MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 chromosome

Total Repeats: 1055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017403	TAT	2	6	48	53	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017403	ACT	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017403	TTA	2	6	105	110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017403	ACT	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017403	CAA	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017403	ACT	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017403	AAC	2	6	497	502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017403	TTC	2	6	523	528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017403	TAA	2	6	566	571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017403	CTT	2	6	598	603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017403	GTT	2	6	686	691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017403	ATT	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017403	TTA	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017403	TAA	2	6	3314	3319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017403	ATT	2	6	3340	3345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017403	AAT	2	6	3357	3362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017403	GAA	2	6	3382	3387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017403	ATA	2	6	5203	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017403	AAT	2	6	5242	5247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017403	AAT	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017403	TAT	2	6	8371	8376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017403	TAA	2	6	8389	8394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017403	ATT	2	6	15805	15810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017403	TAT	2	6	15896	15901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017403	TCC	2	6	19985	19990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017403	AAT	2	6	20031	20036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017403	TAA	2	6	21981	21986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017403	CAA	2	6	22617	22622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017403	TAA	2	6	25555	25560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017403	ATA	2	6	25567	25572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017403	TAA	2	6	31389	31394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017403	TTA	2	6	31951	31956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017403	AAC	2	6	39489	39494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017403	TAA	2	6	39498	39503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017403	TAA	2	6	39514	39519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017403	ACT	2	6	39524	39529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017403	ATT	2	6	39549	39554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017403	TAT	2	6	39591	39596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017403	TAA	2	6	40551	40556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017403	TAT	2	6	40563	40568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017403	ATA	2	6	40600	40605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017403	TAA	2	6	45260	45265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017403	ATA	2	6	45849	45854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017403	TCC	2	6	46233	46238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017403	ATT	2	6	46367	46372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017403	ATG	2	6	46420	46425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017403	ACC	2	6	46642	46647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017403	CAA	2	6	46749	46754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017403	AGC	2	6	46772	46777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017403	TTA	2	6	46803	46808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017403	TTA	2	6	46909	46914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017403	ACA	2	6	46933	46938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017403	TAA	2	6	49864	49869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017403	TAA	2	6	49873	49878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017403	TAC	2	6	49923	49928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017403	ACA	2	6	49940	49945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017403	TTA	2	6	52284	52289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017403	TCC	2	6	53316	53321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017403	ATT	2	6	53348	53353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017403	AAC	2	6	53366	53371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017403	AAT	2	6	56613	56618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017403	TAA	3	9	57085	57093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017403	ATT	2	6	57845	57850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017403	ATT	2	6	58834	58839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017403	ATT	3	9	58921	58929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017403	AAT	2	6	62926	62931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017403	AGG	2	6	65130	65135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017403	TAA	2	6	72469	72474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017403	ATT	2	6	79258	79263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017403	TAA	2	6	79267	79272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017403	ATA	2	6	79311	79316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017403	TAA	2	6	80698	80703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017403	TAT	2	6	80785	80790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017403	TAT	2	6	80795	80800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017403	TAA	2	6	80806	80811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017403	ATT	2	6	85599	85604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017403	AAT	2	6	85661	85666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017403	ATA	2	6	86765	86770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017403	ATA	2	6	93913	93918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017403	TTA	2	6	93928	93933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017403	AAT	2	6	94016	94021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017403	CTT	2	6	94023	94028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017403	ATA	2	6	94060	94065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017403	ATA	2	6	98508	98513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017403	ATA	2	6	98569	98574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017403	TAA	2	6	98614	98619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017403	TAA	2	6	98637	98642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017403	GAT	2	6	98656	98661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017403	TAA	2	6	101221	101226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017403	ATA	2	6	102837	102842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017403	AGA	2	6	105183	105188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017403	ATA	2	6	105238	105243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017403	AAT	2	6	105246	105251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017403	ATA	2	6	105706	105711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017403	TTA	2	6	106758	106763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017403	TAA	2	6	106813	106818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017403	TAA	2	6	108040	108045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017403	ATT	2	6	108121	108126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017403	CAA	2	6	112661	112666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017403	CAA	2	6	112706	112711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017403	AAT	2	6	112748	112753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017403	TAT	2	6	114496	114501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017403	ATA	2	6	114547	114552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017403	TAT	2	6	114615	114620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017403	TCC	2	6	116664	116669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017403	CTC	2	6	118788	118793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017403	CCT	2	6	120448	120453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017403	ATA	2	6	120519	120524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017403	TAA	2	6	120537	120542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017403	TAA	2	6	120576	120581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017403	CAA	2	6	120588	120593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017403	TAA	2	6	120601	120606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017403	CCA	2	6	130972	130977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017403	TAT	2	6	131080	131085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017403	ATA	2	6	133739	133744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017403	ATA	3	9	133749	133757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017403	AAT	2	6	133776	133781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017403	TAT	2	6	137652	137657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017403	ATT	2	6	137661	137666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017403	ATT	2	6	137685	137690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017403	CTG	2	6	137703	137708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017403	TCT	2	6	137956	137961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017403	ATA	2	6	138011	138016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017403	TAA	2	6	138154	138159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017403	TAA	2	6	138221	138226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017403	TTA	2	6	138239	138244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017403	TCT	2	6	138610	138615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017403	CAT	2	6	138626	138631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017403	ACT	2	6	138633	138638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017403	ATT	2	6	138648	138653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017403	TAT	2	6	138867	138872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017403	AGA	2	6	138882	138887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017403	AAT	2	6	138924	138929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017403	CAA	2	6	139010	139015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017403	GCA	2	6	139033	139038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017403	ATA	3	9	139111	139119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017403	ATA	2	6	139153	139158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017403	ACA	2	6	139165	139170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017403	ATA	2	6	139171	139176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017403	CAT	2	6	139179	139184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017403	ATT	2	6	139189	139194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017403	CTT	2	6	139256	139261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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