MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	T	6	6	6	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017405	TAACTT	2	12	57	68	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017405	ATA	2	6	93	98	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017405	T	8	8	160	167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017405	AAT	2	6	179	184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017405	TAA	2	6	224	229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017405	TAT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017405	T	8	8	909	916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017405	A	8	8	935	942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017405	A	7	7	945	951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017405	A	6	6	969	974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017405	ATA	2	6	986	991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017405	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017405	A	6	6	1379	1384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017405	AT	3	6	1430	1435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017405	ATAA	2	8	1445	1452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017405	TA	3	6	1701	1706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017405	TTAT	2	8	1735	1742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017405	TAAAC	2	10	1764	1773	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017405	TTC	3	9	1797	1805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017405	TA	4	8	1849	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017405	AAG	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017405	GA	3	6	1874	1879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017405	TAT	2	6	1914	1919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017405	T	6	6	1927	1932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017405	AAAG	2	8	1937	1944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017405	AGT	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017405	AG	3	6	1992	1997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017405	TA	3	6	2053	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017405	AAT	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017405	T	6	6	2069	2074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017405	TAA	2	6	2079	2084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017405	ATT	2	6	2099	2104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017405	T	6	6	2103	2108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017405	TAG	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017405	CT	3	6	2221	2226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017405	T	6	6	3061	3066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017405	TA	3	6	3078	3083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017405	T	6	6	3084	3089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017405	A	7	7	3090	3096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017405	ATTA	2	8	3127	3134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017405	TC	3	6	3136	3141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017405	T	8	8	3160	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017405	T	7	7	3177	3183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017405	TA	3	6	3204	3209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017405	A	6	6	3212	3217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017405	TAA	2	6	3287	3292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017405	A	7	7	3306	3312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017405	TCA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017405	GAT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017405	A	6	6	3424	3429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017405	A	6	6	3433	3438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017405	ATT	2	6	3445	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017405	AAT	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017405	T	6	6	3478	3483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017405	A	6	6	3489	3494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017405	ATT	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017405	AAGA	2	8	3522	3529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017405	ATC	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017405	TA	3	6	3627	3632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017405	GTAA	2	8	3634	3641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017405	ACCA	2	8	3726	3733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017405	ATT	2	6	3765	3770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017405	T	6	6	3789	3794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017405	A	7	7	3808	3814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017405	TCA	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017405	TAA	3	9	3846	3854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017405	TTAT	2	8	7737	7744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017405	CTT	2	6	7760	7765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017405	T	7	7	7793	7799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017405	A	7	7	7806	7812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017405	ATTT	2	8	7850	7857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017405	ATT	2	6	7898	7903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017405	AATT	2	8	7918	7925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017405	TTA	2	6	7930	7935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017405	ATTT	2	8	7936	7943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017405	T	6	6	7941	7946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017405	TTAA	2	8	7958	7965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017405	A	6	6	7975	7980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017405	T	6	6	7984	7989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017405	T	6	6	8454	8459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017405	TTAA	2	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017405	ATT	2	6	8588	8593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017405	TAT	2	6	8598	8603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017405	TA	4	8	8631	8638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017405	TCT	2	6	8657	8662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017405	T	6	6	8688	8693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017405	AAT	2	6	8710	8715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017405	TAAA	2	8	8739	8746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017405	T	8	8	8768	8775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017405	A	6	6	8782	8787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017405	ATG	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017405	CAA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017405	TAA	2	6	8875	8880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017405	T	7	7	8890	8896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017405	T	6	6	8904	8909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017405	TAAT	2	8	8978	8985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017405	T	6	6	8985	8990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017405	ACT	2	6	9031	9036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017405	AGT	2	6	9063	9068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017405	TCA	2	6	9069	9074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017405	TA	3	6	9253	9258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017405	TAAA	2	8	9266	9273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017405	ATA	2	6	9315	9320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017405	AT	3	6	9323	9328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017405	T	6	6	9328	9333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017405	TTC	2	6	9340	9345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017405	TA	3	6	9359	9364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017405	A	6	6	9373	9378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017405	ATA	2	6	9442	9447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017405	ATT	2	6	9471	9476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017405	GAT	2	6	9525	9530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017405	AGATT	2	10	9610	9619	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017405	AAT	2	6	9690	9695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017405	ACT	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017405	A	8	8	9727	9734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017405	T	7	7	9810	9816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017405	TGAATA	2	12	9823	9834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017405	A	6	6	9834	9839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017405	TCAC	2	8	10525	10532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017405	CTA	2	6	10533	10538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017405	TA	5	10	10537	10546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017405	CA	3	6	10613	10618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017405	AT	3	6	10625	10630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017405	TTA	2	6	10673	10678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017405	A	7	7	10711	10717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017405	TTTAT	2	10	10718	10727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017405	TA	3	6	10748	10753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017405	ATA	3	9	10751	10759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017405	ATT	2	6	10767	10772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017405	AAAGCT	2	12	10779	10790	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017405	TGA	2	6	10809	10814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017405	TAA	2	6	10864	10869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017405	ATA	2	6	10940	10945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017405	ACT	2	6	10973	10978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017405	GCTTT	2	10	11019	11028	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017405	T	10	10	11030	11039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017405	A	6	6	11040	11045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017405	GTCT	2	8	11046	11053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017405	CTT	2	6	11079	11084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017405	T	7	7	11089	11095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017405	T	7	7	11104	11110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017405	ATC	2	6	11178	11183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017405	ATTTT	2	10	11205	11214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017405	A	7	7	11254	11260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017405	ATT	2	6	11323	11328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017405	ATT	2	6	11342	11347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017405	TAT	2	6	11363	11368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017405	T	7	7	11368	11374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017405	A	6	6	11444	11449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017405	GCT	2	6	11488	11493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017405	T	6	6	11648	11653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017405	TAA	2	6	11664	11669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017405	CTA	2	6	11685	11690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017405	TTTA	2	8	11691	11698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017405	ATT	2	6	11715	11720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_017405	TATT	2	8	20105	20112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_017405	T	7	7	20117	20123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017405	TA	3	6	26436	26441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_017405	T	6	6	26495	26500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017405	TTA	2	6	26503	26508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_017405	T	6	6	28445	28450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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