MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	ATG	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017409	TCT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017409	CTA	2	6	3664	3669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017409	TTA	2	6	3795	3800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017409	CCT	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017409	CAC	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017409	TAG	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017409	GAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017409	ATT	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017409	ATT	2	6	4093	4098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017409	ATT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017409	ATA	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017409	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017409	TTA	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017409	TTA	2	6	4281	4286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017409	AAT	2	6	4308	4313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017409	AAG	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017409	GAA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017409	TTA	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017409	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017409	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017409	ATA	2	6	4613	4618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017409	TAC	2	6	4675	4680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017409	CTA	3	9	4716	4724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017409	TAT	2	6	4751	4756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017409	CAA	2	6	4795	4800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017409	ATT	3	9	4810	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017409	ATT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017409	TAA	2	6	4931	4936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017409	ATT	2	6	4939	4944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017409	TTA	2	6	5033	5038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017409	TTA	2	6	5057	5062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017409	TAA	2	6	5066	5071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017409	ATC	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017409	AAT	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017409	ATT	2	6	5145	5150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017409	TGT	2	6	5234	5239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017409	TCA	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017409	AAT	2	6	5881	5886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017409	CTA	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017409	ACA	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017409	TAA	2	6	6067	6072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017409	AGA	2	6	6145	6150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017409	TAA	2	6	6195	6200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017409	TCT	2	6	6213	6218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017409	AGA	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017409	TAA	3	9	6339	6347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017409	AAT	2	6	6464	6469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017409	AAT	2	6	6474	6479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017409	AAT	2	6	6581	6586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017409	ATA	2	6	6898	6903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017409	CAA	2	6	7023	7028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017409	ATT	2	6	7048	7053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017409	TAA	2	6	7069	7074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017409	ATT	2	6	7107	7112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017409	TAA	2	6	7163	7168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017409	CTT	2	6	7341	7346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017409	TGA	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017409	TAA	2	6	7639	7644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017409	TAC	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017409	AAC	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017409	TAT	2	6	7769	7774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017409	TTA	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017409	AAT	2	6	7827	7832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017409	AGA	2	6	7835	7840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017409	TTA	2	6	7851	7856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017409	ATG	2	6	7918	7923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017409	CCT	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017409	TAA	2	6	8606	8611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017409	TAT	3	9	9131	9139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017409	AGA	2	6	9150	9155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017409	TAT	2	6	9195	9200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017409	TAT	3	9	9284	9292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017409	CAC	2	6	9403	9408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017409	ATA	2	6	9461	9466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017409	CCT	2	6	12659	12664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017409	ATA	2	6	12695	12700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017409	GGC	2	6	12854	12859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017409	GTT	2	6	12860	12865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017409	TTC	2	6	12931	12936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017409	TAT	2	6	12967	12972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017409	AGT	2	6	12983	12988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017409	ATT	2	6	13058	13063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017409	GCT	2	6	13093	13098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017409	CTC	2	6	13135	13140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017409	TAG	2	6	13188	13193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017409	ATT	2	6	13730	13735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017409	TCC	2	6	13835	13840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017409	ATT	2	6	13914	13919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017409	TAT	2	6	14005	14010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017409	ACT	2	6	14029	14034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017409	ATA	3	9	14094	14102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017409	AAT	2	6	14107	14112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017409	TAT	2	6	14114	14119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017409	ATT	2	6	14259	14264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017409	TAA	2	6	14344	14349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017409	ATA	2	6	14424	14429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017409	TAA	2	6	14453	14458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017409	ATA	2	6	14461	14466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017409	AGT	2	6	14550	14555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017409	TAA	2	6	14609	14614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017409	TAA	2	6	14669	14674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017409	TAA	2	6	14736	14741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017409	TGA	2	6	14749	14754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017409	TAA	3	9	15050	15058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017409	AGA	2	6	15228	15233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017409	TAA	2	6	15577	15582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017409	AGT	2	6	15608	15613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017409	CAA	2	6	15686	15691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017409	TTC	3	9	15740	15748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017409	AAG	2	6	15751	15756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017409	AAT	2	6	15838	15843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017409	ATA	2	6	15853	15858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017409	TAA	2	6	15882	15887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017409	ATT	2	6	15907	15912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017409	TAA	2	6	15952	15957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017409	AAT	2	6	15976	15981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017409	ATG	2	6	16069	16074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017409	TAA	2	6	16145	16150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017409	TGA	2	6	16182	16187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017409	CTC	2	6	16202	16207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017409	TGA	2	6	16319	16324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017409	AGA	2	6	16329	16334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017409	TAA	2	6	16359	16364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017409	AAT	2	6	16415	16420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017409	TAT	2	6	16431	16436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017409	TTA	2	6	16531	16536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017409	ATA	2	6	16573	16578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017409	TTA	2	6	16707	16712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017409	TTA	2	6	16732	16737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017409	TAA	2	6	16832	16837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017409	TAA	2	6	16921	16926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017409	TTA	2	6	17025	17030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017409	GTA	3	9	17036	17044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017409	TGA	2	6	17056	17061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017409	TTA	2	6	17365	17370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017409	AGT	2	6	17561	17566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017409	GTA	2	6	17616	17621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017409	ATT	3	9	17673	17681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017409	GAT	2	6	17745	17750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017409	AAG	2	6	17790	17795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017409	TTA	2	6	17842	17847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017409	ACT	2	6	17860	17865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017409	TAG	2	6	17890	17895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.