MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017243	T	6	6	670428	670433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017243	TTA	2	6	670448	670453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017243	TAAAA	2	10	670477	670486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017243	TAAT	2	8	670488	670495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017243	AAT	3	9	670493	670501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017243	TA	3	6	672229	672234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017243	A	7	7	672240	672246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017243	AAT	2	6	672253	672258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017243	A	6	6	672262	672267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017243	ATATA	2	10	672286	672295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017243	T	7	7	672302	672308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017243	AAT	2	6	672309	672314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017243	TGA	2	6	672315	672320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017243	TTTA	2	8	672343	672350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017243	TA	3	6	673221	673226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017243	T	6	6	673250	673255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017243	GTT	2	6	673256	673261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017243	CGC	2	6	673270	673275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_017243	CAA	2	6	673411	673416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017243	A	6	6	673460	673465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017243	AT	3	6	673479	673484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017243	TA	3	6	673494	673499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017243	ATA	2	6	673507	673512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017243	TTA	2	6	674672	674677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017243	ATTT	2	8	674680	674687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017243	AATAT	2	10	674688	674697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017243	ATT	2	6	674989	674994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017243	ATA	3	9	676286	676294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017243	ATT	2	6	676336	676341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017243	T	6	6	676340	676345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017243	ATT	2	6	676352	676357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017243	ATTA	2	8	676363	676370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017243	ATA	2	6	676373	676378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017243	T	7	7	677558	677564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5038	NC_017243	TATTT	2	10	677618	677627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017243	ATTT	2	8	677639	677646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017243	TGC	2	6	677647	677652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5042	NC_017243	A	7	7	677704	677710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017243	A	6	6	677715	677720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017243	AT	3	6	677728	677733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017243	AAT	2	6	677763	677768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017243	ATA	2	6	677780	677785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017243	ACT	2	6	677824	677829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5051	NC_017243	T	6	6	681171	681176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5053	NC_017243	ATA	2	6	681208	681213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017243	TAGTTT	2	12	681226	681237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5056	NC_017243	T	7	7	681291	681297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017243	TAA	2	6	681312	681317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5059	NC_017243	T	7	7	681342	681348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017243	TAT	3	9	681395	681403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017243	TTA	2	6	681406	681411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017243	TAAT	2	8	682425	682432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017243	T	6	6	682463	682468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017243	T	7	7	682475	682481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017243	ATT	2	6	683880	683885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017243	TTA	2	6	683910	683915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017243	T	7	7	683933	683939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017243	A	6	6	683940	683945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5070	NC_017243	TA	3	6	683954	683959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017243	TTA	2	6	683960	683965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5074	NC_017243	AT	3	6	684012	684017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017243	T	6	6	684027	684032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_017243	AT	3	6	687435	687440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017243	TAAG	2	8	687448	687455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_017243	ATTAT	2	10	687487	687496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017243	TA	4	8	688152	688159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017243	TAA	2	6	688181	688186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017243	AT	3	6	688243	688248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017243	TA	3	6	688271	688276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017243	A	7	7	688283	688289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_017243	AAAAT	2	10	688349	688358	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017243	T	6	6	688364	688369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017243	TAT	2	6	688379	688384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017243	ATA	2	6	688390	688395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_017243	GAAA	2	8	688432	688439	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017243	A	7	7	688451	688457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017243	TAT	2	6	688468	688473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017243	GCA	2	6	690595	690600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5103	NC_017243	TAA	2	6	694875	694880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017243	TAT	2	6	694891	694896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017243	ATA	2	6	694902	694907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017243	ATT	2	6	694908	694913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017243	A	6	6	694914	694919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017243	T	7	7	694924	694930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017243	AT	3	6	694931	694936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017243	TA	5	10	694944	694953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017243	ATT	2	6	697490	697495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017243	T	6	6	697521	697526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017243	TA	3	6	697533	697538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017243	T	6	6	698126	698131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017243	TTAC	2	8	698138	698145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_017243	T	6	6	698171	698176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017243	TA	3	6	698194	698199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017243	TA	3	6	698221	698226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017243	AAT	2	6	698227	698232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017243	T	7	7	698240	698246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017243	TA	3	6	698254	698259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017243	AAT	2	6	698268	698273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017243	ATG	2	6	698284	698289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_017243	TTA	2	6	698344	698349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017243	TAG	2	6	698361	698366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017243	AT	4	8	698386	698393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017243	A	6	6	698459	698464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017243	TATG	2	8	698467	698474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017243	CATA	2	8	698486	698493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_017243	TAT	2	6	698496	698501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017243	TAA	2	6	698505	698510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017243	TCC	2	6	700968	700973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_017243	AT	3	6	700985	700990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_017243	ATT	2	6	701020	701025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_017243	A	7	7	701034	701040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_017243	TA	3	6	701054	701059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_017243	A	8	8	701059	701066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_017243	TTA	3	9	701086	701094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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