MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 chromosome

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017403	TA	3	6	56	61	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017403	TA	3	6	644	649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017403	AT	3	6	8361	8366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017403	TA	3	6	20051	20056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017403	AT	3	6	49148	49153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017403	TA	3	6	49175	49180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017403	AT	3	6	58937	58942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017403	TA	3	6	83796	83801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017403	TG	3	6	85654	85659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017403	AT	3	6	86716	86721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017403	AC	3	6	101269	101274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017403	TA	3	6	105716	105721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017403	TA	3	6	112682	112687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017403	AT	3	6	114619	114624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017403	AC	3	6	120483	120488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017403	AT	3	6	130987	130992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017403	TA	3	6	131012	131017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017403	TA	3	6	133713	133718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017403	AT	3	6	138072	138077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017403	TA	3	6	139740	139745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017403	TA	3	6	140563	140568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017403	AT	3	6	141164	141169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017403	TA	4	8	141575	141582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017403	CT	3	6	141634	141639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017403	AG	3	6	159936	159941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017403	AT	3	6	164724	164729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017403	TA	3	6	170997	171002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017403	CA	3	6	174872	174877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017403	TA	3	6	189724	189729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017403	CA	3	6	189858	189863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017403	AC	3	6	193371	193376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017403	TA	4	8	193405	193412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017403	CA	3	6	193579	193584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017403	AT	3	6	202519	202524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017403	AT	4	8	205959	205966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017403	AC	3	6	206047	206052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017403	AT	3	6	206168	206173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017403	AT	3	6	208531	208536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017403	AG	3	6	208568	208573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017403	TA	3	6	219484	219489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017403	TA	3	6	228923	228928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017403	TA	3	6	231279	231284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017403	AT	3	6	237977	237982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017403	AT	3	6	242104	242109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017403	TA	4	8	252766	252773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017403	TC	3	6	302554	302559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017403	AT	3	6	317764	317769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017403	AT	3	6	326400	326405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017403	AT	3	6	327488	327493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017403	TA	3	6	334629	334634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017403	CT	3	6	346568	346573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017403	AC	3	6	373948	373953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017403	AT	3	6	392747	392752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017403	AT	3	6	397251	397256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017403	AT	3	6	404954	404959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017403	TA	3	6	405355	405360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017403	AT	3	6	416234	416239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017403	AT	3	6	435103	435108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017403	TC	3	6	436261	436266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017403	GC	3	6	436267	436272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017403	CT	3	6	436408	436413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017403	TA	3	6	437632	437637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017403	TA	3	6	438049	438054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017403	AT	4	8	438075	438082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017403	AT	3	6	438349	438354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017403	TC	3	6	439507	439512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017403	GC	3	6	439513	439518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017403	CT	3	6	439654	439659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017403	TA	3	6	440877	440882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017403	TA	3	6	441294	441299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017403	TC	3	6	442291	442296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017403	AT	3	6	442304	442309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017403	AC	3	6	443020	443025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017403	AT	3	6	443236	443241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017403	TA	3	6	443508	443513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017403	GT	3	6	444456	444461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017403	GT	3	6	444625	444630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017403	TA	3	6	444812	444817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017403	TA	3	6	444855	444860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017403	TA	3	6	445257	445262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017403	TC	3	6	445921	445926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017403	TA	3	6	446930	446935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017403	CT	3	6	447075	447080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017403	TA	3	6	447365	447370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017403	AT	3	6	447413	447418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017403	AT	3	6	450641	450646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017403	AT	3	6	450650	450655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017403	TA	3	6	456261	456266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017403	TA	3	6	457927	457932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017403	AT	3	6	457991	457996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017403	AT	3	6	474299	474304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017403	GA	3	6	480800	480805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017403	TC	3	6	480880	480885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017403	GA	3	6	481939	481944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017403	TC	3	6	482017	482022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017403	TA	3	6	482265	482270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017403	AT	4	8	484445	484452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017403	AG	3	6	489438	489443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017403	TA	4	8	490340	490347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017403	TG	3	6	491666	491671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017403	AT	3	6	491738	491743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017403	AG	3	6	491911	491916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017403	AT	3	6	495950	495955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017403	CT	3	6	495961	495966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017403	AG	3	6	526014	526019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017403	TA	3	6	527055	527060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017403	GT	3	6	531574	531579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017403	AG	3	6	534247	534252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017403	AG	3	6	541898	541903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017403	AG	3	6	542747	542752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017403	AT	3	6	551623	551628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017403	TG	3	6	553636	553641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017403	AT	3	6	568912	568917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017403	AG	4	8	571569	571576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017403	CT	3	6	571584	571589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017403	AT	3	6	577036	577041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017403	TA	3	6	583134	583139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017403	TA	3	6	584704	584709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017403	AT	3	6	585912	585917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017403	TA	3	6	589963	589968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017403	TA	3	6	590015	590020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017403	AT	3	6	599113	599118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017403	AT	3	6	599146	599151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017403	TA	3	6	599205	599210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017403	AT	3	6	600582	600587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017403	TA	3	6	618363	618368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017403	TA	3	6	618475	618480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017403	AT	3	6	628738	628743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017403	AT	3	6	628766	628771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017403	AT	4	8	628776	628783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017403	TA	3	6	628790	628795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017403	TA	3	6	630469	630474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017403	AT	3	6	653574	653579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017403	TA	3	6	658571	658576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017403	TA	3	6	661248	661253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017403	TA	3	6	661255	661260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017403	TA	3	6	661264	661269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017403	TA	3	6	672940	672945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017403	AT	3	6	673025	673030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017403	TA	3	6	674550	674555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017403	TA	3	6	688064	688069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017403	TA	3	6	695303	695308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017403	AT	3	6	700670	700675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017403	TA	3	6	700693	700698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017403	TA	4	8	705271	705278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017403	GA	3	6	710909	710914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_017403	CT	3	6	714530	714535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017403	AG	3	6	730233	730238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017403	TA	3	6	730877	730882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017403	AT	5	10	739895	739904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017403	AG	3	6	750826	750831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017403	AG	3	6	750890	750895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.