MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017243	TA	3	6	604045	604050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017243	ATT	2	6	604051	604056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017243	T	6	6	604063	604068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017243	A	7	7	604102	604108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_017243	TAC	2	6	604115	604120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017243	TAA	2	6	604125	604130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017243	AT	3	6	604138	604143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_017243	CAA	2	6	604225	604230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_017243	ATA	2	6	604262	604267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017243	TAAAT	2	10	604310	604319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017243	T	6	6	604323	604328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017243	ATA	2	6	604335	604340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017243	TA	3	6	604339	604344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017243	TA	3	6	604349	604354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_017243	TATAG	2	10	604381	604390	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017243	AGT	2	6	604409	604414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017243	TTA	2	6	604422	604427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017243	A	6	6	604451	604456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017243	A	8	8	607248	607255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017243	T	6	6	607326	607331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017243	TAT	2	6	607346	607351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017243	ATT	2	6	607365	607370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017243	A	7	7	607371	607377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017243	GGC	2	6	607384	607389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4527	NC_017243	TAT	3	9	607418	607426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4530	NC_017243	ATT	2	6	610329	610334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017243	ATT	2	6	610337	610342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017243	TA	3	6	610349	610354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017243	ATG	2	6	610370	610375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017243	TA	3	6	610383	610388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017243	CCA	2	6	610415	610420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4539	NC_017243	AT	3	6	610555	610560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017243	AATC	2	8	610595	610602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_017243	ATT	2	6	610649	610654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017243	TA	3	6	610655	610660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017243	AT	3	6	610700	610705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017243	GGA	2	6	610707	610712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4550	NC_017243	TA	3	6	611199	611204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017243	TAA	2	6	611233	611238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017243	A	7	7	611237	611243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017243	ATG	2	6	611267	611272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017243	A	7	7	611274	611280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017243	GTG	2	6	611301	611306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017243	TAA	2	6	611343	611348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4559	NC_017243	A	9	9	611435	611443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4562	NC_017243	TAA	2	6	611524	611529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017243	T	6	6	611540	611545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017243	A	7	7	611553	611559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017243	AT	3	6	611561	611566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017243	TAA	3	9	611568	611576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4568	NC_017243	A	6	6	611608	611613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017243	AGA	2	6	611662	611667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4580	NC_017243	ATA	3	9	611823	611831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4582	NC_017243	TTA	2	6	611872	611877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017243	TTAT	2	8	611962	611969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_017243	T	6	6	611969	611974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017243	A	6	6	612005	612010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4587	NC_017243	T	6	6	612034	612039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017243	ATATA	2	10	612061	612070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017243	AT	3	6	612078	612083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017243	AT	5	10	612166	612175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017243	ATA	2	6	612216	612221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017243	A	7	7	612232	612238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017243	GATA	2	8	612240	612247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017243	AT	3	6	612254	612259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_017243	AT	3	6	612270	612275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_017243	TAT	3	9	612273	612281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4598	NC_017243	A	6	6	612300	612305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017243	AT	3	6	612311	612316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017243	TAT	2	6	612338	612343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_017243	A	6	6	612351	612356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017243	A	6	6	612359	612364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_017243	A	6	6	612375	612380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017243	A	6	6	612413	612418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017243	ATATTG	2	12	612440	612451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017243	A	7	7	612452	612458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4609	NC_017243	GAA	2	6	612526	612531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017243	A	7	7	612564	612570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017243	ATA	2	6	612601	612606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017243	CTT	2	6	612620	612625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4619	NC_017243	TAA	2	6	612777	612782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017243	A	6	6	612786	612791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017243	TAT	2	6	612820	612825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017243	TCT	2	6	612853	612858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_017243	AT	3	6	612883	612888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017243	AGA	2	6	612906	612911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_017243	AAT	2	6	612924	612929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_017243	T	7	7	612929	612935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_017243	AAATT	2	10	612952	612961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_017243	A	7	7	613029	613035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_017243	TA	4	8	613036	613043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_017243	TAA	2	6	613079	613084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_017243	A	6	6	613083	613088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_017243	GGA	2	6	613093	613098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_017243	A	6	6	613104	613109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_017243	TA	3	6	613117	613122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_017243	A	6	6	613130	613135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_017243	TA	3	6	613164	613169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_017243	TAA	2	6	613182	613187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_017243	A	6	6	613186	613191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4639	NC_017243	TGT	2	6	613198	613203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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