MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017249	GCA	2	6	1675982	1675987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017249	TCC	2	6	1676000	1676005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_017249	TCCGT	2	10	1676565	1676574	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5004	NC_017249	ACG	2	6	1676724	1676729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017249	ACA	2	6	1676781	1676786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_017249	CTT	2	6	1677390	1677395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017249	GCG	2	6	1677408	1677413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017249	CG	3	6	1677483	1677488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_017249	GCC	2	6	1677522	1677527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_017249	GC	3	6	1677568	1677573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_017249	GCG	2	6	1677608	1677613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017249	GCCG	2	8	1678765	1678772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_017249	TATAA	2	10	1678789	1678798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017249	CCG	2	6	1681560	1681565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_017249	CG	3	6	1681571	1681576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_017249	GCG	2	6	1684412	1684417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_017249	GC	3	6	1684423	1684428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_017249	CGG	3	9	1684846	1684854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017249	GTGG	2	8	1687220	1687227	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017249	CG	3	6	1687700	1687705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_017249	CGC	2	6	1687711	1687716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_017249	GGC	2	6	1687721	1687726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017249	CAT	2	6	1687739	1687744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017249	CGT	2	6	1688394	1688399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017249	CGG	2	6	1688426	1688431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_017249	A	6	6	1689668	1689673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017249	GTC	2	6	1689675	1689680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017249	CG	3	6	1689704	1689709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_017249	CGA	2	6	1689719	1689724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_017249	TGC	2	6	1689747	1689752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017249	TTGG	2	8	1689759	1689766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017249	CCCG	2	8	1689774	1689781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5033	NC_017249	CCG	2	6	1689834	1689839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_017249	A	6	6	1689849	1689854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017249	CGT	2	6	1689863	1689868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_017249	GA	4	8	1689973	1689980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017249	CTT	2	6	1690053	1690058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017249	GGC	2	6	1690067	1690072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017249	TACC	2	8	1690093	1690100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_017249	AC	3	6	1690106	1690111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_017249	T	7	7	1690177	1690183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017249	GCGA	2	8	1690228	1690235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_017249	CG	3	6	1690249	1690254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_017249	T	6	6	1690260	1690265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017249	GC	3	6	1690273	1690278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_017249	GC	4	8	1690284	1690291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_017249	GGC	2	6	1690601	1690606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_017249	A	6	6	1690629	1690634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017249	CAA	2	6	1690661	1690666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017249	GTC	2	6	1693416	1693421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_017249	TTG	2	6	1693470	1693475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017249	CTTC	2	8	1694550	1694557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_017249	GGAGGG	2	12	1694568	1694579	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017249	TCCC	2	8	1694989	1694996	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5055	NC_017249	CG	3	6	1695051	1695056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_017249	GGGC	2	8	1697189	1697196	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_017249	TTG	2	6	1697214	1697219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017249	CTT	2	6	1697815	1697820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017249	GGA	2	6	1697919	1697924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017249	A	6	6	1698989	1698994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017249	AGG	2	6	1699034	1699039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017249	GCGA	2	8	1699503	1699510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_017249	GCTTC	2	10	1699552	1699561	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5064	NC_017249	TTG	2	6	1699578	1699583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017249	TGC	2	6	1699921	1699926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_017249	AAT	2	6	1699964	1699969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017249	GC	3	6	1700692	1700697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_017249	ATG	2	6	1700743	1700748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017249	GAG	2	6	1701817	1701822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017249	GCC	2	6	1701877	1701882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_017249	TCA	2	6	1701955	1701960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017249	CGC	2	6	1703843	1703848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_017249	CAT	2	6	1703853	1703858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_017249	TTG	2	6	1703919	1703924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017249	GCA	2	6	1703930	1703935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017249	CTT	2	6	1705437	1705442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_017249	GAG	2	6	1705456	1705461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017249	CGA	2	6	1705467	1705472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_017249	GAG	2	6	1705492	1705497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017249	TTC	2	6	1710412	1710417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_017249	GCAA	2	8	1710497	1710504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_017249	CA	3	6	1710557	1710562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_017249	GC	3	6	1710564	1710569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_017249	GC	3	6	1710705	1710710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_017249	CGC	2	6	1710713	1710718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_017249	AAG	2	6	1710719	1710724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017249	GTC	2	6	1711594	1711599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017249	GAC	2	6	1711614	1711619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017249	CAAAA	2	10	1711638	1711647	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5090	NC_017249	GCG	2	6	1711678	1711683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_017249	CG	3	6	1711686	1711691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_017249	TGC	2	6	1712485	1712490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017249	GATGC	2	10	1712546	1712555	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5094	NC_017249	A	6	6	1712562	1712567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017249	GGC	2	6	1712600	1712605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_017249	TCC	2	6	1713086	1713091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_017249	CCCG	2	8	1713111	1713118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5098	NC_017249	CGGGC	2	10	1713124	1713133	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5099	NC_017249	TG	3	6	1713141	1713146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017249	GTTCCG	2	12	1713156	1713167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017249	GGC	2	6	1713227	1713232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_017249	GCA	2	6	1713269	1713274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017249	AGC	2	6	1714237	1714242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_017249	GCAG	2	8	1714282	1714289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_017249	TAC	2	6	1717188	1717193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_017249	AAG	2	6	1717205	1717210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017249	CTGTC	2	10	1717225	1717234	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5108	NC_017249	GCC	2	6	1717284	1717289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_017249	CGG	3	9	1719248	1719256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_017249	CCGAA	2	10	1719257	1719266	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5111	NC_017249	GGAC	2	8	1719282	1719289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_017249	CG	3	6	1719985	1719990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_017249	CG	3	6	1721193	1721198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_017249	GAG	2	6	1721249	1721254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017249	GAC	2	6	1722180	1722185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017249	CCAC	2	8	1722210	1722217	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5117	NC_017249	GCG	2	6	1723098	1723103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017249	TCAAT	2	10	1723193	1723202	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5119	NC_017249	GCTC	2	8	1725033	1725040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_017249	TTG	2	6	1725331	1725336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017249	CCT	2	6	1725367	1725372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_017249	TCC	2	6	1725381	1725386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_017249	CTT	2	6	1725401	1725406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_017249	T	6	6	1725422	1725427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017249	CGAAG	2	10	1725466	1725475	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5126	NC_017249	GCGAT	2	10	1725520	1725529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5127	NC_017249	CG	3	6	1725530	1725535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_017249	GCG	3	9	1725533	1725541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_017249	CGC	2	6	1726463	1726468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_017249	CGG	2	6	1726620	1726625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5132	NC_017249	GCAGC	2	10	1726666	1726675	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5265	NC_017249	CAT	2	6	1768744	1768749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_017249	GGA	2	6	1768780	1768785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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