MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017249	GCA	2	6	2027550	2027555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_017249	GGTC	2	8	2027566	2027573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_017249	ATC	2	6	2027582	2027587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_017249	TCA	2	6	2027619	2027624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_017249	CTTG	2	8	2027636	2027643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_017249	GCC	2	6	2028650	2028655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_017249	CG	3	6	2028735	2028740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_017249	ACG	2	6	2028748	2028753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_017249	GGCCG	2	10	2028800	2028809	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6010	NC_017249	AC	4	8	2028855	2028862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_017249	GGC	2	6	2030947	2030952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_017249	CCA	2	6	2030997	2031002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_017249	GGC	2	6	2031003	2031008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_017249	GCAG	2	8	2031010	2031017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_017249	GAAT	2	8	2031032	2031039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017249	GA	3	6	2031115	2031120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017249	GA	3	6	2031136	2031141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017249	CGC	2	6	2031148	2031153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_017249	AAC	2	6	2031191	2031196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_017249	GGCG	2	8	2031214	2031221	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_017249	CGG	2	6	2033473	2033478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_017249	CCG	2	6	2033488	2033493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_017249	TTGT	2	8	2033497	2033504	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017249	GGC	2	6	2033771	2033776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_017249	GTC	2	6	2033779	2033784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_017249	CGG	2	6	2033812	2033817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_017249	CAG	2	6	2033852	2033857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_017249	TCG	2	6	2033881	2033886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_017249	GCG	2	6	2033891	2033896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_017249	CTG	2	6	2033905	2033910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_017249	CGG	2	6	2033930	2033935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_017249	CCG	2	6	2033946	2033951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_017249	TAGAA	2	10	2033999	2034008	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017249	GGCAA	2	10	2034032	2034041	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6035	NC_017249	CGCAA	2	10	2034165	2034174	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6036	NC_017249	GC	3	6	2034183	2034188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_017249	TCC	2	6	2034217	2034222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_017249	CGG	2	6	2034272	2034277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_017249	CGCGTG	2	12	2034288	2034299	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_017249	GATG	2	8	2034346	2034353	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017249	TGAG	2	8	2034376	2034383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017249	AGG	2	6	2035346	2035351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_017249	CG	3	6	2035366	2035371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_017249	GC	3	6	2035392	2035397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_017249	GCCC	2	8	2035602	2035609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6046	NC_017249	CAT	2	6	2037587	2037592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_017249	GCC	3	9	2037678	2037686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_017249	CGT	2	6	2037707	2037712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_017249	GA	3	6	2037738	2037743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017249	CGCC	2	8	2038576	2038583	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6051	NC_017249	GGGC	2	8	2038604	2038611	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_017249	GGC	2	6	2038628	2038633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_017249	GCG	2	6	2038719	2038724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_017249	CGT	2	6	2038728	2038733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_017249	CA	3	6	2039672	2039677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_017249	AGCA	2	8	2039678	2039685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_017249	TC	3	6	2040748	2040753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_017249	A	6	6	2040794	2040799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017249	CTT	3	9	2040892	2040900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_017249	CTT	2	6	2040907	2040912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_017249	TCG	2	6	2040924	2040929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_017249	CTT	2	6	2040931	2040936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_017249	CTT	2	6	2040940	2040945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_017249	CGG	2	6	2041007	2041012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_017249	CAG	2	6	2041047	2041052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_017249	GGC	2	6	2041060	2041065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_017249	CG	3	6	2041158	2041163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_017249	G	6	6	2041333	2041338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017249	A	6	6	2043936	2043941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017249	GCC	2	6	2043951	2043956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_017249	CTT	2	6	2043966	2043971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_017249	A	6	6	2043996	2044001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_017249	GCG	2	6	2044940	2044945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_017249	GAC	2	6	2044955	2044960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_017249	GCCG	2	8	2044973	2044980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_017249	ACGTC	2	10	2045059	2045068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6077	NC_017249	TGTAA	2	10	2045092	