MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis M5-90 chromosome chromosome I

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017246	ACGGTT	2	12	34830	34841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017246	CCTGGC	2	12	81331	81342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017246	TTTTGC	2	12	94459	94470	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017246	GCTTTT	2	12	103237	103248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017246	GGGGAA	2	12	169697	169708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017246	TCTGGC	2	12	186188	186199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017246	CCGTGG	2	12	261990	262001	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017246	GCATGG	2	12	273487	273498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017246	CTCCCG	2	12	274064	274075	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017246	TTCTGC	2	12	276784	276795	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017246	CACGCG	2	12	279610	279621	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017246	ACGCGC	2	12	279731	279742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017246	GCTTCC	2	12	293667	293678	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017246	CTGATG	2	12	296739	296750	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017246	GGCACA	2	12	307159	307170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017246	CGATCT	2	12	331194	331205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017246	CTGAAA	2	12	352797	352808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017246	CTTTTT	2	12	359325	359336	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017246	TGATTT	2	12	359344	359355	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017246	CTGTCT	2	12	363570	363581	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017246	TTGCCT	2	12	363876	363887	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017246	TTGCAA	2	12	397985	397996	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017246	CAGCGC	2	12	406864	406875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017246	TTTAAC	2	12	453748	453759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017246	CGTTTT	2	12	527086	527097	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017246	CGTCAC	2	12	534897	534908	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017246	ATGACC	2	12	535999	536010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017246	CTCTAT	2	12	538093	538104	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017246	TGCTGT	2	12	546781	546792	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017246	ACGGTC	2	12	547164	547175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017246	TGCAGG	2	12	555896	555907	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017246	TTACGT	2	12	577361	577372	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017246	TCCAAA	2	12	645250	645261	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017246	ATTTGT	2	12	682215	682226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017246	GGGTCG	2	12	727666	727677	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017246	CATCGC	2	12	731718	731729	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017246	ATTGAA	2	12	773078	773089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017246	CTTTTC	2	12	789064	789075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017246	TCGCGC	2	12	829741	829752	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017246	GCTGGC	2	12	888869	888880	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017246	GAAATT	2	12	921712	921723	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017246	AGACGC	2	12	953470	953481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017246	CGCCAG	2	12	961781	961792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017246	GTTCAG	2	12	974159	974170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017246	TGCCGG	2	12	999297	999308	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017246	GCTGAT	2	12	1017415	1017426	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017246	TATTTT	2	12	1036706	1036717	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017246	GGACTT	2	12	1039939	1039950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017246	CTCTTC	2	12	1095344	1095355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017246	TGAATT	2	12	1256504	1256515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017246	CGTTTC	2	12	1313478	1313489	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017246	CACCGC	2	12	1314531	1314542	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017246	AAAACA	2	12	1314720	1314731	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017246	TGGAAC	2	12	1335374	1335385	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017246	GTAAAA	2	12	1423679	1423690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017246	CATCGG	2	12	1455303	1455314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017246	ATGCCA	2	12	1457718	1457729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017246	CTGAAA	2	12	1468638	1468649	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017246	GCTCTG	2	12	1492056	1492067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017246	AAAAGC	2	12	1564601	1564612	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017246	CTGCCG	2	12	1611167	1611178	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017246	AATGCC	2	12	1669835	1669846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017246	GGCAGC	2	12	1695889	1695900	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017246	TCAGCG	2	12	1768013	1768024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017246	GTCGAA	2	12	1779758	1779769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017246	CAAAAA	2	12	1797425	1797436	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017246	TTGCAT	2	12	1803828	1803839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017246	CTGCCG	2	12	1814553	1814564	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017246	AGAAAC	2	12	1860880	1860891	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017246	AACTCA	2	12	1877011	1877022	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017246	ACGTAA	2	12	1880503	1880514	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017246	GAAACG	2	12	1920586	1920597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017246	TTCTAT	2	12	1964959	1964970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017246	TTCTTT	2	12	2080909	2080920	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017246	GGAAAC	2	12	2104920	2104931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017246	TCTTTG	2	12	2118654	2118665	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.