MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-1

Total Repeats: 520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017404	TAG	2	6	44	49	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017404	GCA	2	6	76	81	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017404	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017404	TAT	2	6	159	164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017404	ACT	2	6	208	213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017404	AAC	2	6	238	243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017404	TAC	2	6	263	268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017404	TAT	2	6	285	290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017404	CAA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017404	AAT	2	6	421	426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017404	ATT	2	6	456	461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017404	ACT	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017404	AAT	2	6	822	827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017404	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017404	TCT	2	6	911	916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017404	ATT	4	12	943	954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017404	TAT	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017404	TAG	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017404	TAA	2	6	2269	2274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017404	TGT	2	6	2297	2302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017404	TAT	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017404	AAT	2	6	2429	2434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017404	TTA	2	6	2447	2452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017404	TCT	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017404	TAA	2	6	2552	2557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017404	ATT	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017404	TCT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017404	TCT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017404	ATA	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017404	AAT	3	9	2871	2879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017404	TTC	2	6	2931	2936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017404	ATC	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017404	TCT	2	6	2993	2998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017404	CTT	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017404	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017404	TAA	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017404	TCT	2	6	3180	3185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017404	TAA	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017404	TAT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017404	ACT	2	6	3308	3313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017404	AAT	2	6	3317	3322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017404	TAC	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017404	AGT	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017404	AAC	2	6	3569	3574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017404	ATT	2	6	3879	3884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017404	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017404	AAC	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017404	TAC	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017404	ACT	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017404	GTA	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017404	ATT	2	6	4162	4167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017404	AGA	3	9	4255	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017404	TAA	3	9	4284	4292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017404	ATA	2	6	4446	4451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017404	TCT	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017404	TTA	2	6	4556	4561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017404	CAA	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017404	AAC	2	6	4738	4743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017404	TAA	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017404	TAT	2	6	4849	4854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017404	CAA	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017404	TAA	2	6	4902	4907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017404	ATT	2	6	4935	4940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017404	ATA	2	6	4978	4983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017404	TAA	2	6	4990	4995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017404	CTA	2	6	5006	5011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017404	ATT	2	6	5052	5057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017404	ATT	2	6	5089	5094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017404	TAA	2	6	5099	5104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017404	TTA	2	6	5121	5126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017404	ATA	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017404	TAA	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017404	GAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017404	ATT	2	6	5346	5351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017404	TTA	2	6	5397	5402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017404	AAG	2	6	5443	5448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017404	AGA	2	6	5463	5468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017404	CTT	3	9	5533	5541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017404	CTT	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017404	GAA	2	6	5592	5597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017404	TTC	2	6	5615	5620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017404	TAA	2	6	5701	5706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017404	TCT	2	6	5720	5725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017404	CGC	2	6	6016	6021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017404	ATA	2	6	6033	6038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017404	TAA	2	6	6118	6123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017404	AAT	2	6	6285	6290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017404	TTA	2	6	6316	6321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017404	TAT	2	6	6325	6330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017404	AAT	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017404	AAT	2	6	6368	6373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017404	ATA	2	6	6405	6410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017404	TAA	2	6	6504	6509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017404	ATC	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017404	TTA	2	6	6541	6546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017404	CAT	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017404	AGA	2	6	6563	6568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017404	TAA	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017404	TTA	2	6	6816	6821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017404	ATT	2	6	6827	6832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017404	TAC	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017404	TAA	2	6	6859	6864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017404	TCT	2	6	6871	6876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017404	TAT	2	6	7099	7104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017404	AAT	2	6	7158	7163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017404	CCT	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017404	AGC	2	6	7448	7453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017404	ATT	2	6	7513	7518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017404	ATT	2	6	7620	7625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017404	AAT	2	6	7649	7654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017404	TTA	2	6	7664	7669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017404	GCA	2	6	7729	7734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017404	AAT	2	6	7773	7778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017404	TTC	2	6	7787	7792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017404	TCT	2	6	7860	7865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017404	CCA	2	6	7988	7993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017404	AAG	2	6	8136	8141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017404	AGG	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017404	ATA	2	6	8220	8225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017404	ATT	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017404	ATT	2	6	8296	8301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017404	ATT	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017404	CCT	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017404	CAC	2	6	8901	8906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017404	AAT	2	6	8907	8912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017404	ACC	2	6	8937	8942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017404	TAG	2	6	9047	9052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017404	ATT	2	6	9079	9084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017404	CCT	2	6	9650	9655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017404	ATT	2	6	12118	12123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017404	ATA	2	6	12147	12152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017404	ATT	2	6	12228	12233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017404	ATT	2	6	12338	12343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017404	ATC	2	6	13361	13366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017404	GAA	2	6	13508	13513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017404	GCT	4	12	13560	13571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017404	ATT	2	6	13725	13730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017404	ATT	2	6	13739	13744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017404	ATT	2	6	13777	13782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017404	ATT	2	6	13798	13803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017404	AAT	2	6	13870	13875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017404	CTT	2	6	14809	14814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017404	GCT	2	6	14856	14861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017404	TAA	2	6	14961	14966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_017404	AGC	2	6	14997	15002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_017404	AGC	2	6	20717	20722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_017404	TGC	3	9	22512	22520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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