MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis M28 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 402

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017245	GAAA	2	8	147	154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017245	CGAT	2	8	9010	9017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017245	TGAT	2	8	20698	20705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017245	ACCG	2	8	27331	27338	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017245	AAAC	2	8	27930	27937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017245	CCTT	2	8	27954	27961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017245	GACA	2	8	30200	30207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017245	ATCT	2	8	31494	31501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017245	TCAA	2	8	33168	33175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017245	ACCC	2	8	36163	36170	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_017245	GCCT	2	8	39275	39282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017245	GTTC	2	8	43233	43240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017245	CATA	2	8	46449	46456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017245	CTGT	2	8	46629	46636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017245	GAAT	2	8	46734	46741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017245	AAAC	2	8	54757	54764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017245	ATGG	2	8	56127	56134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017245	TGTT	2	8	56498	56505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017245	GGCC	2	8	60742	60749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017245	AAGG	2	8	60769	60776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017245	CCAG	2	8	62071	62078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017245	TGCT	2	8	66150	66157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017245	CAAA	2	8	66355	66362	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017245	CCGC	2	8	66451	66458	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_017245	GCCG	2	8	69170	69177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017245	ATGA	2	8	69369	69376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017245	GGGC	2	8	83735	83742	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017245	TTAA	2	8	92450	92457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017245	ATAA	2	8	96927	96934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017245	GATA	2	8	103454	103461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017245	TCTT	2	8	112581	112588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017245	TGCC	2	8	112596	112603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017245	ATTT	2	8	129263	129270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017245	ATTT	2	8	129813	129820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017245	CGTC	2	8	129925	129932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017245	TTAA	2	8	134443	134450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017245	ACGA	2	8	134541	134548	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017245	TGAA	2	8	135113	135120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017245	ATAC	2	8	141961	141968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017245	CGGA	2	8	142105	142112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017245	TAGG	2	8	155432	155439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017245	GAAA	2	8	155831	155838	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017245	GCGG	2	8	155924	155931	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017245	GGCG	2	8	156873	156880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017245	TTTC	2	8	159362	159369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017245	GTTC	2	8	160797	160804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017245	TGAA	2	8	160997	161004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017245	GCTT	2	8	161837	161844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017245	ACGG	2	8	163028	163035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017245	GGGC	2	8	163223	163230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017245	ATGA	2	8	169579	169586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017245	CACG	2	8	170305	170312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017245	TTCC	2	8	171060	171067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017245	CAGG	2	8	171094	171101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017245	TCAA	2	8	174456	174463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017245	GGCT	2	8	177949	177956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017245	TTGA	2	8	178063	178070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017245	AGGC	2	8	178488	178495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017245	GCCT	2	8	178500	178507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017245	CGGG	2	8	178806	178813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017245	TATT	2	8	178916	178923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017245	ATTC	2	8	183750	183757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017245	GGCT	2	8	186851	186858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017245	TCGC	2	8	189046	189053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017245	GAAA	2	8	199539	199546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017245	ATAG	2	8	211485	211492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017245	TGCC	2	8	217674	217681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017245	GCCT	2	8	218213	218220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017245	CGGG	2	8	218242	218249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017245	AAAT	2	8	222008	222015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017245	CTGC	2	8	223472	223479	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017245	TCGA	2	8	225360	225367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017245	GCCG	2	8	225384	225391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017245	CTGC	2	8	230639	230646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017245	CGGG	2	8	232641	232648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017245	TTTG	2	8	238221	238228	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017245	ACAG	2	8	240062	240069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017245	ATTG	2	8	240957	240964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017245	TGGG	2	8	242216	242223	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017245	AGTA	2	8	246691	246698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017245	CCGG	2	8	246898	246905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017245	TCAA	2	8	254988	254995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017245	ACCA	2	8	270202	270209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017245	ATTG	2	8	286046	286053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017245	TCAT	2	8	287996	288003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017245	CTGT	2	8	288164	288171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017245	AGGC	2	8	294407	294414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017245	TTGT	2	8	294657	294664	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017245	CCTG	2	8	297000	297007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017245	CTAT	2	8	297023	297030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017245	CGGG	2	8	297270	297277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017245	CAGT	2	8	297377	297384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017245	GCTT	2	8	301521	301528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017245	GGCG	2	8	301538	301545	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017245	AATG	2	8	301576	301583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017245	AAAT	2	8	301915	301922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017245	CCGG	2	8	302253	302260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017245	GCGG	2	8	306584	306591	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017245	GCCG	2	8	309820	309827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017245	TCCA	2	8	310057	310064	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017245	GCTC	2	8	310194	310201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017245	AGGA	2	8	310578	310585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017245	TTTG	2	8	311218	311225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017245	TTGG	2	8	316948	316955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017245	GGAG	2	8	316984	316991	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017245	TGTT	2	8	317022	317029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017245	GCGG	2	8	322034	322041	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017245	TCCA	2	8	324509	324516	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017245	CTTG	2	8	324709	324716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017245	AATT	2	8	324794	324801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017245	GTCA	2	8	325319	325326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017245	GCTG	2	8	325796	325803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017245	CCAG	2	8	331776	331783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017245	CATG	2	8	337681	337688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017245	CAGC	2	8	337701	337708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017245	GATG	2	8	343001	343008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017245	TAAG	2	8	350446	350453	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017245	GGGC	2	8	353877	353884	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017245	GGCG	2	8	355172	355179	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017245	TCCT	2	8	368003	368010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017245	ATTA	2	8	375244	375251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017245	ATTT	2	8	379325	379332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017245	AAAT	2	8	390933	390940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017245	GAGC	2	8	395739	395746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017245	GGCA	2	8	399797	399804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017245	CTTT	2	8	406961	406968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017245	GTAT	2	8	407100	407107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017245	TTTG	2	8	410016	410023	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017245	AAGC	2	8	413167	413174	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017245	GACG	2	8	413195	413202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017245	GCCT	2	8	414509	414516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017245	AGCC	2	8	424306	424313	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017245	GGTT	2	8	425972	425979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017245	ACTT	2	8	427951	427958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017245	CTCC	2	8	429397	429404	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_017245	GATA	2	8	429607	429614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017245	AATC	2	8	429695	429702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017245	GATT	2	8	429703	429710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017245	GTCG	2	8	440098	440105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017245	GGGT	2	8	442307	442314	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017245	CAGC	2	8	442731	442738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017245	GCAA	2	8	442846	442853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017245	TCCC	2	8	443218	443225	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_017245	GCCA	2	8	449381	449388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017245	AAAG	2	8	449398	449405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017245	TGGC	2	8	450540	450547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017245	AGCG	2	8	450565	450572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017245	AATC	2	8	456296	456303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017245	ATGG	2	8	456412	456419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017245	CGGC	2	8	456488	456495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017245	GATT	2	8	458382	458389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017245	GGAC	2	8	458563	458570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017245	ATGC	2	8	460066	460073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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170	NC_017245	GATT	2	8	518934	518941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_017245	GATT	2	8	522196	522203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_017245	GGCA	2	8	576976	576983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.