MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. JF99 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017253	AAAATT	2	12	2139	2150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017253	ATATTT	2	12	18168	18179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017253	TAAAAA	2	12	24806	24817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017253	AATATA	2	12	27815	27826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017253	ATTAAA	2	12	76935	76946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017253	AATTAA	2	12	76983	76994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017253	TTTTAA	2	12	83944	83955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017253	ATTTTT	2	12	87630	87641	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017253	TTTATA	2	12	87882	87893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017253	AAAAAT	2	12	98915	98926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017253	TAAAAA	2	12	111437	111448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017253	TAAAAA	2	12	127650	127661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017253	TTAAAT	2	12	133845	133856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017253	ATTTTC	2	12	138478	138489	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017253	TTTATT	2	12	143709	143720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017253	AAATAA	2	12	143785	143796	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017253	ATATTT	2	12	180413	180424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017253	AACAAA	2	12	186529	186540	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017253	ATTACT	2	12	186622	186633	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017253	AAACAA	2	12	190198	190209	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017253	ATTAAA	2	12	190523	190534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017253	TCTATT	2	12	190575	190586	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017253	AACTTT	2	12	190632	190643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017253	ATTAAT	2	12	191269	191280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017253	ATTTTT	2	12	193214	193225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017253	TGACAA	2	12	199042	199053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017253	TTATAT	2	12	211731	211742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017253	AAAATT	2	12	216213	216224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017253	TTATAT	2	12	231042	231053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017253	ATTTTA	2	12	232473	232484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017253	TTTAAA	2	12	235197	235208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017253	ATTTAA	2	12	248340	248351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017253	AAATAT	2	12	251983	251994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017253	AATTAA	2	12	255499	255510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017253	AAAAAT	2	12	269356	269367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017253	TATTTA	2	12	307519	307530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017253	TATTTT	2	12	307692	307703	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017253	TCATAT	2	12	320024	320035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017253	TTTTAT	2	12	331115	331126	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017253	ATTTTT	2	12	331849	331860	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017253	AATATA	2	12	339158	339169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017253	AATTAA	2	12	354546	354557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017253	AAATTT	2	12	359267	359278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017253	TTCTTT	2	12	380391	380402	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017253	AAAATT	2	12	381389	381400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017253	AAAGAT	2	12	381729	381740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017253	GAATTA	2	12	408483	408494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017253	CACTCG	2	12	408584	408595	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017253	CAAAAT	2	12	409156	409167	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017253	ATTTTA	2	12	414830	414841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017253	AAAATT	2	12	433405	433416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017253	ATAAAA	2	12	440925	440936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017253	ATTTCT	2	12	469696	469707	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017253	TATAAA	2	12	470490	470501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017253	CTATTA	2	12	489480	489491	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017253	TAATTT	2	12	490819	490830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017253	TAAAAA	2	12	497331	497342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017253	TTAAAA	2	12	518760	518771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017253	ATCATA	2	12	519221	519232	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017253	TAATAT	2	12	533224	533235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017253	ATTTTT	2	12	540102	540113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017253	TTGATT	2	12	543070	543081	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017253	TTTAAA	2	12	568006	568017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017253	ATTTAA	2	12	569649	569660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017253	ATAAAA	2	12	572954	572965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017253	TTTTAT	2	12	573488	573499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017253	TATTTT	2	12	575583	575594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017253	ATTTTA	2	12	579569	579580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017253	AAAGAA	2	12	580269	580280	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017253	TTTATC	2	12	581414	581425	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017253	AAAATA	2	12	581674	581685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017253	ATATAA	2	12	582825	582836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017253	TAAAAA	2	12	584558	584569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017253	TAAAAT	2	12	584666	584677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017253	TTCAGG	2	12	618912	618923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017253	TAAAAA	2	12	625002	625013	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017253	AATATT	2	12	631108	631119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017253	AAAAAT	2	12	634562	634573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.