MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-5

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017406	CAAC	2	8	571	578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017406	TTGA	2	8	643	650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017406	AAAT	2	8	945	952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017406	TCTT	2	8	1028	1035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017406	ATTT	2	8	1065	1072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017406	ATTT	2	8	1092	1099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017406	ATTT	2	8	2758	2765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017406	AACA	2	8	2807	2814	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017406	AATA	2	8	2822	2829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017406	AAAT	2	8	4734	4741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017406	CAAA	2	8	4784	4791	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017406	TAAG	2	8	5155	5162	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017406	TATT	2	8	6555	6562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017406	ACCA	2	8	6964	6971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017406	TTAT	2	8	10975	10982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017406	ATTT	2	8	11084	11091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017406	AAAG	2	8	11113	11120	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017406	AATT	2	8	11165	11172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017406	TAAA	2	8	11197	11204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017406	ATAG	2	8	11206	11213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017406	ATTT	2	8	11365	11372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017406	AATT	2	8	11544	11551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017406	ATTA	2	8	11574	11581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017406	TTGT	2	8	11708	11715	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017406	ATTA	2	8	12095	12102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017406	TCAA	2	8	12186	12193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017406	ATTA	2	8	12228	12235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017406	TCAA	2	8	12319	12326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017406	ATTA	2	8	12361	12368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017406	TCAA	2	8	12452	12459	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017406	ATTA	2	8	12494	12501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017406	TCAA	2	8	12585	12592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017406	ATTA	2	8	12627	12634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017406	TCAA	2	8	12718	12725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017406	ATTA	2	8	12760	12767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017406	TCAA	2	8	12851	12858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017406	ATTA	2	8	12893	12900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017406	TCAA	2	8	12984	12991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017406	ATTA	2	8	13026	13033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017406	TCAA	2	8	13117	13124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017406	ATTA	2	8	13159	13166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017406	TCAA	2	8	13250	13257	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017406	ATTA	2	8	13292	13299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017406	TCAA	2	8	13383	13390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017406	ATTA	2	8	13425	13432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017406	TCAA	2	8	13515	13522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017406	ATTA	2	8	13557	13564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017406	TCAA	2	8	13648	13655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017406	ATTA	2	8	13690	13697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017406	TCAA	2	8	13778	13785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017406	ATTA	2	8	13820	13827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017406	TCAA	2	8	13911	13918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017406	ATTA	2	8	13953	13960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017406	TCAA	2	8	14044	14051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017406	ATTA	2	8	14086	14093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017406	TCAA	2	8	14177	14184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017406	ATTA	2	8	14219	14226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017406	TCAA	2	8	14310	14317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017406	ATTA	2	8	14352	14359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017406	TCAA	2	8	14443	14450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017406	ATTA	2	8	14485	14492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017406	TCAA	2	8	14576	14583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017406	ATTA	2	8	14618	14625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017406	TCAA	2	8	14709	14716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017406	ATTA	2	8	14751	14758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017406	TCAA	2	8	14842	14849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017406	ATTA	2	8	14884	14891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017406	TCAA	2	8	14975	14982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017406	ATTA	2	8	15017	15024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017406	TCAA	2	8	15108	15115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017406	ATTA	2	8	15150	15157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017406	TCAA	2	8	15241	15248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017406	ATTA	2	8	15283	15290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017406	TCAA	2	8	15374	15381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017406	ATTA	2	8	15416	15423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017406	ACGT	2	8	15528	15535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017406	TCCA	2	8	19154	19161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017406	TTAT	2	8	20098	20105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017406	TATG	2	8	20543	20550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017406	TATT	2	8	20551	20558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017406	ATAA	2	8	20598	20605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017406	ATTG	2	8	21262	21269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017406	ATAA	2	8	21324	21331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017406	CTTT	2	8	21370	21377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017406	TTTA	2	8	22555	22562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017406	TCTT	2	8	22947	22954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017406	TAGT	2	8	23032	23039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017406	TTAT	2	8	23305	23312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017406	TTTA	2	8	23718	23725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017406	ATTT	2	8	24591	24598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.