MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	TAAT	2	8	72	79	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017410	AAGA	2	8	481	488	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017410	ATTT	2	8	564	571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017410	ATTT	3	12	694	705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017410	ATTT	2	8	782	789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017410	ATAA	2	8	874	881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017410	AATT	2	8	1010	1017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017410	TAAA	2	8	1302	1309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017410	TAAA	2	8	1394	1401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017410	TTCT	2	8	1413	1420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017410	CTAA	2	8	1744	1751	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017410	ATAA	2	8	1848	1855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017410	ATAA	2	8	2143	2150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017410	TAAA	2	8	2341	2348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017410	GAAG	2	8	2520	2527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017410	ATAA	2	8	3707	3714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017410	ATTA	2	8	3742	3749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017410	CTTA	2	8	3933	3940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017410	ACTT	2	8	4279	4286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017410	TCTT	2	8	4362	4369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017410	TAAT	2	8	4938	4945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017410	ATTA	2	8	4951	4958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017410	ACAA	2	8	4993	5000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017410	CATT	2	8	5070	5077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017410	TTTA	2	8	5184	5191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017410	ATAA	3	12	5386	5397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017410	TTTA	2	8	6732	6739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017410	TATT	2	8	7373	7380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017410	TAAT	2	8	7419	7426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017410	ACCA	2	8	10420	10427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017410	ATTT	2	8	10897	10904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017410	TTAT	2	8	11182	11189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017410	TAAG	2	8	11221	11228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017410	AAAT	2	8	11285	11292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017410	TAAA	2	8	12377	12384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017410	AAAT	2	8	12540	12547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017410	ATTT	2	8	12576	12583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017410	AATT	2	8	12669	12676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017410	GTAA	2	8	12693	12700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017410	ACCA	2	8	12840	12847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017410	AGAT	2	8	12914	12921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017410	AAAT	2	8	12962	12969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017410	ATAA	2	8	12970	12977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017410	AAGC	2	8	13118	13125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017410	TTAT	2	8	13301	13308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017410	TAAT	2	8	13804	13811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017410	TAAT	2	8	13825	13832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017410	TAAT	2	8	13846	13853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017410	TAAT	2	8	13867	13874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017410	TAAT	2	8	13888	13895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017410	TAAT	2	8	13909	13916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017410	TAAT	2	8	13930	13937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017410	TAAT	2	8	13951	13958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017410	ATTT	2	8	15095	15102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017410	ATAA	2	8	15201	15208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017410	AAAT	2	8	15673	15680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017410	GATT	2	8	15727	15734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017410	AATT	2	8	16248	16255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017410	CTTT	2	8	16331	16338	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017410	TTTA	2	8	17057	17064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017410	TAAA	2	8	17071	17078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.