418	TA	3	6	130778	130783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017418	TA	3	6	133479	133484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017418	AT	3	6	137839	137844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017418	TC	4	8	148513	148520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017418	CT	3	6	148705	148710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017418	TC	4	8	149192	149199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017418	AT	3	6	149468	149473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017418	AT	3	6	150021	150026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017418	AG	3	6	159694	159699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017418	AT	3	6	164482	164487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017418	TA	3	6	170756	170761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017418	CA	3	6	174631	174636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017418	TA	3	6	189483	189488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017418	CA	3	6	189630	189635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017418	AC	3	6	193143	193148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017418	TA	4	8	193177	193184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017418	CA	3	6	193349	193354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017418	AT	3	6	202289	202294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017418	AT	4	8	205729	205736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017418	AC	3	6	205816	205821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017418	AT	3	6	205937	205942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017418	AT	3	6	208300	208305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017418	AG	3	6	208337	208342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017418	TA	3	6	228045	228050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017418	TA	3	6	230401	230406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017418	AT	3	6	237099	237104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017418	AT	3	6	241226	241231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017418	TA	4	8	251888	251895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017418	TC	3	6	301667	301672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017418	AT	3	6	316876	316881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017418	AT	3	6	325512	325517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017418	AT	3	6	326600	326605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017418	TA	3	6	333729	333734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017418	CT	3	6	345668	345673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017418	AC	3	6	373048	373053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017418	AT	3	6	391847	391852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017418	AT	3	6	396349	396354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017418	AT	3	6	404052	404057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017418	TA	3	6	404453	404458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017418	AT	3	6	415331	415336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017418	AT	3	6	434204	434209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017418	TC	3	6	435362	435367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017418	GC	3	6	435368	435373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017418	CT	3	6	435509	435514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017418	TA	3	6	436730	436735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017418	TA	3	6	437147	437152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017418	AT	4	8	437173	437180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017418	AT	3	6	437447	437452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017418	TC	3	6	438605	438610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017418	GC	3	6	438611	438616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017418	CT	3	6	438752	438757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017418	TA	3	6	439975	439980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017418	TA	3	6	440392	440397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017418	TC	3	6	441389	441394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017418	AT	3	6	441402	441407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017418	AC	3	6	442119	442124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017418	AT	3	6	442328	442333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017418	TA	3	6	442341	442346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017418	TA	3	6	442604	442609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017418	CT	3	6	443340	443345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017418	GT	3	6	443552	443557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017418	GT	3	6	443721	443726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017418	TA	3	6	443908	443913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017418	TA	3	6	443951	443956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017418	TA	3	6	444353	444358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017418	TC	3	6	445017	445022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017418	AT	3	6	449737	449742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017418	AT	3	6	449746	449751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017418	TA	3	6	455357	455362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017418	TA	3	6	457023	457028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017418	AT	3	6	457087	457092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017418	AT	3	6	473417	473422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017418	GA	3	6	479917	479922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017418	TC	3	6	479997	480002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017418	GA	3	6	481056	481061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017418	TC	3	6	481134	481139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017418	TA	3	6	481382	481387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017418	AT	4	8	483558	483565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017418	AG	3	6	488551	488556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017418	TA	4	8	489453	489460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017418	TG	3	6	490779	490784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017418	AT	3	6	490851	490856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017418	AG	3	6	491024	491029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017418	AT	3	6	495063	495068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017418	CT	3	6	495074	495079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017418	AG	3	6	525130	525135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017418	TA	3	6	526171	526176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017418	GT	3	6	530690	530695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017418	AG	3	6	541015	541020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017418	AG	3	6	541864	541869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017418	AT	3	6	550740	550745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017418	TG	3	6	552754	552759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017418	AT	3	6	567888	567893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017418	AG	4	8	570545	570552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017418	CT	4	8	570560	570567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017418	AT	3	6	576014	576019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017418	TA	3	6	582112	582117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017418	TA	3	6	582669	582674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017418	TA	3	6	583680	583685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017418	TA	3	6	588939	588944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017418	TA	3	6	588991	588996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017418	AT	3	6	598074	598079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017418	AT	3	6	598107	598112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017418	TA	3	6	598166	598171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017418	AT	3	6	599543	599548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017418	TA	3	6	617322	617327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017418	TA	3	6	617434	617439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017418	AT	3	6	627697	627702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017418	AT	3	6	627725	627730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017418	AT	4	8	627735	627742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017418	TA	3	6	627749	627754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017418	TA	3	6	629428	629433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017418	AT	3	6	633194	633199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017418	AT	3	6	633223	633228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017418	AT	3	6	652533	652538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017418	TA	3	6	657530	657535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017418	TA	3	6	660207	660212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017418	TA	3	6	660214	660219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017418	TA	3	6	660223	660228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017418	TA	3	6	671899	671904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017418	AT	3	6	671984	671989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017418	TA	3	6	673509	673514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017418	TA	3	6	687021	687026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017418	TA	3	6	694260	694265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017418	AT	3	6	699625	699630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017418	TA	3	6	699648	699653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017418	TA	4	8	704226	704233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.