MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017249	GGC	2	6	1176779	1176784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_017249	CGG	2	6	1176854	1176859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017249	CG	3	6	1177694	1177699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_017249	CAAG	2	8	1177721	1177728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_017249	ACA	2	6	1177729	1177734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_017249	GGA	2	6	1177736	1177741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017249	CG	3	6	1178100	1178105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_017249	GCC	2	6	1178110	1178115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_017249	CGCT	2	8	1178140	1178147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_017249	CGT	2	6	1180118	1180123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_017249	CTCC	2	8	1180157	1180164	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3512	NC_017249	GGGA	2	8	1180175	1180182	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017249	GCAG	2	8	1180914	1180921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_017249	CG	3	6	1180926	1180931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_017249	TTCG	2	8	1180939	1180946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_017249	GCC	2	6	1180953	1180958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_017249	CAC	2	6	1180984	1180989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_017249	TGC	2	6	1181025	1181030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_017249	CGA	2	6	1181613	1181618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_017249	TGTCC	2	10	1181634	1181643	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3521	NC_017249	GCT	2	6	1181673	1181678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_017249	CGTCG	2	10	1181712	1181721	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3523	NC_017249	CGG	2	6	1181775	1181780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017249	GCC	2	6	1181830	1181835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_017249	GT	3	6	1182279	1182284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017249	CG	3	6	1182348	1182353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_017249	CTT	2	6	1183288	1183293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_017249	GCG	2	6	1183307	1183312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_017249	TGCC	2	8	1183331	1183338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_017249	GCC	2	6	1183353	1183358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_017249	TG	3	6	1184955	1184960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017249	CTCC	2	8	1184998	1185005	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3533	NC_017249	GGGA	2	8	1185015	1185022	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017249	AGA	2	6	1185062	1185067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017249	TGCA	2	8	1186455	1186462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_017249	GCG	2	6	1188263	1188268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_017249	CAG	2	6	1188329	1188334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_017249	GCA	2	6	1188336	1188341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_017249	CGC	2	6	1188347	1188352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_017249	TCA	2	6	1189876	1189881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_017249	TTGG	2	8	1190828	1190835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017249	GCG	2	6	1190849	1190854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_017249	CCG	2	6	1190872	1190877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_017249	GAA	2	6	1192021	1192026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017249	GAA	2	6	1192032	1192037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017249	CAT	2	6	1192077	1192082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_017249	GTTT	2	8	1192107	1192114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017249	CGC	3	9	1193868	1193876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_017249	GGC	2	6	1193914	1193919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_017249	CT	3	6	1193925	1193930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_017249	CTCC	2	8	1193933	1193940	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3552	NC_017249	GAG	2	6	1193958	1193963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_017249	GCAA	2	8	1194005	1194012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_017249	TACG	2	8	1194046	1194053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_017249	GGCG	2	8	1195592	1195599	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_017249	AAC	2	6	1195890	1195895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_017249	ATC	2	6	1195982	1195987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_017249	GCC	2	6	1196039	1196044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_017249	CCG	2	6	1196132	1196137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_017249	CGG	2	6	1196184	1196189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_017249	CGT	2	6	1196213	1196218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017249	CCG	2	6	1196227	1196232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_017249	GTT	2	6	1196253	1196258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017249	GCCC	2	8	1197347	1197354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3565	NC_017249	GGC	2	6	1198739	1198744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_017249	ACC	2	6	1198794	1198799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_017249	CTCCG	2	10	1199854	1199863	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3568	NC_017249	CGC	2	6	1199875	1199880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_017249	CAA	3	9	1199897	1199905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_017249	ACA	2	6	1199911	1199916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_017249	CGA	2	6	1203347	1203352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_017249	CAAA	2	8	1204082	1204089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_017249	GC	3	6	1204092	1204097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_017249	GC	3	6	1204104	1204109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_017249	T	7	7	1204110	1204116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017249	CTG	2	6	1204157	1204162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_017249	GCC	2	6	1204758	1204763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_017249	GC	3	6	1204786	1204791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_017249	CTG	2	6	1204843	1204848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_017249	CCG	2	6	1204910	1204915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_017249	GGC	2	6	1204999	1205004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_017249	TCA	2	6	1205018	1205023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_017249	GCC	2	6	1205044	1205049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_017249	GGC	2	6	1205057	1205062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_017249	CGTTT	2	10	1205064	1205073	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3587	NC_017249	TGCGC	2	10	1207341	1207350	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3588	NC_017249	GC	3	6	1207413	1207418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_017249	GAC	2	6	1207424	1207429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3591	NC_017249	TCC	2	6	1208544	1208549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_017249	GC	3	6	1208556	1208561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_017249	CA	3	6	1208562	1208567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_017249	CCA	2	6	1208631	1208636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_017249	TGG	2	6	1208658	1208663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_017249	CCCA	2	8	1208685	1208692	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3597	NC_017249	CAT	2	6	1209102	1209107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_017249	CCGG	2	8	1209117	1209124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_017249	GCC	2	6	1209160	1209165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_017249	GAC	2	6	1209212	1209217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_017249	GC	3	6	1212343	1212348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_017249	CG	3	6	1212353	1212358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_017249	CCA	2	6	1212365	1212370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_017249	CCTAC	2	10	1212415	1212424	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3605	NC_017249	TCG	2	6	1213656	1213661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_017249	A	7	7	1213673	1213679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017249	GCCG	2	8	1213756	1213763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_017249	CAC	2	6	1213772	1213777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_017249	CCG	2	6	1215019	1215024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_017249	CGC	2	6	1215056	1215061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_017249	ACA	2	6	1215076	1215081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_017249	CAA	2	6	1215139	1215144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_017249	GCC	2	6	1215153	1215158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_017249	GGC	2	6	1215173	1215178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_017249	TG	3	6	1215200	1215205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017249	AC	3	6	1215732	1215737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_017249	AAC	2	6	1215746	1215751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_017249	CCA	2	6	1216821	1216826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_017249	AGG	2	6	1216867	1216872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017249	CG	3	6	1216912	1216917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_017249	GCCGC	2	10	1216946	1216955	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3622	NC_017249	CTC	2	6	1218936	1218941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_017249	GCGT	2	8	1218942	1218949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_017249	CCG	2	6	1218954	1218959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_017249	ACGC	2	8	1218979	1218986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_017249	AGGGC	2	10	1219007	1219016	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3627	NC_017249	ACGCT	2	10	1219531	1219540	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3628	NC_017249	GCG	2	6	1219566	1219571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_017249	GC	3	6	1219953	1219958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_017249	GC	4	8	1219967	1219974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_017249	GAC	2	6	1219979	1219984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3633	NC_017249	A	6	6	1220889	1220894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3652	NC_017249	GC	3	6	1222313	1222318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3893	NC_017249	CAA	2	6	1332746	1332751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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