MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017249	GC	4	8	263682	263689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_017249	AGGGA	2	10	263702	263711	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017249	CAA	2	6	263741	263746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017249	TTGA	2	8	263795	263802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017249	ATC	2	6	265271	265276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017249	CTG	2	6	265952	265957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017249	CGA	2	6	269165	269170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017249	GAT	2	6	269175	269180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017249	GAA	2	6	269182	269187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017249	CAA	2	6	269346	269351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017249	CAAT	2	8	269395	269402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_017249	GCC	2	6	269425	269430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_017249	CATC	2	8	269507	269514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_017249	ATC	2	6	269571	269576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017249	GTC	2	6	269599	269604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017249	C	6	6	269664	269669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1017	NC_017249	ATGT	2	8	269777	269784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017249	CGGT	2	8	269971	269978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_017249	ATC	2	6	269988	269993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017249	ATT	2	6	270021	270026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017249	ATT	2	6	270037	270042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017249	GAG	2	6	270070	270075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017249	CAA	2	6	270096	270101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017249	GCC	2	6	270112	270117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017249	TGGTA	2	10	270228	270237	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017249	CGA	2	6	270251	270256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017249	GAA	2	6	270877	270882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017249	CGC	2	6	271296	271301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_017249	GGC	2	6	271358	271363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017249	TGC	2	6	271364	271369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017249	CAG	2	6	271384	271389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017249	GAT	2	6	271405	271410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017249	GAT	2	6	271455	271460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017249	GGA	2	6	275098	275103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017249	TCCG	2	8	277711	277718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_017249	CCT	2	6	277724	277729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_017249	ACC	2	6	277736	277741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_017249	TCCAC	2	10	277766	277775	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1039	NC_017249	AG	3	6	277813	277818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017249	AGGC	2	8	277854	277861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_017249	CTT	2	6	277922	277927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017249	T	7	7	277967	277973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017249	TGA	2	6	279231	279236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017249	CT	3	6	281585	281590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_017249	TCC	2	6	281618	281623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_017249	CG	3	6	281627	281632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_017249	GTC	2	6	281658	281663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017249	AGC	2	6	281683	281688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017249	CG	3	6	281702	281707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_017249	CGA	2	6	281728	281733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017249	CCTTCT	2	12	282706	282717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_017249	CG	3	6	282720	282725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_017249	A	7	7	282751	282757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017249	A	6	6	282772	282777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017249	CAT	2	6	284257	284262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017249	TGGT	2	8	284362	284369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017249	GTC	2	6	284383	284388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017249	ACG	2	6	284429	284434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017249	CGG	2	6	284505	284510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017249	GCT	2	6	284515	284520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017249	TTCC	2	8	284571	284578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_017249	ATC	2	6	284706	284711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017249	CGC	2	6	284733	284738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_017249	TCG	2	6	284752	284757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017249	GAAG	2	8	287386	287393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017249	GAA	2	6	287412	287417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017249	AAG	2	6	287418	287423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017249	GCT	2	6	287431	287436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017249	ACC	2	6	287448	287453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_017249	CCA	2	6	287455	287460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_017249	CGA	2	6	287468	287473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017249	CTTCG	2	10	287551	287560	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1073	NC_017249	CGG	2	6	287563	287568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_017249	GTT	2	6	287581	287586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017249	GAA	2	6	287590	287595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017249	CAG	2	6	287602	287607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017249	CCTG	2	8	287608	287615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_017249	GCT	2	6	287664	287669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017249	GCTC	2	8	288000	288007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_017249	GA	3	6	288058	288063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017249	ACGGT	2	10	288079	288088	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1082	NC_017249	CA	3	6	288095	288100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_017249	TC	3	6	288136	288141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_017249	CT	3	6	288151	288156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_017249	GAT	2	6	288169	288174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017249	CGA	2	6	288298	288303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017249	AG	3	6	288711	288716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017249	CG	3	6	290145	290150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_017249	ACG	2	6	290165	290170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017249	GTC	2	6	290184	290189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017249	CCT	2	6	290191	290196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_017249	TCA	2	6	290224	290229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017249	ATC	2	6	290242	290247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017249	GCGT	2	8	290277	290284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_017249	CGG	2	6	290311	290316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017249	CAA	2	6	290324	290329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017249	GC	4	8	290366	290373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_017249	CGATC	2	10	292789	292798	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1099	NC_017249	GCC	2	6	292822	292827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_017249	CCCCA	2	10	295337	295346	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1101	NC_017249	AGC	2	6	295379	295384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017249	ACT	2	6	295576	295581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017249	GAC	2	6	295613	295618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017249	GCG	2	6	295657	295662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017249	GCCCC	2	10	297742	297751	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1106	NC_017249	GGATG	2	10	297846	297855	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017249	CGCC	2	8	297906	297913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1108	NC_017249	GCG	2	6	297992	297997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017249	AATCAA	2	12	298014	298025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1110	NC_017249	GCG	2	6	298531	298536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017249	ACC	2	6	298550	298555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_017249	GCT	3	9	298556	298564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017249	GGA	2	6	298600	298605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017249	GAG	2	6	300955	300960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017249	CAA	2	6	300961	300966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017249	GC	3	6	301829	301834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_017249	GC	3	6	301841	301846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_017249	TAT	2	6	301853	301858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017249	ACA	2	6	301992	301997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017249	TC	3	6	303166	303171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_017249	GTG	2	6	303188	303193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017249	CGC	2	6	303236	303241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_017249	TGC	3	9	304377	304385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017249	GAT	2	6	305005	305010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017249	CGT	2	6	305357	305362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017249	GCA	2	6	305376	305381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017249	CG	3	6	305418	305423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_017249	GGAGGG	2	12	306757	306768	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017249	GGGGT	2	10	306802	306811	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017249	TC	3	6	306814	306819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_017249	GA	3	6	306842	306847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017249	CCCTC	2	10	306896	306905	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1133	NC_017249	AG	3	6	311138	311143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017249	GCCG	3	12	311189	311200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_017249	TA	3	6	311850	311855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1169	NC_017249	TCC	2	6	324215	324220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1266	NC_017249	A	6	6	366375	366380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_017249	CG	3	6	366411	366416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1268	NC_017249	AATCA	2	10	366422	366431	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1281	NC_017249	GCGT	2	8	367123	367130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1382	NC_017249	CG	3	6	395657	395662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1383	NC_017249	CGAT	2	8	395664	395671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1384	NC_017249	GAGG	2	8	395702	395709	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1387	NC_017249	CCG	2	6	396001	396006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1393	NC_017249	TAACC	2	10	397034	397043	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1394	NC_017249	CGG	2	6	398223	398228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1401	NC_017249	TCG	2	6	398491	398496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1403	NC_017249	CCG	2	6	399307	399312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1404	NC_017249	CGG	2	6	399328	399333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_017249	GTC	2	6	400050	400055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1409	NC_017249	CGG	3	9	405225	405233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_017249	CGC	2	6	405241	405246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1412	NC_017249	GCGATA	2	12	406242	406253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1435	NC_017249	CCG	2	6	410881	410886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1443	NC_017249	GC	3	6	414791	414796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1444	NC_017249	TCATC	2	10	418128	418137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1445	NC_017249	TC	3	6	418136	418141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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