MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. JF99 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017253	AAAGA	2	10	85	94	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017253	ATATA	2	10	14090	14099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017253	ATTAA	2	10	18313	18322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017253	TTTAT	2	10	20371	20380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017253	TATTT	2	10	20684	20693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017253	TACTT	2	10	20920	20929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017253	TATAT	2	10	20936	20945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017253	ATTTT	2	10	23585	23594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017253	TTTCT	2	10	27116	27125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017253	TTTTA	2	10	30720	30729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017253	TTGTA	2	10	30869	30878	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017253	TGATA	2	10	30942	30951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017253	TATAA	2	10	33490	33499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017253	ATTTT	2	10	44789	44798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017253	TAAAA	2	10	48384	48393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017253	ATTAT	2	10	48892	48901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017253	TGTAA	2	10	52231	52240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017253	TTTAT	2	10	58910	58919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017253	AGAAT	2	10	66237	66246	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017253	ATTTT	2	10	68362	68371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017253	ATTAA	2	10	72228	72237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017253	GCATG	2	10	76394	76403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017253	GATAT	2	10	81751	81760	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017253	TTAAT	2	10	83636	83645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017253	TTAAA	2	10	87610	87619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017253	AATAT	2	10	87721	87730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017253	AATAT	2	10	91545	91554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017253	CCATG	2	10	93158	93167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017253	TAAAA	2	10	95773	95782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017253	AATAT	2	10	101441	101450	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017253	AATTA	2	10	101817	101826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017253	TATTT	2	10	103932	103941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017253	GAATT	2	10	106656	106665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017253	TTTTA	2	10	111512	111521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017253	TAATT	2	10	117007	117016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017253	ATATA	2	10	117153	117162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017253	TTGTA	2	10	127678	127687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017253	TATAA	2	10	127812	127821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017253	TTATT	2	10	133255	133264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017253	TTATT	2	10	137638	137647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017253	ATTTT	2	10	154198	154207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017253	AAAAT	2	10	179702	179711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017253	AATTT	2	10	180480	180489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017253	AAGTG	2	10	190495	190504	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017253	TATAA	2	10	190741	190750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017253	GGAAA	2	10	191027	191036	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017253	TTATT	2	10	201249	201258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017253	ACTTT	2	10	202957	202966	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017253	ATATA	2	10	205192	205201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017253	TAATT	2	10	211920	211929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017253	ATTTT	2	10	212249	212258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017253	TAATA	2	10	212304	212313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017253	TTATT	2	10	215252	215261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017253	TAATC	2	10	223797	223806	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017253	GTATT	2	10	235417	235426	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017253	TGATT	2	10	236175	236184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017253	TAAAA	2	10	247016	247025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017253	ATGTT	2	10	250691	250700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017253	AGATT	2	10	252141	252150	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017253	TTAAT	2	10	256353	256362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017253	TAAAA	2	10	258020	258029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017253	TAAAA	2	10	267514	267523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017253	AATTT	2	10	269421	269430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017253	ATTTT	2	10	277716	277725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017253	ATAAA	2	10	278983	278992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017253	AAAAT	2	10	280422	280431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017253	TTTTA	2	10	281480	281489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017253	TAAAT	2	10	281509	281518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017253	ATTAG	2	10	284652	284661	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017253	ATGTA	2	10	297097	297106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017253	AATTT	2	10	298555	298564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017253	TAAAA	2	10	299339	299348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017253	TTTAT	2	10	307610	307619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017253	ATAAA	2	10	313191	313200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017253	ATAAA	2	10	315405	315414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017253	TAAAA	2	10	320122	320131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017253	TTAAA	2	10	326271	326280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017253	ATATT	2	10	326294	326303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017253	ATAAA	2	10	326625	326634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017253	TAATT	2	10	329583	329592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017253	TTTAA	2	10	331033	331042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017253	ATTAT	2	10	353947	353956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017253	TTTAT	2	10	354692	354701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017253	TATAA	2	10	359299	359308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017253	AATTA	2	10	364348	364357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017253	TAAAA	3	15	365759	365773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017253	AAATT	2	10	368888	368897	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017253	TATTT	2	10	373108	373117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017253	TAAAA	2	10	378457	378466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017253	ATTTT	2	10	380169	380178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017253	TATTT	2	10	380457	380466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017253	TTTAT	2	10	382221	382230	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017253	CTATC	2	10	382543	382552	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017253	TAAAA	2	10	386616	386625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017253	TAAAA	2	10	396363	396372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017253	AAAAG	2	10	397266	397275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017253	TATAT	2	10	397559	397568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017253	ATATA	2	10	397569	397578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017253	ATTTT	2	10	408977	408986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017253	TAAAT	2	10	412248	412257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017253	TAAAA	2	10	412421	412430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017253	AAATT	2	10	412519	412528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017253	TTTAT	2	10	414814	414823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017253	TTTAT	2	10	416183	416192	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017253	TCTAT	2	10	421679	421688	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017253	AAAAT	2	10	423278	423287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017253	AATTA	2	10	431402	431411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017253	AAATA	2	10	432832	432841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017253	TTACA	2	10	433657	433666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017253	TAAAA	3	15	444140	444154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017253	ATATA	2	10	447486	447495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017253	TTATT	2	10	449787	449796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017253	GTGCT	2	10	450267	450276	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017253	TTATA	2	10	452139	452148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017253	TAATA	2	10	470530	470539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017253	TAAAT	2	10	476039	476048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017253	AAATT	2	10	476162	476171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017253	CAAAT	2	10	476214	476223	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017253	AAATT	2	10	481892	481901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017253	CATAT	2	10	494974	494983	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017253	TTAAT	2	10	496053	496062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017253	TAAAA	2	10	497407	497416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017253	GAAAT	2	10	497540	497549	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017253	ATTTA	2	10	497724	497733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017253	TTAAT	2	10	504905	504914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017253	TCTAT	2	10	509460	509469	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017253	ACTAT	2	10	509470	509479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017253	TAATA	2	10	525411	525420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017253	TTAAT	2	10	527499	527508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017253	TAATA	2	10	527619	527628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017253	TAAAA	2	10	533467	533476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017253	TAATA	2	10	536711	536720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017253	ATTTT	2	10	539196	539205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017253	CACTA	2	10	540308	540317	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017253	TTCAG	2	10	541454	541463	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017253	TCGGT	2	10	542609	542618	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017253	CTTTT	2	10	543435	543444	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017253	ATGAT	2	10	545991	546000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017253	ATTTA	2	10	547373	547382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017253	TAATA	2	10	561336	561345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017253	TAAAA	2	10	565846	565855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017253	TAAAT	2	10	565898	565907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017253	ATAAA	2	10	568226	568235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017253	AAAAT	2	10	568251	568260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017253	CAAAA	2	10	580143	580152	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017253	ATTGC	2	10	580474	580483	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017253	TAATT	2	10	580529	580538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017253	AAATA	2	10	581400	581409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017253	TTGAT	2	10	581918	581927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017253	TTTAA	2	10	588787	588796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017253	TTATA	2	10	588860	588869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.