MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-1

Total Repeats: 695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017404	TCT	2	6	18892	18897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017404	TTA	2	6	18915	18920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017404	AGC	2	6	18962	18967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017404	AGC	3	9	19022	19030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017404	TTC	3	9	19041	19049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017404	AGC	3	9	19061	19069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017404	TCA	2	6	19077	19082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017404	AGC	2	6	19097	19102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017404	CCT	2	6	19120	19125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_017404	CTT	2	6	19139	19144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017404	TCC	2	6	19152	19157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_017404	AGC	2	6	19160	19165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017404	CAA	2	6	19168	19173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017404	GCA	3	9	19212	19220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017404	CAG	2	6	19234	19239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017404	CAC	2	6	19243	19248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017404	AGC	2	6	19256	19261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017404	AAC	2	6	19278	19283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017404	CAC	2	6	19306	19311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_017404	CAG	2	6	19312	19317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017404	CAA	2	6	19366	19371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017404	CCA	2	6	19383	19388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_017404	TCG	2	6	19405	19410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017404	CAC	2	6	19414	19419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_017404	TGC	4	12	19424	19435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017404	AGC	2	6	19436	19441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017404	CTTAAC	2	12	19442	19453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017404	ATC	2	6	19464	19469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017404	ACC	2	6	19478	19483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_017404	AGC	2	6	19487	19492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017404	AGC	3	9	19496	19504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017404	AGC	2	6	19508	19513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017404	TCT	2	6	19524	19529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017404	TTA	2	6	19547	19552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017404	CAG	2	6	19593	19598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017404	CAT	2	6	19599	19604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017404	AGC	3	9	19651	19659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017404	TTC	3	9	19670	19678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017404	AGC	3	9	19699	19707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017404	AGC	2	6	19732	19737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017404	CAG	2	6	19791	19796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017404	CAA	2	6	19800	19805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017404	GCA	4	12	19844	19855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017404	GCA	4	12	19862	19873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017404	CAC	2	6	19875	19880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_017404	CAT	2	6	19890	19895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017404	CTT	3	9	19897	19905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017404	AAC	2	6	19910	19915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017404	CAC	2	6	19938	19943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_017404	CAA	2	6	19998	20003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017404	TCG	2	6	20037	20042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017404	CAC	2	6	20046	20051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_017404	TGC	2	6	20056	20061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017404	AAC	2	6	20080	20085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017404	ACC	2	6	20107	20112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_017404	AGC	2	6	20116	20121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017404	AGC	2	6	20125	20130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017404	AGC	2	6	20137	20142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017404	TCT	2	6	20153	20158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017404	AGC	3	9	20249	20257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017404	TTC	3	9	20268	20276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017404	AGC	3	9	20294	20302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017404	ATC	2	6	20312	20317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017404	AGC	2	6	20330	20335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017404	TCC	2	6	20355	20360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_017404	CTT	2	6	20372	20377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017404	CAG	2	6	20392	20397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017404	CAA	2	6	20401	20406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017404	GCA	3	9	20445	20453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017404	CAC	3	9	20473	20481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_017404	ATT	2	6	20486	20491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017404	CTT	2	6	20492	20497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017404	AAC	2	6	20505	20510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017404	CAC	2	6	20533	20538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_017404	TCG	2	6	20629	20634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017404	CAC	2	6	20638	20643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_017404	TGC	2	6	20648	20653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017404	AGC	2	6	20654	20659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017404	CAG	2	6	20662	20667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017404	AAC	2	6	20672	20677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017404	TCC	2	6	20691	20696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_017404	ACC	2	6	20699	20704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_017404	AGC	2	6	20708	20713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017404	AGC	2	6	20717	20722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017404	AGC	2	6	20729	20734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017404	TCT	2	6	20745	20750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017404	ACC	2	6	20752	20757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_017404	TTA	2	6	20767	20772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017404	AGC	2	6	20814	20819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017404	ATT	2	6	20820	20825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017404	AGC	3	9	20868	20876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017404	TTC	3	9	20887	20895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017404	AGC	3	9	20907	20915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017404	AGC	2	6	20943	20948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017404	CAG	2	6	21002	21007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017404	CAA	2	6	21011	21016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017404	GCA	3	9	21055	21063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017404	CAG	2	6	21077	21082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017404	CAC	3	9	21083	21091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_017404	CAT	2	6	21101	21106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017404	TCT	2	6	21107	21112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017404	AAC	2	6	21118	21123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017404	CAG	3	9	21149	21157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017404	CAA	2	6	21203	21208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017404	TCG	2	6	21242	21247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017404	CAC	2	6	21251	21256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_017404	TGC	2	6	21261	21266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017404	CCTTAA	2	12	21281	21292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017404	ATC	2	6	21304	21309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017404	ACC	2	6	21318	21323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_017404	AGC	4	12	21327	21338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017404	CAG	2	6	21350	21355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017404	CAC	2	6	21359	21364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_017404	AGC	2	6	21372	21377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017404	AAC	2	6	21394	21399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017404	CAC	2	6	21422	21427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_017404	CAA	2	6	21482	21487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017404	CTCTT	2	10	21520	21529	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
619	NC_017404	CAC	2	6	21530	21535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_017404	TGC	3	9	21540	21548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017404	AGC	4	12	21549	21560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017404	AAC	2	6	21567	21572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017404	AGC	2	6	21603	21608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017404	AGC	2	6	21612	21617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017404	AGC	2	6	21624	21629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017404	TCT	2	6	21640	21645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017404	ACC	2	6	21647	21652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_017404	CAG	2	6	21695	21700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017404	TTC	2	6	21730	21735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017404	AGC	3	9	21777	21785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017404	TTC	3	9	21796	21804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017404	AGC	4	12	21822	21833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017404	TCA	2	6	21838	21843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017404	AGC	2	6	21858	21863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017404	CCT	2	6	21881	21886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_017404	CAG	2	6	21920	21925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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