MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis M5-90 chromosome chromosome II

Total Repeats: 404

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017247	GAAA	2	8	146	153	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017247	CGAT	2	8	9010	9017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017247	TGAT	2	8	20698	20705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017247	ACCG	2	8	27331	27338	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017247	AAAC	2	8	27930	27937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017247	CCTT	2	8	27954	27961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017247	GACA	2	8	30200	30207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017247	ATCT	2	8	31494	31501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017247	TCAA	2	8	33168	33175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017247	ACCC	2	8	36163	36170	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_017247	GCCT	2	8	39275	39282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017247	GTTC	2	8	43233	43240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017247	CATA	2	8	46449	46456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017247	CTGT	2	8	46629	46636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017247	GAAT	2	8	46734	46741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017247	AAAC	2	8	54757	54764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017247	ATGG	2	8	56127	56134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017247	TGTT	2	8	56498	56505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017247	GGCC	2	8	60742	60749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017247	AAGG	2	8	60769	60776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017247	CCAG	2	8	62071	62078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017247	TGCT	2	8	66150	66157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017247	CAAA	2	8	66355	66362	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017247	CCGC	2	8	66451	66458	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_017247	GCCG	2	8	69170	69177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017247	ATGA	2	8	69369	69376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017247	GGGC	2	8	83741	83748	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017247	TTAA	2	8	92456	92463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017247	ATAA	2	8	96933	96940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017247	GATA	2	8	103460	103467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017247	CGTT	2	8	107968	107975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017247	TCTT	2	8	112586	112593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017247	TGCC	2	8	112601	112608	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017247	ATTT	2	8	129268	129275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017247	ATTT	2	8	129818	129825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017247	CGTC	2	8	129930	129937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017247	TTAA	2	8	134448	134455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017247	ACGA	2	8	134546	134553	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017247	ATTG	2	8	134997	135004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017247	TGAA	2	8	135118	135125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017247	ATAC	2	8	141966	141973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017247	CGGA	2	8	142110	142117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017247	TAGG	2	8	155437	155444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017247	GAAA	2	8	155836	155843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017247	GCGG	2	8	155929	155936	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017247	GGCG	2	8	156878	156885	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017247	TTTC	2	8	159367	159374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017247	GTTC	2	8	160802	160809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017247	TGAA	2	8	161002	161009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017247	GCTT	2	8	161842	161849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017247	ACGG	2	8	163033	163040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017247	GGGC	2	8	163228	163235	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017247	CACG	2	8	170310	170317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017247	TTCC	2	8	171065	171072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017247	CAGG	2	8	171099	171106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017247	TCAA	2	8	174461	174468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017247	GGCT	2	8	177953	177960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017247	TTGA	2	8	178067	178074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017247	AGGC	2	8	178492	178499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017247	GCCT	2	8	178504	178511	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017247	CGGG	2	8	178810	178817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017247	TATT	2	8	178920	178927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017247	ATTC	2	8	183754	183761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017247	GGCT	2	8	186855	186862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017247	TCGC	2	8	189050	189057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017247	GAAA	2	8	199543	199550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017247	ATAG	2	8	211489	211496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017247	TGCC	2	8	217678	217685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017247	GCCT	2	8	218217	218224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017247	CGGG	2	8	218246	218253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017247	AAAT	2	8	222012	222019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017247	CTGC	2	8	223476	223483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017247	TCGA	2	8	225364	225371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017247	GCCG	2	8	225388	225395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017247	CTGC	2	8	230643	230650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017247	CGGG	2	8	232645	232652	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017247	TTTG	2	8	238225	238232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017247	ACAG	2	8	240066	240073	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017247	ATTG	2	8	240961	240968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017247	TGGG	2	8	242220	242227	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017247	AATT	2	8	245351	245358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017247	TGGA	2	8	245378	245385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017247	GTTC	2	8	245508	245515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017247	AGTA	2	8	246695	246702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017247	CCGG	2	8	246902	246909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017247	TCAA	2	8	254992	254999	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017247	ACCA	2	8	270207	270214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017247	ATTG	2	8	286051	286058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017247	TCAT	2	8	288001	288008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017247	CTGT	2	8	288169	288176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017247	AGGC	2	8	294412	294419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017247	TTGT	2	8	294662	294669	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017247	CCTG	2	8	297005	297012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017247	CTAT	2	8	297028	297035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017247	CGGG	2	8	297275	297282	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017247	CAGT	2	8	297382	297389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017247	GCTT	2	8	301526	301533	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017247	GGCG	2	8	301543	301550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017247	AATG	2	8	301581	301588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017247	AAAT	2	8	301920	301927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017247	CCGG	2	8	302258	302265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017247	GCGG	2	8	306589	306596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017247	GCCG	2	8	309825	309832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017247	TCCA	2	8	310062	310069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017247	GCTC	2	8	310199	310206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017247	AGGA	2	8	310583	310590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017247	TTTG	2	8	311223	311230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017247	TTGG	2	8	316953	316960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017247	GGAG	2	8	316989	316996	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017247	TGTT	2	8	317027	317034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017247	GCGG	2	8	322039	322046	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017247	TCCA	2	8	324514	324521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017247	CTTG	2	8	324714	324721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017247	AATT	2	8	324799	324806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017247	GTCA	2	8	325324	325331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017247	GCTG	2	8	325801	325808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017247	CCAG	2	8	331781	331788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017247	CATG	2	8	337686	337693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017247	CAGC	2	8	337706	337713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017247	GATG	2	8	343007	343014	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017247	TAAG	2	8	350452	350459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017247	GGGC	2	8	353883	353890	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017247	GGCG	2	8	355178	355185	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017247	TCCT	2	8	368009	368016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017247	ATTA	2	8	375249	375256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017247	ATTT	2	8	379330	379337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017247	AAAT	2	8	390939	390946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017247	GAGC	2	8	395745	395752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017247	GGGC	2	8	398210	398217	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017247	GGCA	2	8	399803	399810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017247	CTTT	2	8	406967	406974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017247	GTAT	2	8	407106	407113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017247	TTTG	2	8	410022	410029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017247	AAGC	2	8	413173	413180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017247	GACG	2	8	413201	413208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017247	GCCT	2	8	414515	414522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017247	AGCC	2	8	424312	424319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017247	GGTT	2	8	425978	425985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017247	ACTT	2	8	427957	427964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017247	CTCC	2	8	429403	429410	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_017247	GATA	2	8	429613	429620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017247	AATC	2	8	429701	429708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017247	GATT	2	8	429709	429716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017247	GTCG	2	8	440104	440111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017247	GGGT	2	8	442313	442320	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017247	CAGC	2	8	442737	442744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017247	GCAA	2	8	442852	442859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017247	TCCC	2	8	443224	443231	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_017247	GCCA	2	8	449387	449394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017247	AAAG	2	8	449404	449411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017247	TGGC	2	8	450546	450553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.