MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	AAAC	2	8	9	16	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017415	TACC	2	8	651	658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017415	AGAT	2	8	735	742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017415	TTGT	2	8	963	970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017415	AGAA	2	8	1034	1041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017415	TCTA	2	8	1357	1364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017415	CAAC	2	8	2439	2446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017415	TTGA	2	8	2511	2518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017415	AAAT	2	8	2813	2820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017415	TCTT	2	8	2896	2903	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017415	ATTT	2	8	2933	2940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017415	ATTT	2	8	2960	2967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017415	ATTT	2	8	4627	4634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017415	AACA	2	8	4676	4683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017415	AATA	2	8	4691	4698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017415	ATTT	2	8	8613	8620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017415	ATTA	2	8	17250	17257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017415	ATTA	2	8	17382	17389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017415	ATTA	2	8	17515	17522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017415	ATTA	2	8	17649	17656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017415	ATTA	2	8	17782	17789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017415	ATTA	2	8	17915	17922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017415	ATTA	2	8	18046	18053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017415	ATTA	2	8	18178	18185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017415	ATTA	2	8	18311	18318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017415	ATTA	2	8	18444	18451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017415	ATTA	2	8	18577	18584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017415	ATTA	2	8	18705	18712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017415	ATTA	2	8	18834	18841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017415	ATTA	2	8	18963	18970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017415	ATTA	2	8	19094	19101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017415	ATTA	2	8	19226	19233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017415	AATT	2	8	19412	19419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017415	TAAA	2	8	25771	25778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017415	TTGA	2	8	26246	26253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017415	GAAT	2	8	26394	26401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017415	TAAT	2	8	26454	26461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017415	ATAG	2	8	26475	26482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.