2045101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_017249	GGC	2	6	2045113	2045118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_017249	GCTC	2	8	2046478	2046485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_017249	GCG	2	6	2046494	2046499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_017249	CGTT	2	8	2046639	2046646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_017249	GCG	2	6	2046678	2046683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_017249	TGCC	2	8	2046699	2046706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6084	NC_017249	TGGC	2	8	2046745	2046752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_017249	TCG	2	6	2046772	2046777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6087	NC_017249	CGA	2	6	2046926	2046931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_017249	GA	3	6	2046930	2046935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_017249	ACA	2	6	2046946	2046951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_017249	CGA	2	6	2047030	2047035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_017249	GACG	2	8	2047059	2047066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_017249	CGTG	2	8	2047185	2047192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6093	NC_017249	TG	3	6	2047229	2047234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_017249	GC	3	6	2047299	2047304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_017249	TTGG	2	8	2052797	2052804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6097	NC_017249	GCGCC	2	10	2052898	2052907	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6098	NC_017249	CGT	2	6	2052931	2052936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_017249	GC	3	6	2053087	2053092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_017249	TG	3	6	2053235	2053240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017249	GCC	2	6	2055071	2055076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_017249	CGC	2	6	2055089	2055094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_017249	CTA	2	6	2056215	2056220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_017249	CG	3	6	2057212	2057217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_017249	GCG	2	6	2057281	2057286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_017249	CGA	2	6	2057301	2057306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_017249	TGCGC	2	10	2057346	2057355	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6108	NC_017249	TCA	2	6	2057366	2057371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_017249	AGCG	2	8	2057372	2057379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6110	NC_017249	CGC	2	6	2057402	2057407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_017249	CCG	3	9	2057435	2057443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_017249	A	6	6	2057444	2057449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_017249	CGGG	2	8	2057579	2057586	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_017249	GAAA	2	8	2058900	2058907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017249	CTG	2	6	2058953	2058958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6117	NC_017249	AAG	2	6	2058971	2058976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017249	TCA	2	6	2059029	2059034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_017249	AGC	2	6	2059068	2059073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6121	NC_017249	GTCG	2	8	2062910	2062917	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6122	NC_017249	A	6	6	2062978	2062983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6124	NC_017249	CGC	2	6	2065010	2065015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6126	NC_017249	GAG	2	6	2066048	2066053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_017249	CGTT	2	8	2066061	2066068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6128	NC_017249	CGT	2	6	2067121	2067126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_017249	GC	3	6	2067144	2067149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_017249	GAA	2	6	2068935	2068940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_017249	GAA	2	6	2069049	2069054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6380	NC_017249	GGAAGA	2	12	2112773	2112784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6381	NC_017249	TCGAT	2	10	2114311	2114320	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6392	NC_017249	TCG	2	6	2120562	2120567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6394	NC_017249	GAC	2	6	2120801	2120806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6395	NC_017249	ATC	2	6	2120822	2120827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6396	NC_017249	GGC	2	6	2120837	2120842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6397	NC_017249	CGC	2	6	2120884	2120889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6398	NC_017249	TTG	2	6	2120941	2120946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6399	NC_017249	CT	4	8	2120957	2120964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6400	NC_017249	ATA	2	6	2120988	2120993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_017249	ACA	2	6	2121003	2121008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6402	NC_017249	ATC	2	6	2121018	2121023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6403	NC_017249	GTCG	2	8	2121034	2121041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6426	NC_017249	GTTC	2	8	2128539	2128546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6427	NC_017249	GGA	2	6	2128562	2128567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6428	NC_017249	GGAGC	2	10	2128764	2128773	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6429	NC_017249	CTT	2	6	2128790	2128795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6432	NC_017249	GC	3	6	2128820	2128825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6433	NC_017249	ATCG	2	8	2128901	2128908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6434	NC_017249	CGG	2	6	2128909	2128914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6437	NC_017249	GGC	2	6	2129961	2129966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6454	NC_017249	CAC	2	6	2135981	2135986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6472	NC_017249	AG	3	6	2138019	2138024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6473	NC_017249	ATG	2	6	2138036	2138041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6497	NC_017249	GCGCA	2	10	2145200	2145209	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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