MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 4080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017249	TTAA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017249	TGCA	2	8	1067	1074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017249	GGCA	2	8	1222	1229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017249	GCCT	2	8	1384	1391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017249	CGAA	2	8	1448	1455	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017249	CTCC	2	8	1931	1938	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017249	CGTT	2	8	2056	2063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017249	CGTC	2	8	2548	2555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017249	CGAC	2	8	2776	2783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017249	TGGC	2	8	3917	3924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017249	CCCG	2	8	8072	8079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_017249	CTCA	2	8	8355	8362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017249	CAAT	2	8	8931	8938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017249	CAGC	2	8	10027	10034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017249	TAGG	2	8	10775	10782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017249	GAGC	2	8	11173	11180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017249	CGCT	2	8	11523	11530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017249	AGTC	2	8	12925	12932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017249	CTCC	2	8	13424	13431	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_017249	CGCT	2	8	13666	13673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017249	CAGC	2	8	14428	14435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017249	CACC	2	8	14483	14490	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_017249	GATT	2	8	16998	17005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017249	GGTC	2	8	18402	18409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017249	CAAT	2	8	18484	18491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017249	ATCG	2	8	20277	20284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017249	GCTC	2	8	20322	20329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017249	TTCT	2	8	20610	20617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017249	GAAG	2	8	21297	21304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017249	GGCC	2	8	21989	21996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017249	CAAG	2	8	22122	22129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017249	AGGC	2	8	23248	23255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017249	ACGA	2	8	23374	23381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017249	TCAA	2	8	23385	23392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017249	CGTC	2	8	24083	24090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017249	CTAG	2	8	24506	24513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017249	TCCG	2	8	26512	26519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017249	GCCG	2	8	31992	31999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017249	ATTA	2	8	32188	32195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017249	GCCG	2	8	34927	34934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017249	GAGT	2	8	34976	34983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017249	GGCG	2	8	35022	35029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017249	AAGG	2	8	35352	35359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017249	CGAG	2	8	35449	35456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017249	GGCC	2	8	35596	35603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017249	AGAT	2	8	36247	36254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017249	CTCG	2	8	36363	36370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017249	GCAT	2	8	36702	36709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017249	TCGT	2	8	36783	36790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017249	CCCA	2	8	40541	40548	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_017249	ACAA	2	8	41170	41177	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017249	ACCG	2	8	41181	41188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017249	TCGG	2	8	41223	41230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017249	TCGC	2	8	42143	42150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017249	TGCA	2	8	42433	42440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017249	ACGT	2	8	46236	46243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017249	AACT	2	8	46297	46304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017249	GTCT	2	8	47129	47136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017249	CCCG	2	8	48628	48635	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_017249	CGGG	2	8	48643	48650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017249	GACG	2	8	49345	49352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017249	CCCG	2	8	50378	50385	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_017249	CGGC	2	8	50451	50458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017249	GCAG	2	8	50704	50711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017249	GCCC	2	8	51499	51506	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_017249	ACCG	2	8	54204	54211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017249	CGAC	2	8	59299	59306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017249	CTCG	2	8	59607	59614	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017249	TCCG	2	8	60149	60156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017249	CGGT	2	8	60208	60215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017249	TGAG	2	8	67825	67832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017249	AGGA	2	8	68461	68468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017249	GGCT	2	8	68536	68543	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017249	GGAA	2	8	69353	69360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017249	TGGA	2	8	69719	69726	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017249	CATC	2	8	73653	73660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017249	CCGA	2	8	74664	74671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017249	AGGC	2	8	74721	74728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017249	CCCT	2	8	77845	77852	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_017249	CGCT	2	8	81910	81917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017249	CCCG	2	8	87739	87746	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_017249	GCGT	2	8	88020	88027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017249	GGGC	2	8	90048	90055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017249	TCCG	2	8	96717	96724	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017249	TTGC	2	8	103761	103768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017249	AGTA	2	8	105124	105131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017249	CTGG	2	8	107987	107994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017249	CCCT	2	8	110460	110467	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_017249	TCAA	2	8	110634	110641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017249	AACG	2	8	110645	110652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017249	CTTG	2	8	115960	115967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017249	AAGG	2	8	120079	120086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017249	GCCA	2	8	125237	125244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017249	GGCC	2	8	125255	125262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017249	AGGA	2	8	127326	127333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017249	TCCC	2	8	129300	129307	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_017249	TGGA	2	8	135850	135857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017249	TTGA	2	8	139140	139147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017249	GCCG	2	8	147621	147628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017249	TTTC	2	8	158198	158205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017249	CCGG	2	8	158307	158314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017249	TTGC	2	8	158323	158330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017249	CGCA	2	8	163724	163731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017249	CCGC	2	8	165577	165584	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_017249	TTTG	2	8	166074	166081	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017249	CCGT	2	8	170480	170487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017249	GGCG	2	8	172709	172716	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017249	CCAT	2	8	173536	173543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017249	AAGA	2	8	175385	175392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017249	CACC	2	8	175926	175933	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_017249	CAGG	2	8	176119	176126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017249	GCCC	2	8	177362	177369	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_017249	TCAA	2	8	184831	184838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017249	CGGG	2	8	184916	184923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017249	GCCT	2	8	184931	184938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017249	AGCT	2	8	193944	193951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017249	TTTC	2	8	195103	195110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017249	TCCG	2	8	202925	202932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017249	TGGG	2	8	209601	209608	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017249	CCGC	2	8	209788	209795	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_017249	CCTG	2	8	223981	223988	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017249	GCGG	2	8	224011	224018	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017249	AAGG	2	8	224036	224043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017249	AACC	2	8	224052	224059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017249	ACAA	2	8	224926	224933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017249	ATGA	2	8	224958	224965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017249	GAGG	2	8	229965	229972	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017249	GTCT	2	8	231002	231009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017249	TCCC	2	8	231499	231506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_017249	GCAA	2	8	231547	231554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017249	CAGG	2	8	231578	231585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017249	TTCC	2	8	237602	237609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017249	GGTT	2	8	237661	237668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017249	TTCG	2	8	239930	239937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017249	GAAA	2	8	242807	242814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017249	CAGT	2	8	243343	243350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017249	TGCA	2	8	245712	245719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017249	AAGA	2	8	248810	248817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017249	TTGA	2	8	263795	263802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017249	CAAT	2	8	269395	269402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017249	CATC	2	8	269507	269514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017249	ATGT	2	8	269777	269784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017249	CGGT	2	8	269971	269978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017249	TCCG	2	8	277711	277718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017249	AGGC	2	8	277854	277861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017249	TGGT	2	8	284362	284369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017249	TTCC	2	8	284571	284578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017249	GAAG	2	8	287386	287393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017249	CCTG	2	8	287608	287615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017249	GCTC	2	8	288000	288007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017249	GCGT	2	8	290277	290284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017249	CGCC	2	8	297906	297913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_017249	GCCG	3	12	311189	311200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_017249	CGCC	2	8	312584	312591	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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159	NC_017249	AACC	2	8	331330	331337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_017249	CCGG	2	8	336151	336158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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