MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017243	TAT	2	6	420744	420749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017243	TAATA	2	10	420755	420764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017243	T	6	6	420770	420775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017243	ATT	2	6	420792	420797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017243	TAA	2	6	420802	420807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017243	AT	3	6	420856	420861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017243	T	6	6	420889	420894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017243	AT	3	6	420895	420900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017243	ATA	2	6	420908	420913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017243	TA	3	6	420919	420924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017243	A	7	7	420924	420930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017243	ATT	2	6	420934	420939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017243	TAT	2	6	422095	422100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017243	TA	4	8	422132	422139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017243	TAT	2	6	422147	422152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017243	ATA	2	6	422160	422165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017243	A	6	6	422172	422177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017243	TAA	2	6	422183	422188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017243	A	6	6	422210	422215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017243	AT	3	6	422262	422267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017243	A	6	6	422271	422276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017243	A	6	6	422286	422291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017243	ATAA	2	8	423814	423821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017243	AGG	2	6	423823	423828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017243	AATT	2	8	423829	423836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017243	TTA	2	6	423873	423878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017243	GGA	2	6	423888	423893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017243	CTTT	2	8	423898	423905	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_017243	AAGA	2	8	423920	423927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017243	TAT	2	6	423991	423996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017243	TATAT	2	10	424003	424012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017243	ATGTAT	2	12	424025	424036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017243	AT	3	6	424060	424065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017243	ATG	3	9	424111	424119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017243	A	6	6	425246	425251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017243	TATT	2	8	425259	425266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017243	T	6	6	425265	425270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017243	AAT	2	6	425271	425276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017243	T	6	6	425302	425307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017243	CCT	2	6	426025	426030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_017243	T	6	6	426032	426037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017243	AT	3	6	426056	426061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017243	AATT	2	8	426063	426070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017243	AAT	2	6	426073	426078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017243	T	7	7	426086	426092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017243	AAATT	2	10	426119	426128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017243	TA	3	6	426137	426142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017243	ATT	2	6	426143	426148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017243	ATTTT	2	10	426164	426173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017243	TAAG	2	8	426174	426181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017243	GCT	2	6	426188	426193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017243	TAT	2	6	426225	426230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017243	GCT	2	6	426278	426283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_017243	TAA	2	6	426302	426307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017243	TAT	2	6	426316	426321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017243	GCT	2	6	426369	426374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017243	AT	3	6	427371	427376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017243	AT	4	8	427394	427401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017243	TGTT	2	8	427414	427421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017243	TAA	2	6	427432	427437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017243	T	7	7	427502	427508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017243	A	6	6	427511	427516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017243	T	8	8	427528	427535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017243	ATA	2	6	427617	427622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017243	AAAAT	2	10	427636	427645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017243	TTA	2	6	428535	428540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017243	T	6	6	428588	428593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017243	TAATT	2	10	428597	428606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017243	T	7	7	428605	428611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017243	TAG	2	6	429487	429492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_017243	TGGG	2	8	430066	430073	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017243	TAA	2	6	430094	430099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017243	TAA	2	6	430103	430108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017243	A	6	6	430132	430137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017243	TA	3	6	430138	430143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017243	TAAA	2	8	430156	430163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017243	A	7	7	430166	430172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017243	T	6	6	430180	430185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017243	TCCC	2	8	430200	430207	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3081	NC_017243	TAA	2	6	430234	430239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017243	T	7	7	430240	430246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017243	T	6	6	430248	430253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017243	TAATT	2	10	430255	430264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017243	ACCC	2	8	430278	430285	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3086	NC_017243	ATTT	2	8	430289	430296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017243	A	6	6	430304	430309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017243	TAT	2	6	430310	430315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017243	CGCA	2	8	430319	430326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_017243	TA	3	6	430338	430343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017243	ATTA	2	8	430347	430354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017243	AAT	2	6	430363	430368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017243	TA	4	8	430372	430379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017243	TTAT	2	8	430399	430406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017243	TAA	2	6	430411	430416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017243	AATA	2	8	430423	430430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_017243	AAG	2	6	430789	430794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017243	TCA	2	6	430902	430907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3102	NC_017243	ATTT	2	8	430949	430956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017243	TTATT	2	10	430957	430966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017243	T	6	6	430982	430987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017243	T	8	8	431013	431020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017243	TAA	2	6	431036	431041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017243	TAAGG	2	10	431062	431071	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017243	GAA	2	6	431072	431077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017243	ATTT	2	8	432574	432581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017243	AATT	2	8	432585	432592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017243	TA	3	6	432649	432654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017243	ACTAT	2	10	432661	432670	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3113	NC_017243	T	7	7	432681	432687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017243	GGAAA	2	10	433469	433478	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_017243	A	7	7	433507	433513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017243	ATA	2	6	433540	433545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017243	TTA	2	6	433555	433560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017243	A	7	7	433563	433569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017243	TAA	2	6	433579	433584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017243	AAT	2	6	433586	433591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017243	GAT	2	6	433592	433597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017243	GCA	2	6	433607	433612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_017243	A	7	7	433627	433633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017243	A	6	6	433641	433646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017243	ATA	3	9	433651	433659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017243	ATA	2	6	433661	433666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017243	ATA	2	6	433697	433702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017243	ACA	4	12	433703	433714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_017243	ATA	2	6	433715	433720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017243	A	7	7	433727	433733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017243	TAAAAA	2	12	433782	433793	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017243	ATA	2	6	433802	433807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017243	AAAT	2	8	433830	433837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_017243	TTC	2	6	433848	433853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_017243	TAA	2	6	435828	435833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_017243	TAA	2	6	436032	436037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_017243	TAT	2	6	436063	436068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3141	NC_017243	AT	3	6	438258	438263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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