MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017249	TGT	2	6	77406	77411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017249	ACC	2	6	77496	77501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_017249	CGG	2	6	77505	77510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017249	CCCT	2	8	77845	77852	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
505	NC_017249	TGA	2	6	77854	77859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017249	GGC	2	6	77905	77910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017249	GCC	2	6	77971	77976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_017249	CGG	2	6	78439	78444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017249	CCG	2	6	78492	78497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_017249	GCCGG	2	10	78521	78530	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
511	NC_017249	TCA	2	6	78620	78625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017249	CGC	2	6	81327	81332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_017249	TTCCG	2	10	81346	81355	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
514	NC_017249	AGC	3	9	81885	81893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017249	CGCT	2	8	81910	81917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_017249	ATCGAC	2	12	81946	81957	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017249	GAA	2	6	81960	81965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017249	CCG	2	6	86274	86279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017249	CGC	2	6	86288	86293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_017249	CGTGT	2	10	87722	87731	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
521	NC_017249	CCCG	2	8	87739	87746	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
522	NC_017249	C	6	6	87752	87757	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
523	NC_017249	GCC	2	6	87778	87783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017249	TTG	2	6	87790	87795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017249	CA	3	6	87805	87810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_017249	CTG	2	6	87825	87830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017249	GCA	2	6	87878	87883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017249	GAA	2	6	87899	87904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017249	AAC	2	6	87942	87947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017249	GCC	2	6	87965	87970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_017249	GCGT	2	8	88020	88027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
532	NC_017249	GGGC	2	8	90048	90055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
533	NC_017249	GAG	2	6	91793	91798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017249	AT	3	6	93170	93175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017249	CCG	2	6	93195	93200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_017249	CGT	2	6	94547	94552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017249	GC	3	6	94562	94567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_017249	GC	4	8	94573	94580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_017249	CCG	2	6	94906	94911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_017249	GCG	2	6	94918	94923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017249	TCCG	2	8	96717	96724	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
542	NC_017249	GCG	2	6	96725	96730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017249	AAATG	2	10	96754	96763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017249	CG	3	6	97717	97722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_017249	GGA	2	6	97747	97752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017249	GGT	2	6	97767	97772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017249	GCA	2	6	97796	97801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017249	ATT	2	6	97874	97879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017249	CG	3	6	97948	97953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_017249	GAC	2	6	97960	97965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017249	AAT	2	6	98797	98802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017249	GGA	2	6	98866	98871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017249	GT	3	6	98878	98883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017249	AAT	2	6	98903	98908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017249	GCG	2	6	98953	98958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017249	CAT	2	6	98969	98974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017249	CTG	2	6	98983	98988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017249	GCG	2	6	98999	99004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017249	GCA	2	6	99035	99040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017249	TC	3	6	100030	100035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_017249	GA	3	6	100064	100069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017249	ATG	2	6	102401	102406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017249	GAC	3	9	102417	102425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017249	GC	4	8	102442	102449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_017249	GCG	2	6	102537	102542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017249	AAT	2	6	102551	102556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017249	GGA	2	6	102571	102576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017249	ATG	2	6	103730	103735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017249	TTGC	2	8	103761	103768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_017249	CAGGG	2	10	103799	103808	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
571	NC_017249	GCG	2	6	104624	104629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017249	GC	3	6	104637	104642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017249	CG	4	8	104665	104672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017249	CG	3	6	104683	104688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_017249	C	6	6	104967	104972	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
576	NC_017249	CGCCT	2	10	105062	105071	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
577	NC_017249	AGTA	2	8	105124	105131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017249	CTGG	2	8	107987	107994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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580	NC_017249	AGC	2	6	109308	109313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017249	CCCT	2	8	110460	110467	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
582	NC_017249	CGA	2	6	110502	110507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017249	GC	3	6	110562	110567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_017249	TCAA	2	8	110634	110641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_017249	AACG	2	8	110645	110652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_017249	GCC	2	6	111705	111710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_017249	CAC	2	6	111750	111755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_017249	TGA	2	6	111767	111772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017249	TGG	2	6	111778	111783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017249	CGCTTT	2	12	111786	111797	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017249	CGT	2	6	113434	113439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017249	GAT	2	6	113445	113450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017249	TCC	2	6	114532	114537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_017249	GTC	2	6	114538	114543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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596	NC_017249	CTTG	2	8	115960	115967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
597	NC_017249	CCA	2	6	116004	116009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_017249	GCC	2	6	116935	116940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_017249	CAG	2	6	119955	119960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_017249	CGA	2	6	119975	119980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017249	AAGG	2	8	120079	120086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017249	GCC	2	6	120189	120194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017249	GAC	2	6	120258	120263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017249	GCA	2	6	120277	120282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017249	CAA	2	6	120284	120289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017249	GCT	2	6	120301	120306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017249	TCC	2	6	121130	121135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_017249	GCC	2	6	121149	121154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_017249	GGC	2	6	121202	121207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017249	GGC	2	6	121222	121227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017249	AAT	2	6	123006	123011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017249	CGC	3	9	123012	123020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_017249	GCCA	2	8	125237	125244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
615	NC_017249	GGCC	2	8	125255	125262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_017249	CAA	2	6	125278	125283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017249	CCG	2	6	125291	125296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_017249	AGC	2	6	125353	125358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017249	CG	3	6	126109	126114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_017249	AGGA	2	8	127326	127333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017249	CGA	2	6	127362	127367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017249	CGA	2	6	127381	127386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017249	GC	3	6	127464	127469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_017249	GTC	2	6	127486	127491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017249	CGG	2	6	127839	127844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017249	CTTGGC	2	12	127849	127860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017249	CCG	2	6	128070	128075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_017249	CGA	2	6	128101	128106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017249	CGC	2	6	128201	128206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_017249	CGA	2	6	128791	128796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017249	TCT	2	6	128829	128834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017249	CGG	2	6	128930	128935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017249	TCA	2	6	128955	128960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017249	GAAGA	2	10	128967	128976	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017249	AG	3	6	129011	129016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017249	A	6	6	129097	129102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017249	CCG	2	6	129149	129154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_017249	TGCGGG	2	12	129188	129199	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
639	NC_017249	AGCAG	2	10	129215	129224	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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767	NC_017249	GAG	2	6	175868	175873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
768	NC_017249	CG	3	6	175919	175924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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781	NC_017249	GCG	2	6	177370	177375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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786	NC_017249	GAC	2	6	177583	177588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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904	NC_017249	CGTTC	2	10	231530	231539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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910	NC_017249	CAA	2	6	232721	232726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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912	NC_017249	CGA	2	6	232817	232822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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