MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 chromosome

Total Repeats: 936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017418	CAA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017418	ACT	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017418	AAC	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017418	TTC	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017418	TAA	2	6	347	352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017418	CTT	2	6	379	384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017418	GTT	2	6	470	475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017418	ATT	2	6	496	501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017418	ACA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017418	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017418	TCT	2	6	1740	1745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017418	AAT	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017418	TAT	2	6	1873	1878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017418	TCA	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017418	ACA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017418	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017418	AGA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017418	TAT	2	6	2271	2276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017418	TCT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017418	TTG	2	6	2703	2708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017418	ACC	2	6	2713	2718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017418	AAG	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017418	TAA	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017418	CTT	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017418	ATC	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017418	ATT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017418	TTA	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017418	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017418	ATT	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017418	AAT	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017418	AAT	2	6	3145	3150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017418	GAA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017418	ATA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017418	AAT	2	6	5030	5035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017418	TAA	2	6	8124	8129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017418	TAT	2	6	8159	8164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017418	TAA	2	6	8177	8182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017418	TAT	2	6	15684	15689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017418	TCC	2	6	19773	19778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017418	AAT	2	6	19819	19824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017418	CTT	2	6	19903	19908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017418	GAA	2	6	19944	19949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017418	AAG	2	6	19990	19995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017418	TTC	2	6	20062	20067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017418	GAA	2	6	20088	20093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017418	AAT	2	6	20307	20312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017418	ATT	2	6	20323	20328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017418	AAC	2	6	20341	20346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017418	ACT	2	6	20350	20355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017418	AAT	2	6	20410	20415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017418	TTA	2	6	20540	20545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017418	CAA	2	6	22405	22410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017418	TAA	2	6	25343	25348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017418	ATA	2	6	25355	25360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017418	ATA	2	6	29122	29127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017418	TAA	2	6	31167	31172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017418	TTA	2	6	31729	31734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017418	AAC	2	6	39270	39275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017418	TAA	2	6	39279	39284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017418	TAA	2	6	39295	39300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017418	ACT	2	6	39305	39310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017418	ATT	2	6	39330	39335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017418	TAT	2	6	39372	39377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017418	TAA	2	6	40332	40337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017418	TAT	2	6	40344	40349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017418	ATA	2	6	40381	40386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017418	TAA	2	6	45017	45022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017418	TAA	2	6	45041	45046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017418	ATA	2	6	45630	45635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017418	TCC	2	6	46014	46019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017418	ATT	2	6	46148	46153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017418	ATG	2	6	46201	46206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017418	ACC	2	6	46423	46428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017418	CAA	2	6	46530	46535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017418	AGC	2	6	46553	46558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017418	TTA	2	6	46584	46589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017418	TTA	2	6	46690	46695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017418	ACA	2	6	46714	46719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017418	TAA	2	6	49645	49650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017418	TAA	2	6	49654	49659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017418	TAC	2	6	49704	49709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017418	ACA	2	6	49721	49726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017418	TTA	2	6	52065	52070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017418	TCC	2	6	53097	53102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017418	ATT	2	6	53129	53134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017418	AAC	2	6	53147	53152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017418	AAT	2	6	56394	56399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017418	TAA	3	9	56866	56874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017418	ATT	2	6	57626	57631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017418	ATT	2	6	58615	58620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017418	ATT	3	9	58702	58710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017418	AAT	2	6	62702	62707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017418	AGG	2	6	64906	64911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017418	ACA	2	6	65429	65434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017418	ACA	2	6	65567	65572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017418	CTT	2	6	65708	65713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017418	ATA	2	6	65828	65833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017418	ATA	2	6	65843	65848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017418	CAA	2	6	65871	65876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017418	AAT	2	6	65938	65943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017418	TAA	2	6	65985	65990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017418	CTA	3	9	66308	66316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017418	ATT	2	6	66414	66419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017418	TAA	2	6	66427	66432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017418	ACA	2	6	66453	66458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017418	TGA	2	6	66640	66645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017418	AAT	2	6	66719	66724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017418	CTT	2	6	66775	66780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017418	TAA	2	6	72242	72247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017418	ATT	2	6	79025	79030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017418	TAA	2	6	79034	79039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017418	ATA	2	6	79078	79083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017418	TAA	2	6	80464	80469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017418	TAT	2	6	80551	80556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017418	TAT	2	6	80561	80566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017418	TAA	2	6	80572	80577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017418	ATT	2	6	85364	85369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017418	AAT	2	6	85426	85431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017418	ATA	2	6	86532	86537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017418	ATA	2	6	93680	93685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017418	TTA	2	6	93695	93700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017418	AAT	2	6	93783	93788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017418	CTT	2	6	93790	93795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017418	ATA	2	6	93827	93832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017418	ATA	2	6	98275	98280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017418	ATA	2	6	98336	98341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017418	TAA	2	6	98381	98386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017418	TAA	2	6	98404	98409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017418	GAT	2	6	98423	98428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017418	TAA	2	6	100988	100993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017418	ATA	2	6	102604	102609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017418	AGA	2	6	104950	104955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017418	ATA	2	6	105005	105010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017418	AAT	2	6	105013	105018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017418	ATA	2	6	105473	105478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017418	TTA	2	6	106525	106530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017418	TAA	2	6	106580	106585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017418	TAA	2	6	107807	107812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017418	ATT	2	6	107888	107893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017418	TAA	2	6	107894	107899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017418	CAA	2	6	112428	112433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017418	CAA	2	6	112473	112478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017418	AAT	2	6	112515	112520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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