MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	TTAT	2	8	3281	3288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017409	ATTT	2	8	3390	3397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017409	AAAG	2	8	3419	3426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017409	AATT	2	8	3471	3478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017409	TAAA	2	8	3503	3510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017409	ATAG	2	8	3523	3530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017409	ATTT	2	8	3685	3692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017409	AATT	2	8	3862	3869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017409	ATTA	2	8	3892	3899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017409	TTGT	2	8	4022	4029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017409	AGAA	2	8	4183	4190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017409	ATTA	2	8	4408	4415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017409	TACT	2	8	4550	4557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017409	ATTT	2	8	4947	4954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017409	TTTA	2	8	5260	5267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017409	AAAT	2	8	6073	6080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017409	TATT	2	8	6363	6370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017409	TCAT	2	8	6883	6890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017409	TTTA	2	8	6986	6993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017409	AAAT	2	8	7132	7139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017409	TTTA	2	8	7146	7153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017409	TATT	2	8	7367	7374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017409	AATA	2	8	9156	9163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017409	TATG	2	8	9426	9433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017409	TTAA	2	8	9536	9543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017409	ATTA	2	8	14126	14133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017409	TATG	2	8	14192	14199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017409	GAAA	2	8	14653	14660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017409	TAAA	2	8	14823	14830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017409	TAAG	2	8	14903	14910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017409	CATA	2	8	15376	15383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017409	TTTA	2	8	15597	15604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017409	ATTT	2	8	16155	16162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017409	TAAT	2	8	16507	16514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017409	AAGA	2	8	16699	16706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017409	AGTA	2	8	17173	17180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017409	ATCA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017409	GTAG	2	8	17528	17535	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017409	AAAT	2	8	17646	17653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017409	AAGA	2	8	19346	19353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017409	AGTA	2	8	19822	19829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017409	ATCA	2	8	19844	19851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017409	TTTA	2	8	21238	21245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017409	CTTT	2	8	22477	22484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017409	ATCA	2	8	22545	22552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017409	ATTT	2	8	22610	22617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017409	TAAT	2	8	22742	22749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.