MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017243	A	6	6	1209554	1209559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017243	T	6	6	1209570	1209575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017243	A	6	6	1209578	1209583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017243	A	6	6	1209591	1209596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017243	AATTTT	2	12	1209638	1209649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017243	TTTTTA	2	12	1209657	1209668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017243	ATG	2	6	1209844	1209849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017243	AGT	2	6	1209911	1209916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017243	ATA	2	6	1209928	1209933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017243	T	7	7	1209934	1209940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017243	ATA	3	9	1210556	1210564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017243	AG	3	6	1210570	1210575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017243	A	8	8	1210608	1210615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017243	GAT	2	6	1210616	1210621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017243	T	6	6	1211418	1211423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017243	A	6	6	1211449	1211454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017243	TTA	2	6	1211460	1211465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017243	TAT	2	6	1211476	1211481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017243	AT	4	8	1212457	1212464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017243	T	7	7	1212885	1212891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017243	TCT	2	6	1212925	1212930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_017243	TTTAT	2	10	1214202	1214211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017243	TA	3	6	1214230	1214235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017243	T	7	7	1214241	1214247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017243	TA	3	6	1214253	1214258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8027	NC_017243	AT	3	6	1214270	1214275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017243	AT	4	8	1214282	1214289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017243	T	6	6	1215237	1215242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8032	NC_017243	TAT	2	6	1216804	1216809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017243	TA	3	6	1216812	1216817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017243	T	6	6	1216828	1216833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8038	NC_017243	TAA	2	6	1217702	1217707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017243	CAAAA	2	10	1217709	1217718	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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8041	NC_017243	T	6	6	1217732	1217737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8043	NC_017243	TAT	2	6	1220301	1220306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8045	NC_017243	A	7	7	1220319	1220325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8048	NC_017243	A	8	8	1221626	1221633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017243	T	6	6	1221662	1221667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017243	A	6	6	1221683	1221688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017243	T	6	6	1221694	1221699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8053	NC_017243	ATA	2	6	1221728	1221733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017243	ATT	2	6	1221756	1221761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017243	TTG	2	6	1221769	1221774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017243	AT	3	6	1221786	1221791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017243	ATATA	2	10	1221808	1221817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017243	TAT	2	6	1222710	1222715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017243	AT	3	6	1222718	1222723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017243	TAA	3	9	1222728	1222736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017243	TAT	2	6	1223629	1223634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017243	TAT	2	6	1223645	1223650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017243	ATTT	2	8	1224976	1224983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017243	AT	3	6	1225010	1225015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017243	TTA	2	6	1227197	1227202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017243	TTA	2	6	1227221	1227226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017243	TAAT	2	8	1227242	1227249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017243	AATA	2	8	1227252	1227259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8073	NC_017243	AAAT	2	8	1229270	1229277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8077	NC_017243	ATTA	2	8	1229511	1229518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8080	NC_017243	TAT	2	6	1229572	1229577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_017243	TA	3	6	1229586	1229591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8084	NC_017243	ATTA	2	8	1230569	1230576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8089	NC_017243	ATTT	2	8	1230658	1230665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8092	NC_017243	TAT	2	6	1232754	1232759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8094	NC_017243	AAAT	2	8	1232805	1232812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_017243	TAA	2	6	1232826	1232831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_017243	GTA	2	6	1232838	1232843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8101	NC_017243	TAATA	3	15	1232924	1232938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017243	TA	4	8	1233530	1233537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017243	TAA	2	6	1234906	1234911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8105	NC_017243	ATT	3	9	1235595	1235603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017243	TTTA	2	8	1235604	1235611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_017243	ATTT	2	8	1235617	1235624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_017243	TAA	2	6	1235635	1235640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017243	T	6	6	1235643	1235648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_017243	ATTTT	2	10	1235659	1235668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017243	T	6	6	1235665	1235670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017243	TAT	2	6	1235677	1235682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017243	AT	3	6	1235691	1235696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8118	NC_017243	A	6	6	1236319	1236324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017243	TAA	2	6	1236348	1236353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017243	T	6	6	1236360	1236365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_017243	GGT	2	6	1236416	1236421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8123	NC_017243	TAA	2	6	1238163	1238168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017243	T	6	6	1239219	1239224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_017243	ATA	2	6	1239228	1239233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017243	AAT	2	6	1239242	1239247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017243	ATTT	2	8	1240173	1240180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017243	TGA	2	6	1240188	1240193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8130	NC_017243	ATA	2	6	1241660	1241665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017243	TTG	2	6	1241670	1241675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_017243	T	6	6	1242901	1242906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_017243	CAG	2	6	1242950	1242955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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