MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) chromosome

Total Repeats: 418

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017259	AATT	2	8	60	67	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017259	TTAA	2	8	145	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017259	TTAA	2	8	2131	2138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017259	TTTG	2	8	3440	3447	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017259	ATTC	2	8	14158	14165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017259	TTAT	3	12	14898	14909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017259	TAAA	2	8	18238	18245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017259	ATTT	2	8	20418	20425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017259	AATT	2	8	20445	20452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017259	TTTA	2	8	20473	20480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017259	ATTT	2	8	23078	23085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017259	TGAA	2	8	24307	24314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017259	TAAT	2	8	25369	25376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017259	TATT	2	8	27262	27269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017259	AAAT	2	8	27272	27279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017259	AATA	2	8	29731	29738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017259	TAAT	2	8	29871	29878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017259	AATA	2	8	32998	33005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017259	CTTT	2	8	34593	34600	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017259	ATTA	2	8	34688	34695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017259	TAGA	2	8	35107	35114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017259	AATA	2	8	35212	35219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017259	ATTA	2	8	35487	35494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017259	TTTA	2	8	35495	35502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017259	GATA	2	8	43993	44000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017259	AATT	2	8	44009	44016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017259	ATTT	2	8	44586	44593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017259	TTAT	2	8	45138	45145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017259	TAAA	2	8	45258	45265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017259	TATT	2	8	45281	45288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017259	ATTT	2	8	45302	45309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017259	TAAA	2	8	45310	45317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017259	TAAT	2	8	45354	45361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017259	AATA	2	8	46535	46542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017259	ATTT	2	8	47545	47552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017259	CTAC	2	8	47768	47775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017259	TTTA	2	8	50275	50282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017259	ATAC	2	8	50322	50329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017259	ATAA	2	8	50352	50359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017259	TAAA	2	8	50444	50451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017259	TTTA	2	8	50524	50531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017259	TAAA	2	8	50578	50585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017259	GTTT	2	8	50618	50625	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017259	TAAA	2	8	50629	50636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017259	ATTA	2	8	50903	50910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017259	TAAT	2	8	50982	50989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017259	AAAT	2	8	51193	51200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017259	ATTA	2	8	51249	51256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017259	GTTT	2	8	51295	51302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017259	AAAT	2	8	51418	51425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017259	ATTT	2	8	54322	54329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017259	ATTA	2	8	54877	54884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017259	TAAT	2	8	56356	56363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017259	AATA	2	8	58292	58299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017259	TAAA	2	8	60387	60394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017259	ATCA	2	8	60432	60439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017259	TGAT	2	8	62419	62426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017259	TAAA	2	8	63431	63438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017259	TAAT	2	8	63488	63495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017259	TATT	2	8	72064	72071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017259	TAAG	2	8	73664	73671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017259	TTTA	2	8	74246	74253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017259	TATT	2	8	74345	74352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017259	ACTA	2	8	74431	74438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017259	ATTT	2	8	80829	80836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017259	ATTA	2	8	83435	83442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017259	TAAA	2	8	84495	84502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017259	TAAA	2	8	85084	85091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017259	TCAT	2	8	90318	90325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017259	AATA	2	8	90509	90516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017259	ATTA	2	8	90653	90660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017259	AATT	2	8	96104	96111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017259	TAAT	2	8	97576	97583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017259	TTTA	3	12	98814	98825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017259	TAAA	2	8	100336	100343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017259	AATT	2	8	100370	100377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017259	TTAT	2	8	110000	110007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017259	CAAA	2	8	110037	110044	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017259	TATT	2	8	110689	110696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017259	AATT	2	8	114689	114696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017259	ATTA	2	8	119706	119713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017259	AATT	2	8	119777	119784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017259	TAAA	2	8	120945	120952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017259	ATTT	2	8	121000	121007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017259	TAAT	2	8	121193	121200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017259	TGTA	2	8	122398	122405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017259	ATAA	2	8	122422	122429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017259	TAAA	2	8	122462	122469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017259	TTAA	2	8	122478	122485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017259	ATTA	2	8	124979	124986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017259	TAAT	2	8	129643	129650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017259	TAAT	2	8	129904	129911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017259	TTTA	2	8	129948	129955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017259	AATT	2	8	130178	130185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017259	ATTA	2	8	130321	130328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017259	TAAA	2	8	130437	130444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017259	ATTT	2	8	135487	135494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017259	AATT	2	8	135534	135541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017259	ATTT	2	8	137730	137737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017259	AAAT	2	8	151328	151335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017259	GTTA	2	8	151452	151459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017259	ATGA	2	8	151527	151534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017259	TTTA	2	8	151773	151780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017259	ATTT	2	8	152073	152080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017259	TAAA	2	8	152116	152123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017259	AAAT	2	8	153772	153779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017259	TTTA	2	8	155938	155945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017259	TTAT	2	8	155969	155976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017259	TATT	2	8	157227	157234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017259	ATTT	2	8	160958	160965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017259	ATTG	2	8	165804	165811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017259	ATAA	2	8	177101	177108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017259	TAAA	2	8	186111	186118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017259	ATTT	2	8	190389	190396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017259	TAAT	2	8	191761	191768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017259	TTAT	2	8	191778	191785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017259	ATTA	2	8	193178	193185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017259	AAAT	2	8	193257	193264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017259	TAAA	2	8	193645	193652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017259	TTAA	2	8	194515	194522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017259	TAAA	2	8	195245	195252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017259	TAAA	2	8	195319	195326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017259	ATTT	2	8	202005	202012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017259	ATAA	2	8	202061	202068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017259	ATTA	2	8	202130	202137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017259	ATTT	2	8	202218	202225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017259	ATTT	2	8	202300	202307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017259	ATTT	2	8	203023	203030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017259	AATT	2	8	203123	203130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017259	AATT	2	8	203149	203156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017259	ATAA	2	8	203159	203166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017259	TAAA	2	8	203825	203832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017259	TAAT	2	8	203935	203942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017259	TATT	2	8	204923	204930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017259	ATAA	2	8	210231	210238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017259	AAAT	2	8	212141	212148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017259	TTTA	2	8	217534	217541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017259	TTAT	2	8	217553	217560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017259	TAAT	2	8	217706	217713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017259	AAAT	2	8	217842	217849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017259	TTAA	2	8	218065	218072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017259	TAAT	2	8	218087	218094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017259	AATG	2	8	218113	218120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017259	AAAG	2	8	229773	229780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017259	ATTT	2	8	229838	229845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017259	GTTT	2	8	230359	230366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017259	AATA	2	8	230533	230540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017259	TAAA	2	8	230586	230593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017259	ATTA	2	8	235157	235164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017259	TTTA	2	8	235211	235218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017259	ATTA	2	8	237635	237642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017259	TATT	2	8	237813	237820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.