MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 chromosome

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017418	AATG	2	8	75	82	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017418	AGGA	2	8	1731	1738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017418	TCCC	2	8	2040	2047	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_017418	AATT	2	8	2127	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017418	AAAT	2	8	2198	2205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017418	GGCA	2	8	2239	2246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017418	AAAT	2	8	2407	2414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017418	AAAG	2	8	2732	2739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017418	AAGT	2	8	7229	7236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017418	TTAT	2	8	8143	8150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017418	TAAT	2	8	19779	19786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017418	TTTA	2	8	19892	19899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017418	AATA	2	8	20220	20227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017418	ATCT	2	8	20245	20252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017418	ATTT	2	8	25328	25335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017418	ATTT	2	8	37756	37763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017418	ATTT	2	8	40355	40362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017418	AATT	2	8	46054	46061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017418	GCTA	2	8	46084	46091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017418	AAGC	2	8	46480	46487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017418	ATTT	2	8	46598	46605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017418	CTGC	2	8	46628	46635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017418	AATC	2	8	47509	47516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017418	ATTT	2	8	58650	58657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017418	ATTT	2	8	58683	58690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017418	CAAA	2	8	60180	60187	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017418	AAAC	2	8	65626	65633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017418	ACAT	2	8	65781	65788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017418	AATT	2	8	65809	65816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017418	AAAT	2	8	66033	66040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017418	TTTA	2	8	66079	66086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017418	CAAA	2	8	93702	93709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017418	ATTT	2	8	101001	101008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017418	TTTA	2	8	107856	107863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017418	TTAG	2	8	112441	112448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017418	TACT	2	8	114295	114302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017418	CAAG	2	8	114333	114340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017418	ATAA	2	8	114397	114404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017418	AGCA	2	8	137596	137603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017418	ATTT	2	8	137911	137918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017418	CAAA	2	8	137958	137965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017418	TTAA	2	8	143875	143882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017418	ATTA	2	8	143900	143907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017418	GACA	2	8	148631	148638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017418	ATTA	2	8	148822	148829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017418	ATTT	2	8	149341	149348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017418	CCTT	2	8	149432	149439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017418	GATT	2	8	149741	149748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017418	TTTC	2	8	150000	150007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017418	ATTA	2	8	150253	150260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017418	TACT	2	8	150368	150375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017418	AAAT	2	8	150563	150570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017418	GGTA	2	8	156014	156021	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017418	TAAA	2	8	158122	158129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017418	AAAT	2	8	162661	162668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017418	CTTA	2	8	162672	162679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017418	ATTA	2	8	169025	169032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017418	TAAA	2	8	169039	169046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017418	ATTT	2	8	171138	171145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017418	TAAT	2	8	182484	182491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017418	AAAT	2	8	188124	188131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017418	TTTA	2	8	188163	188170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017418	ATCT	2	8	188671	188678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017418	TCAA	2	8	189645	189652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017418	CAAA	2	8	189764	189771	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017418	AAAT	2	8	191123	191130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017418	TAAA	2	8	191136	191143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017418	TATT	2	8	193287	193294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017418	TTTA	2	8	205776	205783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017418	ATTT	2	8	206053	206060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017418	ATTT	2	8	206144	206151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017418	TACA	2	8	208255	208262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017418	TAAA	2	8	208263	208270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017418	AAAT	3	12	220480	220491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017418	TAAT	2	8	220492	220499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017418	AATA	2	8	228005	228012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017418	AATA	2	8	230427	230434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017418	TCAA	2	8	237123	237130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017418	AAAT	2	8	237970	237977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017418	TAAA	2	8	244236	244243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017418	TTAA	2	8	244404	244411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017418	AATT	2	8	248924	248931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017418	ATTT	2	8	251118	251125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017418	ATTA	2	8	262746	262753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017418	TGAA	2	8	275357	275364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017418	GCTT	2	8	275430	275437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017418	CCTC	2	8	302572	302579	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_017418	ATTA	2	8	325132	325139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017418	TAAA	2	8	325170	325177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017418	ATAA	2	8	329595	329602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017418	TTTA	2	8	333408	333415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017418	AATA	2	8	333445	333452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017418	CATA	2	8	333646	333653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017418	AAAT	2	8	333669	333676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017418	GAAA	2	8	335385	335392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017418	AAAC	2	8	335418	335425	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017418	TAAA	2	8	337067	337074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017418	CTTT	2	8	343758	343765	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017418	TAAA	2	8	345218	345225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017418	TCAT	2	8	346160	346167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017418	TATT	2	8	354175	354182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017418	ATAG	2	8	364444	364451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017418	ATTC	2	8	367218	367225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017418	AATA	2	8	373029	373036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017418	ATTT	2	8	373037	373044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017418	ATAG	2	8	383046	383053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017418	TATT	2	8	390678	390685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017418	AATA	2	8	390693	390700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017418	CAAA	2	8	391809	391816	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017418	ACAA	2	8	392904	392911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017418	TTTA	2	8	394078	394085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017418	TCCT	2	8	408232	408239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017418	AAAT	2	8	410272	410279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017418	TATT	2	8	411890	411897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017418	TTAT	2	8	415391	415398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017418	AATT	2	8	415399	415406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017418	CTTA	2	8	415411	415418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017418	AAGC	2	8	417198	417205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017418	AAAT	2	8	423358	423365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017418	TTAT	2	8	423487	423494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017418	TAAA	2	8	427468	427475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017418	AAAT	2	8	433984	433991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017418	TACG	2	8	435327	435334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017418	ACCT	2	8	435391	435398	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017418	CTAC	2	8	435461	435468	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017418	GTTT	2	8	436221	436228	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017418	CTAA	2	8	436355	436362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017418	TCGC	2	8	436845	436852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017418	TAGC	2	8	436944	436951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017418	ATTT	2	8	437123	437130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017418	TACG	2	8	438570	438577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017418	ACCT	2	8	438634	438641	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017418	CTAC	2	8	438704	438711	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017418	GTTT	2	8	439465	439472	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017418	CTAA	2	8	439600	439607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017418	TCGC	2	8	440090	440097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017418	TAGC	2	8	440189	440196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017418	AAAT	2	8	440504	440511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017418	TAAA	2	8	442202	442209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017418	TAAA	2	8	442409	442416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017418	TAAT	2	8	442559	442566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017418	GCTT	2	8	443006	443013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017418	TTCT	2	8	444231	444238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017418	AATT	2	8	444762	444769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017418	CTTA	2	8	444999	445006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017418	AATC	2	8	445737	445744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017418	AATA	2	8	445758	445765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017418	AAAG	2	8	446665	446672	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017418	AAAC	2	8	447459	447466	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017418	AATA	2	8	447489	447496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017418	CATT	2	8	455224	455231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017418	TAGA	2	8	455329	455336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017418	ATAA	2	8	560762	560769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.