MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_017249	AAC	2	6	5703900	5703905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_017249	ACG	2	6	5705100	5705105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17503	NC_017249	TGA	2	6	5705801	5705806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17504	NC_017249	TGCAA	2	10	5706924	5706933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17505	NC_017249	CTC	2	6	5707979	5707984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17506	NC_017249	GAG	2	6	5707997	5708002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_017249	GCA	2	6	5708038	5708043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17508	NC_017249	TAA	2	6	5708100	5708105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17509	NC_017249	TCC	2	6	5708530	5708535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17510	NC_017249	TTG	2	6	5708543	5708548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17511	NC_017249	CTG	2	6	5708602	5708607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17512	NC_017249	TCGA	3	12	5711554	5711565	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17513	NC_017249	CGC	2	6	5711570	5711575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17514	NC_017249	CGG	2	6	5712398	5712403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17515	NC_017249	CGG	2	6	5712445	5712450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17516	NC_017249	GCA	2	6	5712503	5712508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17517	NC_017249	AAGCG	2	10	5712542	5712551	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17518	NC_017249	TGG	2	6	5712584	5712589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17519	NC_017249	ACCC	2	8	5712611	5712618	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17520	NC_017249	CAATC	2	10	5712657	5712666	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17521	NC_017249	CGG	2	6	5712675	5712680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17522	NC_017249	TCG	2	6	5712695	5712700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17523	NC_017249	CTC	2	6	5712706	5712711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17524	NC_017249	AG	3	6	5712723	5712728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_017249	GC	3	6	5714042	5714047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17526	NC_017249	CGG	2	6	5717251	5717256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17527	NC_017249	CGT	3	9	5717262	5717270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17528	NC_017249	CG	3	6	5717298	5717303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17529	NC_017249	TCG	2	6	5717350	5717355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17530	NC_017249	CGA	2	6	5717365	5717370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17531	NC_017249	GCCGC	2	10	5717406	5717415	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17532	NC_017249	CGC	2	6	5717464	5717469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17533	NC_017249	GC	3	6	5717468	5717473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17534	NC_017249	CG	3	6	5717481	5717486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17535	NC_017249	CTG	2	6	5717519	5717524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17536	NC_017249	ACC	2	6	5717610	5717615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17537	NC_017249	GAC	2	6	5718484	5718489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17538	NC_017249	GCC	2	6	5718504	5718509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17539	NC_017249	T	6	6	5718529	5718534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_017249	TGG	2	6	5718558	5718563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_017249	GAAT	2	8	5718635	5718642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_017249	CTAGG	2	10	5721010	5721019	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17543	NC_017249	GCG	2	6	5721061	5721066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17544	NC_017249	AAC	2	6	5721068	5721073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17545	NC_017249	ACA	2	6	5721090	5721095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17546	NC_017249	CGA	2	6	5723467	5723472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17547	NC_017249	GGC	2	6	5723549	5723554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17548	NC_017249	AG	3	6	5723584	5723589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17549	NC_017249	CGC	2	6	5723595	5723600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17550	NC_017249	AG	3	6	5723663	5723668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_017249	CTCGC	2	10	5726068	5726077	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17552	NC_017249	GCC	3	9	5726107	5726115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17553	NC_017249	CGG	2	6	5726158	5726163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17554	NC_017249	CG	3	6	5726246	5726251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17555	NC_017249	GC	3	6	5728291	5728296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17556	NC_017249	GGC	2	6	5728302	5728307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17557	NC_017249	CTC	2	6	5728430	5728435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17558	NC_017249	GAG	2	6	5728442	5728447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_017249	GTC	2	6	5730233	5730238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17560	NC_017249	GGAA	2	8	5730253	5730260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_017249	CGA	2	6	5730312	5730317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17562	NC_017249	GGC	2	6	5730325	5730330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17563	NC_017249	TCT	2	6	5731905	5731910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17564	NC_017249	TGC	2	6	5731924	5731929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17565	NC_017249	CTC	2	6	5731930	5731935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17566	NC_017249	TGAC	2	8	5731936	5731943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17567	NC_017249	CAG	2	6	5732023	5732028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17568	NC_017249	CACG	2	8	5732091	5732098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17569	NC_017249	AGCGA	2	10	5732166	5732175	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17570	NC_017249	CG	3	6	5732191	5732196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17571	NC_017249	TCGCT	2	10	5732212	5732221	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17572	NC_017249	GCC	2	6	5732248	5732253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17573	NC_017249	ACC	2	6	5732367	5732372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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17576	NC_017249	GTC	2	6	5732508	5732513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17577	NC_017249	CGA	2	6	5736569	5736574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17578	NC_017249	CCCCG	2	10	5739435	5739444	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
17579	NC_017249	CG	4	8	5739449	5739456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17580	NC_017249	GC	3	6	5739469	5739474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17581	NC_017249	T	6	6	5740661	5740666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17582	NC_017249	TTAT	2	8	5740677	5740684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17583	NC_017249	CGA	2	6	5740700	5740705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17587	NC_017249	GTG	4	12	5743769	5743780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17589	NC_017249	GTGCG	2	10	5745123	5745132	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17590	NC_017249	CG	3	6	5745139	5745144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17593	NC_017249	GCT	2	6	5745262	5745267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17594	NC_017249	AG	4	8	5745292	5745299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17598	NC_017249	AT	3	6	5746867	5746872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17599	NC_017249	TTC	2	6	5748246	5748251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17600	NC_017249	ATT	2	6	5748272	5748277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17602	NC_017249	CG	3	6	5749186	5749191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17603	NC_017249	CG	3	6	5749193	5749198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17604	NC_017249	AGGC	2	8	5749224	5749231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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17606	NC_017249	CATC	2	8	5751025	5751032	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17610	NC_017249	CG	3	6	5754689	5754694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17611	NC_017249	CGC	2	6	5754708	5754713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17612	NC_017249	CGA	2	6	5754735	5754740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17613	NC_017249	TCC	2	6	5754806	5754811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17614	NC_017249	GCC	2	6	5754826	5754831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17615	NC_017249	CGC	2	6	5754863	5754868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17616	NC_017249	GC	3	6	5754917	5754922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17617	NC_017249	GTCGGG	2	12	5754985	5754996	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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17620	NC_017249	GCGCA	2	10	5755138	5755147	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17621	NC_017249	GAC	2	6	5755149	5755154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17622	NC_017249	GC	4	8	5755200	5755207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17623	NC_017249	GCG	2	6	5755210	5755215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17624	NC_017249	GC	3	6	5755252	5755257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17625	NC_017249	CGC	2	6	5755325	5755330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17627	NC_017249	T	6	6	5755492	5755497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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